| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_012967 | 2322337 = | 5 (0.100) | 36 (0.740) | 29/156 | 0.5 | 88.2% | coding (139/963 nt) | menC | o‑succinylbenzoate synthase |
| ? | NC_012967 | 2772857 = | NA (NA) | intergenic (+378/‑54) | iap/ECB_RS13760 | alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase/IS4‑like element IS421 family transposase | |||||
GCGCGACAGGCGGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_012967/2322419‑2322337‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCA > NC_012967/2772857‑2772937 GCGCTACAGGCGGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCC > 1:915735/1‑82 GCGACAGGCGGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCA < 1:112016/82‑1 CAGGCGGTTAAAATCCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAG < 1:1994844/82‑1 GCGGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGC < 1:4317725/82‑1 AAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAA < 1:882960/82‑1 GCTGTATGTTTGCTTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATT < 1:13624/82‑1 CTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTA < 1:3704377/82‑1 CTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTA < 1:3704375/82‑1 TGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:4313411/82‑1 GTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACG < 1:3160066/82‑1 GTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACG > 1:2746776/1‑82 GTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACG > 1:2734825/1‑82 TGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCT > 1:830460/1‑82 TGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATA < 1:449302/82‑1 TGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATA > 1:2201865/1‑82 CCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATa > 1:2614787/1‑81 TGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAA < 1:4122830/82‑1 AGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGT > 1:125437/1‑82 CGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCC < 1:4041093/82‑1 GAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCG < 1:1654229/82‑1 AGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGA > 1:3255531/1‑82 CGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATG < 1:1330957/82‑1 CGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATG < 1:1330959/82‑1 GCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGA < 1:2814818/82‑1 CGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAA > 1:2654399/1‑82 GGTGGGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACT > 1:2483141/1‑82 GGGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCA > 1:761761/1‑82 GGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCAC > 1:3035727/1‑82 GGGGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCAC < 1:1591936/82‑1 GGAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGA < 1:3980357/82‑1 GAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGAT < 1:1874738/82‑1 GAGATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGAT > 1:270506/1‑82 cagTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAAC < 1:921805/79‑1 ATCTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAAC > 1:982236/1‑82 gTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG < 1:3310226/81‑1 agtCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG < 1:3963713/79‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGG < 1:17197/82‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGG > 1:2263857/1‑82 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGT > 1:916117/1‑82 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGT > 1:1247602/1‑82 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGT < 1:2503937/82‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGT < 1:2111965/82‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGT > 1:1694663/1‑82 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTC < 1:488298/82‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTC < 1:574907/82‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTC < 1:587989/82‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTC < 1:3191459/82‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTC > 1:3093121/1‑82 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTC < 1:2546617/82‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCA > 1:3947092/1‑82 GCGCGACAGGCGGTTAAAAACCCGCGACGGGCTGTATGTTTGCCTGCGTGAAGGCGAGCGCGAAGGGTGGGGGGAGATCTCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_012967/2322419‑2322337‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCA > NC_012967/2772857‑2772937 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |