Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | AE015451 | 212,134 | T→C | 10.1% | D5880D (GAT→GAC) | PP_0168 → | putative surface adhesion protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AE015451 | 212,134 | 0 | T | C | 10.1% | 153.8 / 5.9 | 56 | D5880D (GAT→GAC) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/22); new base C (2/4); total (30/26) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.01e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.57e-01 |
GAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATTAACAACC > AE015451/211907‑212348 | gaGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCa < 1:565383/236‑1 (MQ=40) ccGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCa < 2:13986/229‑1 (MQ=34) cggTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCAAGATCAGCCTGGGATTCAACTcggcggag > 2:270627/2‑231 (MQ=11) cAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTg > 2:180139/1‑189 (MQ=33) cAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTC‑‑GACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGt > 2:371046/1‑190 (MQ=18) gaACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCgg < 1:866118/236‑1 (MQ=34) aaCCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAGACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTg < 2:300730/172‑1 (MQ=18) aaCCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTg > 2:938002/1‑169 (MQ=34) aaCCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTg < 1:938005/169‑1 (MQ=35) ccAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAag < 1:729393/236‑1 (MQ=255) gCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCt > 1:819283/1‑135 (MQ=34) gCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTggg < 1:327934/135‑1 (MQ=21) gCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTggg > 2:327931/1‑135 (MQ=25) cagggtgaCGGCCTGGTTGGGACCCTGCGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCtt < 1:759403/163‑1 (MQ=11) cTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCg > 1:348877/1‑186 (MQ=35) gTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAag > 2:362651/1‑211 (MQ=255) cccTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCg > 1:922327/1‑236 (MQ=255) cTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGc > 1:51921/1‑131 (MQ=34) cTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGt > 1:30218/1‑236 (MQ=255) gCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCAGTCGGTGAc > 1:320684/1‑235 (MQ=255) caacaaTGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTCGTGGCCAAGCTGACTGCGAcc > 1:475745/1‑223 (MQ=255) caacaaTGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGAcc > 1:617701/1‑235 (MQ=255) tGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGccg > 1:247919/1‑159 (MQ=21) cccAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGt < 1:180141/236‑1 (MQ=255) tCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATc < 1:270630/236‑1 (MQ=255) aCCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAc < 1:638276/236‑1 (MQ=255) aCCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAc < 1:486791/236‑1 (MQ=255) tCAAGGCTGGCGAGACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTTTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTa > 1:806948/1‑235 (MQ=255) cAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGGTCCCCTGGATGCATCTC‑CGTACCCAGGTGCCTGCTAGATCAGCCTGAGTATGAACTCGGCGGGGGAAGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCg > 1:544336/1‑208 (MQ=14) cAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGcc > 1:325093/1‑187 (MQ=255) aaGGCCGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGt < 1:56306/222‑1 (MQ=255) gCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCGGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCa < 2:249612/226‑1 (MQ=255) gAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCt > 1:447850/1‑236 (MQ=255) aaaCCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCg > 1:493834/1‑129 (MQ=35) aaCCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGa > 1:689795/1‑236 (MQ=255) aaCCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCAAGATCAGCCTGGGTATCAACTcggcgga > 2:290944/1‑86 (MQ=18) aCCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAc < 2:617698/218‑1 (MQ=255) gcgcCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGt < 1:793627/204‑1 (MQ=255) acCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGGGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACCGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGCga > 1:266747/1‑197 (MQ=255) aCGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTTTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCg < 1:540590/236‑1 (MQ=255) cTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACcaa < 1:84603/217‑1 (MQ=255) cgcAGTTTG‑ATGACGTCTACGACGGTGCGGGTCAGATCAGCCTGGGTCTCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTc < 1:318293/83‑1 (MQ=11) cgcAGGGTG‑ATGACGTTTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTc < 1:326416/116‑1 (MQ=18) aGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGt > 1:112427/1‑71 (MQ=34) gggTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATTAACAAcc < 1:362654/236‑1 (MQ=255) gggTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATTAACAAcc < 1:793400/236‑1 (MQ=255) ggTG‑ATGACGTTTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCGTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATTAACAAcc < 1:9795/235‑1 (MQ=255) ggTG‑ATGACGTTTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATTAACAAcc < 1:384586/235‑1 (MQ=255) ggTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATTAACAAcc > 1:875688/1‑235 (MQ=255) aCAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCg > 1:668468/1‑212 (MQ=255) aCAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCg < 2:668465/212‑1 (MQ=255) aCAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACAACACCGACGAAGTAGTGGCCa > 1:365445/1‑132 (MQ=255) aCAACGACGCTGGCCAGATAAGCCTGGGTATCAACTCAGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCCTCGACGAAGTGGTGGCCAAGCTGACTGCCACCCCGTCgg > 2:882635/1‑153 (MQ=11) aaCGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGAc > 1:660517/1‑191 (MQ=255) aaCGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCGTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACAcc > 2:814780/1‑180 (MQ=255) aaCGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGCCGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACcaacaa < 1:200085/197‑1 (MQ=255) | GAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTG‑ATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATTAACAACC > AE015451/211907‑212348 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |