| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | AE015451 | 3,782,598 | G→C | 6.7% | A179P (GCC→CCC) | nikC → | nickel ABC transporter permease subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AE015451 | 3,782,598 | 0 | G | C | 6.7% | 202.2 / 2.7 | 60 | A179P (GCC→CCC) | nikC | nickel ABC transporter permease subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (26/30); new base C (2/2); total (28/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.18e-01 | |||||||||||
TTCGTAGGCGGGCGCACCGACCTGCTGCTGATGCGCCTGTGCGACATGTTCATGACCTTCCCCACGCTGGTACTGGCATTTTTCTTCGTCACCTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGAT > AE015451/3782376‑3782830 | ttCGTAGGCGGGCGCACCGACCTGCTGCTGATGCGCCTGTGCGACATGTTCATGACCTTCCCCACGCTGGTACTGGCATTTTTCTTCGTCACCTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTc > 2:833799/1‑233 (MQ=255) gcccTGCTGCTGATGCGCCTGTGCGACATGTTCAGGACCTGCCACACGCTGGTACTGGCATTTTTCTTCGTCACCTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGTGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGgcg < 2:301947/223‑1 (MQ=255) ctgctgctgATGCGCCTGTGCGACATGTTCATGACCTTCCCCACGCTGGTACTGGCATTTTTCTTCGTCACCTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGc < 1:833802/235‑1 (MQ=255) tgATGCGCCTGTGCGACATGTTCATGACCTTCCCCACGCTGGTACTGGCATTTTTCTTCGTCACCTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGtgctg > 1:920339/1‑236 (MQ=255) tgtgCGACATGTTCATGCCCTTCCCCACGCTGGTACTGGCATTTTTCTTCGTCCCCTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATc < 1:214348/236‑1 (MQ=255) gCGACATGTTCATGACCTTCCCCACGCTGGTACTGGCATTTTTCTTCGTCACCTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGcc < 1:46787/213‑1 (MQ=255) aCCTTCCCCACGCTGGTACTGGCATTTTTCTTCGTCACCTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCg < 2:702349/223‑1 (MQ=255) tttCCCCACGCTGGTACTGGCATTTTTCTTCGTCACCTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCAGGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTtg < 1:195888/228‑1 (MQ=255) cTTCCCCACGCTGGTACTGGCATTTTTCTTCGTCACCTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTtgctggtg > 1:79744/1‑235 (MQ=255) gCTGGTACTGGCATTTTTCTTCGTCACCTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTtgctggt < 1:42923/225‑1 (MQ=255) cTGGTACTGGCATTTTTCTTCGTCACCTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGgcg < 2:524385/177‑1 (MQ=255) ggTACTGGCATTTTTCTTCGTCACCTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAat > 1:704922/1‑202 (MQ=255) cTGGCATTTTTCTTCGTCACCTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTgcgc > 1:124382/1‑180 (MQ=255) cTGGCATTTTTCTTCGTCACCTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTTCTTCCCa > 1:19033/1‑196 (MQ=255) ttttCTTCGTCACCTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGcc < 2:329148/234‑1 (MQ=255) ttttCTGCGTCACCTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCa < 2:837056/155‑1 (MQ=255) ttcGTCACCTTGCTGTGCACTGGCCTGAGCACCGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCt < 2:252541/164‑1 (MQ=255) cACCTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTg > 1:928284/1‑150 (MQ=255) cACCTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTg < 2:928281/150‑1 (MQ=255) cTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCACTATCGCCGGCCCGTtgctgg > 2:281300/1‑197 (MQ=255) ggCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCAc > 1:777773/1‑136 (MQ=255) aCTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGcc > 1:849172/1‑235 (MQ=255) cTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGtt < 1:933663/236‑1 (MQ=255) tGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGgcg > 1:515893/1‑120 (MQ=255) tGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGgcg < 2:515890/120‑1 (MQ=255) aaCGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTgg > 1:524645/1‑236 (MQ=255) gATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCAt > 2:669500/1‑139 (MQ=255) gATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCAt < 1:669503/139‑1 (MQ=255) gATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCaa < 1:866123/179‑1 (MQ=255) gATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCaa > 2:866120/1‑179 (MQ=255) gATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGCCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACatgat > 2:341075/1‑201 (MQ=255) ccatcgccCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCa < 2:365966/174‑1 (MQ=255) tcgccCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGtt < 1:470473/214‑1 (MQ=255) ccTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGcccc < 2:849169/233‑1 (MQ=255) ccACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCg < 2:558838/215‑1 (MQ=255) ggggCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCcaca < 1:201976/171‑1 (MQ=255) gggCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTc > 1:625536/1‑209 (MQ=255) ggCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGcc < 1:802189/219‑1 (MQ=255) ggCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATggg > 1:611223/1‑236 (MQ=255) ggTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGt > 1:69397/1‑208 (MQ=255) gTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGtg < 1:69828/235‑1 (MQ=255) tGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGtcca > 2:16025/1‑175 (MQ=255) cATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTggc > 1:271234/1‑178 (MQ=255) ggTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAacgacg > 1:476154/1‑236 (MQ=255) gCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGcccc < 2:799243/195‑1 (MQ=255) gTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGCCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACAt > 1:290023/1‑131 (MQ=255) gATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCcaca > 2:201915/1‑137 (MQ=255) gATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCCGCCCCATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGGCATCGGCCACATGATGCTGCa > 2:171779/1‑147 (MQ=255) aTTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCAGCCTGTCGTTCCTTGCCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCaa > 1:892485/1‑215 (MQ=255) aTTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGCCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTg < 1:341078/236‑1 (MQ=255) aTTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATGGGCGTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTg < 1:73801/236‑1 (MQ=255) gCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGtct < 1:859274/148‑1 (MQ=255) cgAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTtgctggtgct > 1:848740/1‑96 (MQ=255) cgAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTtgctggtgct < 2:848737/96‑1 (MQ=255) aCGTATTGGCTTCACGCCTGCCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTcc < 2:290020/131‑1 (MQ=255) cGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTtgctggtgc < 2:161197/76‑1 (MQ=255) gCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAg < 2:844504/188‑1 (MQ=255) ccTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAActgctgctg > 2:586158/1‑220 (MQ=255) ccTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCtgat > 2:400787/1‑234 (MQ=255) cTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTgatgat < 1:400790/236‑1 (MQ=255) | TTCGTAGGCGGGCGCACCGACCTGCTGCTGATGCGCCTGTGCGACATGTTCATGACCTTCCCCACGCTGGTACTGGCATTTTTCTTCGTCACCTTGCTGGGCACTGGCCTGAGCAACGTGATCATCGCCATCGCCCTGTCCCACTGGGCCTGGTATGCGCGCATGGTGCGCGGCCTGGTGATTGCCCAGCGCGGCCGCGAATACGTATTGGCTTCACGCCTGGCCGGCGCTTCACGCTGGGCGCGGCTGCGCCAGCATGTGCTGCCCAATATCGCCGGCCCGTTGCTGGTGCTGGCAACCATGGACATCGGCCACATGATGCTGCACGTCTCCGGCCTGTCGTTCCTTGGCCTCGGGGTGGCGCCCCCCACCGCCGAATGGGGCGTGATGATCAACGACGCCAAGGAATTCATCTGGACGCAGCCACAACTGCTGCTGTTGCCAGGGCTGATGAT > AE015451/3782376‑3782830 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |