BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	AE015451_phaM1	4,741,289	C→G	intergenic (+526/+227)	gltA CDS (citrate synthase) → / ← yeiW CDS (putative oxidoreductase)	–/–

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*	AE015451_phaM1	4,741,289	0	C	G	100.0%	401.4 / NA	101	intergenic (+526/+227)	gltA CDS (citrate synthase)/yeiW CDS (putative oxidoreductase)	–/–
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (50/51); total (50/51)

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                   tCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑ATTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAg       <  1:295373/137‑1 (MQ=255)

                   tCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑ATTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAg       >  1:5914352/1‑137 (MQ=255)

                   tCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑ATTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAg       <  1:14880049/137‑1 (MQ=255)

                   tCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑ATTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAg       <  1:16189507/137‑1 (MQ=255)

                   tCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑ATTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAg       <  1:3317743/137‑1 (MQ=255)

                   tCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑ATTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAg       <  1:4454977/137‑1 (MQ=255)

                   tCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑ATTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTCGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAg       >  2:1348248/1‑137 (MQ=255)

                   tCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑AGTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAg       <  2:3646079/137‑1 (MQ=255)

                   tCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CA‑GCTTC‑TGCGACTTGC‑ATTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAg       <  2:14943491/137‑1 (MQ=255)

                     cAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑ATTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGc     <  2:2441432/137‑1 (MQ=255)

                     cAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑ATTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGc     <  1:3064975/137‑1 (MQ=255)

                     cAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑ATTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGc     <  1:10647380/137‑1 (MQ=255)

                     cAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑ATTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGc     <  1:6230617/137‑1 (MQ=255)

                     cAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑ATTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGc     <  2:7620615/137‑1 (MQ=255)

                     cAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑ATTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGc     <  1:12833406/137‑1 (MQ=255)

                     cAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑ATTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGc     <  1:18217778/137‑1 (MQ=255)

                     cAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑ATTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGc     <  2:3744746/137‑1 (MQ=255)

                     cAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑ATTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGc     <  1:16142502/137‑1 (MQ=255)

                     cAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑ATTCGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGc     <  2:13984361/137‑1 (MQ=255)

                     cAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑CA‑GCTTC‑TGCGACTTGC‑ATTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGc     <  2:16779243/137‑1 (MQ=255)

                     cAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTGGAG‑CA‑GCTTC‑TGCGAC‑TTGCATTCGTGAATCCATGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCTACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGc     <  2:16779244/137‑1 (MQ=255)

                     cAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTCGAG‑CA‑GCTTC‑TGCGAC‑TTGCAGTCGTGAA‑TCCAGGCACAGGCCCCGGACACATCCTCCTACAGCGCCTCGACCTTTGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGc     <  2:13984410/137‑1 (MQ=255)

                        ctctGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑ATTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCtt  >  2:9016670/1‑137 (MQ=255)

                        ctctGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑ATTCGTGAATCCAGGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGAGGTAGGCCtt  >  2:13127613/1‑137 (MQ=255)

                        ctctGGTCACCTTCGTGCTTGAGCAG‑CTTCT‑GCGACT‑TGC‑ATTCGTGAATCCAAGC‑ACAGGCCCCGGACACGTCCTCCTGCAGCGCCTCGACCTTGGCCCGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACTGCGATAGGTCtt  >  2:11831596/1‑137 (MQ=255)

GTATTGAACTGGGTATAGGTCCAGCTCTGGTCACCTTCGTGCTTGAG‑AA‑CCTCC‑GCCAAC‑TGCAATTCGTGAA‑CCAAGCAAAAGGCCCCGAAAAGGCCCTCC‑GCAGCCCCCCCAACCTGGCCAGCGGCGCCTTGATCACGGTCACACCGCGATAGGCCTT  >  AE015451_phaM1/4741182‑4741341

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 24 ≤` `ATCG/ATCG` `< 40 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`