New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 1535168 | 59 (1.180) | 3 (0.060) | 3/320 | NT | 5.1% | coding (177/1218 nt) | argJ | Glutamate N‑acetyltransferase/Amino‑acid acetyltransferase |
? | AE015451 | = 1535239 | 56 (1.180) | coding (248/1218 nt) | argJ | Glutamate N‑acetyltransferase/Amino‑acid acetyltransferase |
GGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTACCGGCCGAGTCGGTACTGCCGTTCTCCACCGGCGTGATTGGCGAGCCGCTGCCGGTCGAAAAGATCGAAGGCGCGCTGCAGGCCGCCCTC > AE015451/1534938‑1535396 | ggggTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGa < 2:815908/232‑1 (MQ=255) gTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTc < 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tcGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTg > 2:647726/1‑233 (MQ=255) gTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGcctgtctctta > 1:706458/1‑225 (MQ=255) aGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGAc > 1:497586/1‑236 (MQ=255) tAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAggc > 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cgcCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTAcc < 1:821813/236‑1 (MQ=255) cgcCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTAcc < 1:231219/236‑1 (MQ=255) cGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCGGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGcaccggcgccgcgcagaaggcgttgagggtgaacacgccagccacgctggagccttcg > 2:793618‑M2/1‑163 (MQ=255) 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2:51123/1‑135 (MQ=255) ccTTCTGCGCGGCGCCGGTGAGCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACGGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGc < 2:47018/138‑1 (MQ=255) tCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGcaccggcgccgcgaagaaggcgttgagggtgaacacgccagccacgctggagccttcgg > 1:67002‑M2/1‑88 (MQ=255) cTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCACGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTACCGGCCCAGTCGGTACTGCCGTTCTCCACCGGCGTGATTGGCGAGCCGCTGCCGGTc < 1:382014/211‑1 (MQ=255) tGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTACCGGCCGAGTCGGTACTGCCGTTCTCCACCGGCGTGATTGGCGAGCCGCTGCCGGTCGAAAAGATCGAAGGCGCGCTGc > 1:25227/1‑232 (MQ=255) tGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTACCGGCCGAGTCGGTACTGCCG‑TCTCCACCGGCGTGATTGGCGAGCCGCTGCCGGTCGAAAAGATCGAAGGCGCGCTGCAGgc > 1:872209/1‑235 (MQ=255) tGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTACCCGCCGAGTCGGTACTGCCGGTCTCCCCCGGCGt > 2:162531/1‑188 (MQ=255) tGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGGGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTACCGGCCGAGTCGGTACTGCCGTTCTCCACCGGCGTGATTGGCGAGCCGCTGCCGGTCGAAAAGATCGAAGGCGCGCTGc < 2:25227/232‑1 (MQ=255) cgcgGCGCCGGTGccggcgttggcgttacccgtgttggtcagcaggtagcgcacggtgccctgtacacgctgtttggacaggatcaccggcgccgcgcagaaggcgttgagggtgaacacgccagccacgctggagccttcggcacagcgcatgaccaccacatccttgcgccccgggcgcttgataccggcagaagc > 2:678354‑M1/1‑13 (MQ=255) gcggcgCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTACCGGCCGAGTCGGTACTGCCGTTCTCCACCGGCGTGATTGGCGAGCCGCTGCCGGTCGAAAAGATCGAAGGCGCGCTGCAGgc < 2:820599/233‑1 (MQ=255) cggcgCCGGTGccggcgttggcgttacccgtgttggtcagcaggtagcgcacggtgccctgtacacgctgtttggacaggatcaccggcgccgcgcagaaggcgttgagggtgaacacgccagccacgctggagccttcggcacagcgcatgaccaccacatccttgcgccccgggcgcttgataccggcagaagcgataccgagttca > 1:682811‑M1/1‑11 (MQ=255) cgcCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTACCGGCCGAGTCGGTACTGCCGTTCTCCACCGGCGTGATTGGCGAGCCGCTGCCGGTCGAAAAGATCGAAGGCGCGCTGCAGGCCGCCCTc < 1:856359/236‑1 (MQ=255) gTGccggcgttggcgttacccgtgttggtcagcaggtagcgcacggtgccctgta < 2:467341‑M1/55‑53 (MQ=255) | GGGGTGCGAAGCGGCCCCTTTTTCGACATCATCGTTTTTTCTAGGAGCGCTCTAATGGCTGTTGGTCTTGGTCCTTTGCCCACCCTGCACCCGGTTCCGGGTTTTGAACTCGGTATCGCTTCTGCCGGTATCAAGCGCCCGGGGCGCAAGGATGTGGTGGTCATGCGCTGTGCCGAAGGCTCCAGCGTGGCTGGCGTGTTCACCCTCAACGCCTTCTGCGCGGCGCCGGTGATCCTGTCCAAACAGCGTGTACAGGGCACCGTGCGCTACCTGCTGACCAACACGGGTAACGCCAACGCCGGCACCGGCGCGCCAGGCCTGGCCGCCGCCGAGCGCACCTGCGCCAAGCTGGCCGAACTGGCTGGCGTACCGGCCGAGTCGGTACTGCCGTTCTCCACCGGCGTGATTGGCGAGCCGCTGCCGGTCGAAAAGATCGAAGGCGCGCTGCAGGCCGCCCTC > AE015451/1534938‑1535396 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |