New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 5202880 | 59 (1.180) | 7 (0.150) | 6/320 | NT | 11.8% | coding (1187/2043 nt) | PP_4583 | putative Peptidase |
? | AE015451 | = 5202955 | 49 (1.030) | coding (1262/2043 nt) | PP_4583 | putative Peptidase |
GTCATGCTCGAAGGCCTCAGCCTGAACGCCGGTGCCCTCACCCTGAGCCTGCGCGAAGGCGGCCTGCCGATCATCGAAGTCCGCCCGCAGGGCTTGCCGGCCTACCGCGTCGAACTGCCAGACGCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGCCGATGACTATGTCAGTGAGCGCCTGTGGGCAACCGCAGCGGACGGCACCCTGGTGCCGATCAGCCTGGTACGCCGCCGCCAGGACCTGGGCAAGACCGTGCCACTGTACCTGTACGGCTATGGTGCCTATGGCGAAAGCCTCGACCCCTGGTTCTCACATGCG > AE015451/5202645‑5203094 | ggcatGCTCGAAGGCCTCAGCCTGAACGCCGGTGCCCTCACCCTGAGCCTGCGCGAAGGCGGCCTGCCGATCATCGAAGTCCGCCCGCAGGGCTTGCCGGCCTACCGCGTCGAACTGCCAGACGCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGAAAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCAC < 1:515380‑M1/234‑1 (MQ=255) aGCCTGAACGCCGGTGCCCTCACCCTGAGCCTGCGCGAAGGCGGCCTGCCGATCATCGAAGTCCGCCCGCAGGGCTTGCCGGCCTACCGCGTCGAACTGCCAGACGCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCt > 1:353471/1‑236 (MQ=255) gAACGCCGGTGCCCTCACCCTGAGCCTGCGCGAAGGCGGCCTGCCGATCATCGAAGTCCGCCCGCAGGGCTTGCCGGCCTACCGCGTCGAACTGCCAGACGCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCaa < 2:866178/234‑1 (MQ=255) cccTCACCCTGAGCCTGCGCGAAGGCGGCCTGCCGATCATCGAAGTCCGCCCGCAGGGCTTGCCGGCCTACCGCGTCGAACTGCCAGACGCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGt < 1:440496/235‑1 (MQ=255) ccTCACCCTGAGCCTGCGCGAAGGCGGCCTGCCGATCATCGAAGTCCGCCCGCAGGGCTTGCCGGCCTACCGCGTCGAACTGCCAGACGCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGt < 2:353468/234‑1 (MQ=255) aGCCTGCGCGAAGGCGGCCTGCCGATCTTCGAAGTCCGCCCGCAGGGCTTGCCGGCCTACCGCGTCGAACTGCCAGACGCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCAtt < 1:116257/236‑1 (MQ=255) gcgAAGGCGGCCTGCCGATCATCGAAGTCCGCCCGCAGGGCTTGCCGGCCTACCGCGTCGAACTGCCAGACGCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGcc > 1:861970/1‑236 (MQ=255) cgAAGGCGGCCTGCCGATCATCGAAGTCCGCCCGCAGGGCTTGCCGGCCTACCGCGTCGAACTGCCAGACGCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGcc < 1:12169/235‑1 (MQ=255) cgAAGGCGGCCTGCCGATCATCGAAGTCCGCCCGCAGGGCTTGCCGGCCTACCGCGTCGAACTGCCAGACGCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGcc < 1:167539/235‑1 (MQ=255) gAAGGCGGCCTGCCGATCATCGAAGTCCGCCCGCAGGGCTTGCCGGCCTACCGCGTCGAACTGCCAGACGCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCCCGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCAtt > 1:22372/1‑227 (MQ=255) gAAGGCGGCCTGCCGATCATCGAAGTCCGCCCGCAGGGCTTGCCGGCCTACCGCGTCGAACTGCCAGACGCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCg > 2:652798/1‑220 (MQ=255) gAAGGCGGCCTGCCGATCATCGAAGTCCGCCCGCAGGGCTTGCCGGCCTACCGCGTCGAACTGCCAGACGCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGCCg > 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gAAGTCCGCCCGCAGGGCTTGCCGGCCTACCGCGTCGAACTGCCAGACGCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCGGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGCCGATGACTATGTCAGTGAGCGCCt < 1:666674/236‑1 (MQ=255) aaGTCCGCCCGCAGGGCTTGCCGGCCTACCGCGTCGAACTGCCAGACGCGGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATg < 2:281456/210‑1 (MQ=255) gcAGGGCTTGCCGGCCTACCGCGTCGAACTGCCAGACGCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAg > 2:753329/1‑172 (MQ=255) gcgtGCCGGCCTACCGCGTCGAACTGCCAGACCCAGCCCACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGCCGATGACTATGTCAGt < 2:820126/209‑1 (MQ=255) cTTGCCGGCCTACCGCGTCGAACTGCCAGACGCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGCCGATGACt < 1:171118/203‑1 (MQ=255) ttGCCGGCCTACCGCGTCGAACTGCCAGACGCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGCCGATGACTATGTCAGTGAGCGCCTGTGGGCAACCGCAGCGGa < 1:81121/236‑1 (MQ=255) caCCGCGTCGAACTGCCAGACGCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGCCGATGACTATGTCAGTGAGCGCCt < 2:743532/208‑1 (MQ=255) ccGAACTGCCAGACGCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGCCGATGACTATGTCAGTGAGCGCCTGTGGGCAACCGCAGCGGACGGCACCCTGGTGcc < 2:861967/234‑1 (MQ=255) gCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGCCGATGACTATGTCAGTGAGCGCCTGTGGGCAACCGCAGCGGACGGCACCCTGGTGCCGATCAGCCTGGTAcg < 1:598149/236‑1 (MQ=255) ccTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGCCGATGACTATGTCAGTGAGCGCCTGTGGGCAACCGCAGCGGACGGCACCCTGGTGCCGATCAGCCTGGTAcg < 1:75586/232‑1 (MQ=255) cTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCGCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGCCGATGACTATGTCAGTGAGCGCCTGTGGGCAACCGCAGCGGACGGCACCCTGGTGCCGATCAGCCTGGTAcgccgcc < 1:104008/236‑1 (MQ=255) 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gCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGCCGATGACTATGTCAGTGAGCGCCTGTGGGCAACCGCAGCGGACGGCACCCTGGTGCCGATCAGCCTGGTACGCCGCCGCCAGGACCTGGGCAAGACCGTGCCACTGTACCTGTACGGCt < 2:332815/234‑1 (MQ=255) cGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGCCGATGACTATGTCAGTGAGCGCCTGTGGGCAACCGCAGCGGACGGCACCCTGGTGCCGATCAGCCTGGTACGCCGCCGCCAg < 2:787117/192‑1 (MQ=255) gCTTGCGCTACGAAGCGCTCCACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCACGCAACCCCCGGTGCGCGGTGCATTCGATGCCGATGACTATGTCAGTGAGCGCCTgtgggcaacgtcagttggcgcacctgggccgggcggttgagcgcttcgtagcgcaa > 1:726013‑M2/1‑133 (MQ=255) ttGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACaggcgctcactgacatagtcatcggcatcgaatgcaccgcgcaccgggggttgcgtgagcaccacctgggcgcccgtgggcaacgtcagttggcgcacctgggccgggcggtggagcgcttcgtagcgcaagc > 1:726013‑M1/1‑56 (MQ=255) cTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACaggcgctcactgacatagtcatcggcatcgaatgcaccgagcaccggggtttgcttgagcaccacctgggcgc > 1:386542‑M1/1‑51 (MQ=255) cTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGCCGATGACTATGTCAGTGAGCGCCTGTGGGCAACCGCAGCGGACGGCACCCTGGTGCCGATCAGCCTGGTACGCCGCCGCCAGGACCTGGGCAAGACCGTGCCActgtacctgtac > 2:340789/1‑217 (MQ=255) cTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGCCGATGACTATGTCAGTGAGCGCCTGTGGGCAACCGCAGCGGACGGCACCCTGGTGCCGATCAGCCTGGTACGCCGCCGCCAGGACCTGGGCAAGACCGTGCCACTGTACCTGTACGGCTATGGTGCCTATgcc > 1:213124/1‑233 (MQ=255) cTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGCCGATGACTATGTCAGTGAGCGCCTGTGGGCAACCGCAGCGGACGGCACCCTGGTGCCGATCAGCCTGGTACGCCGCCGCCAGGACCTGGGCAAGACCGTGCCACTGTACCTGTACGGCTATGGTGCCTATGGc > 1:906091/1‑235 (MQ=255) cTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGCGCGCCAACTGACGTTGCCCACaggcgctcactgacatagtcatcggcatcgaacgcaccgcgcaccggggtttgc > 2:142630‑M1/1‑51 (MQ=255) aGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACaggcgctcactgacatagtcatcggcatcgaatgcaccgagcaccggggtttgcttgagcaccacctgggcgcccgtgggcaacgtcagttggcgcacctgggccgggcggttgggcgcttcgtagcgcaagcgtatgcga > 1:593090‑M1/1‑45 (MQ=255) tCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGCCGATGACTATGTCAGTGAGCGCCTGTGGGCAACCGCAGCGGACGGCACCCTGGTGCCGATCAGCCTGGTACGCCGCCGCCAGGACCTGGGCAAGACCGTGCCACTGTACCTGTACGGCTATGGTGCCTATGGCGAAAGCCTCGAc < 1:302188/236‑1 (MQ=255) tCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGCGGTGCCCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGCGCATTCGATGCCGATGACTATGTCAGt > 2:87546/1‑107 (MQ=255) tGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGCCGATGACTATGTCAGTGAGCGCCTGTGGGCAACCGCAGCGGACGGCACCCTGGTGCCGATCAGCCTGGTACGCCGCCGCCAGGACCTGGGCAAGACCGTGCCACTGTACCTGTACGGCTATGGTGCCTATGGCGAAAGCCTCGACCCCTGGTTCTCACATgcg > 1:106675/1‑236 (MQ=255) gcCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGCCGATGACTATGTCAGTGAGCGCCTGTGGGCAACCGCAGCGGACGGCACCCTGGTGCCGATCAGCCTGGTAcgccgcc < 2:632144/147‑1 (MQ=255) | GTCATGCTCGAAGGCCTCAGCCTGAACGCCGGTGCCCTCACCCTGAGCCTGCGCGAAGGCGGCCTGCCGATCATCGAAGTCCGCCCGCAGGGCTTGCCGGCCTACCGCGTCGAACTGCCAGACGCAGCCTACAGCCTGTACGTGCAGGACAGCCTTGAATTTGCCAGCACTCGCATACGCTTGCGCTACGAAGCGCTCAACCGCCCGGCCCAGGTGCGCCAACTGACGTTGCCCACGGGCGCCCAGGTGGTGCTCAAGCAAACCCCGGTGCTCGGTGCATTCGATGCCGATGACTATGTCAGTGAGCGCCTGTGGGCAACCGCAGCGGACGGCACCCTGGTGCCGATCAGCCTGGTACGCCGCCGCCAGGACCTGGGCAAGACCGTGCCACTGTACCTGTACGGCTATGGTGCCTATGGCGAAAGCCTCGACCCCTGGTTCTCACATGCG > AE015451/5202645‑5203094 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |