| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | AE015451 | 212,617 | C→G | 8.3% | T6041T (ACC→ACG) | PP_0168 → | putative surface adhesion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AE015451 | 212,617 | 0 | C | G | 8.3% | 167.1 / 6.1 | 59 | T6041T (ACC→ACG) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (17/37); new base G (3/2); total (20/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.25e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.72e-01 | |||||||||||
CGTCATCACCGTGCCGGCTAATGGCACCGTGGGTACTGCCACTGTCACTGCCCCGGATAACGTCTACGTCGGCAGCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTT > AE015451/212386‑212850 | cGTCATCACCGTGCCGGCTAATGGCACCGTGGGTACTGCCACTGTCACTGCCCCGGATAACGTCTACGTCGGCAGCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCAccgcc < 2:320681/235‑1 (MQ=34) ccGGCTAATGGCACCGTGGGTACTGCCACTGTCACTGCCCCGGATAACGTCTACGTCGGCAGCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCgc > 2:786203/1‑234 (MQ=25) cTGTCACTGCCCCGGATAACGTCTACGTCGGCAGCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCAcc > 1:301983/1‑191 (MQ=33) tGTCACTGCCCCGGATAACGTCTACGTCGGCAGCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCAcc > 1:122636/1‑235 (MQ=39) cccGGATAACGTCTACGTCGGCAGCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCga > 2:695366/1‑204 (MQ=14) cGGATAACGGCTACGTCGGCAGCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGAcc < 2:48988/191‑1 (MQ=25) gATAACGTCTACGTCGGCAGCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTGACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACGTTCACCGTGCACATCaa > 2:557847/1‑233 (MQ=11) tAACGTCTACGTCGGCAGCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCaa > 2:477098/1‑231 (MQ=255) cTACGTCGGCAGCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCAccgc < 1:915156/171‑1 (MQ=35) cTACGTCGGCAGCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCAccgc > 2:915153/1‑171 (MQ=35) cTACGTCGGCAGCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTgg > 1:914817/1‑236 (MQ=255) cTACGTCGGCAGCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTGACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCATCGAAGGCGACATGGTCAAGGTCACCATCAcggc > 1:878671/1‑171 (MQ=12) tACGTCGGCAGCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCt < 1:695369/208‑1 (MQ=40) cGTCGGCAGCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGc > 2:841830/1‑234 (MQ=255) 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cGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCg < 1:887778/236‑1 (MQ=255) gTGATGTCGATCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCa > 1:662823/1‑152 (MQ=14) gTGATGTCGATCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACTTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCa < 2:662820/152‑1 (MQ=9) tGATGTCGATCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGcc < 2:400003/205‑1 (MQ=255) aTCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCGGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTc < 2:134259/165‑1 (MQ=255) aTCGATACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAg < 2:689792/227‑1 (MQ=255) cGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGcc > 1:708447/1‑235 (MQ=255) cGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGc > 1:122762/1‑234 (MQ=12) gTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAgg > 2:578712/1‑232 (MQ=255) gCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCa > 2:531939/1‑226 (MQ=255) ggTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGAc > 2:13859/1‑131 (MQ=34) gCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATc > 1:75275/1‑231 (MQ=37) gCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAAcc < 1:663706/236‑1 (MQ=37) gTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCa < 2:914814/233‑1 (MQ=39) gTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAgcg < 1:721348/236‑1 (MQ=37) gTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAgc < 1:805737/235‑1 (MQ=37) ttCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAgc < 2:877423/234‑1 (MQ=37) gAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAgcgcg < 1:366471/234‑1 (MQ=37) tGACGCTCGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTGACCGACGAGCCAGGTACCCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTg < 2:906590/176‑1 (MQ=9) cGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGGACACCCa > 1:164784/1‑235 (MQ=17) tGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCa < 2:389403/190‑1 (MQ=33) gACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTgc < 1:672790/236‑1 (MQ=33) aaGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTgcgc < 1:397007/235‑1 (MQ=32) gCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGtg < 1:578715/236‑1 (MQ=32) tCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGAc > 1:148168/1‑236 (MQ=32) tCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGAGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGAc < 1:850251/236‑1 (MQ=17) 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ggTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTAGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAacg < 1:624213/236‑1 (MQ=21) gTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAacg < 1:531942/235‑1 (MQ=34) aCCGCCGAGCCAGGTACGCCGGGCACCGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGtg < 1:266941/217‑1 (MQ=14) ccGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAGACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAggg > 1:618426/1‑214 (MQ=14) cgacgaGCCGGGTACGCCGGGCAACGACGGCGACCTGGTCAAGGTCACCACCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGca < 1:290947/149‑1 (MQ=12) gaGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCt < 2:611056/231‑1 (MQ=33) aCGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAGACCAGCGCGCCGTACAccc < 2:618423/187‑1 (MQ=14) gCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGCCACCATCACCGCCGCCCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACaatg < 1:170632/215‑3 (MQ=17) cGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGCCCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGc < 2:233280/106‑1 (MQ=17) gCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCCCCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTTGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCa < 2:277768/78‑1 (MQ=11) aaCGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCa < 1:431600/235‑1 (MQ=21) gAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCt < 2:383013/180‑1 (MQ=31) ccTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGt < 2:662880/234‑1 (MQ=37) aCCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACg < 1:342334/226‑1 (MQ=34) aCCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGTCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCtt < 1:340977/236‑1 (MQ=25) aCCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCtt < 1:636503/236‑1 (MQ=35) cgccgACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGc < 2:4070/180‑1 (MQ=31) | CGTCATCACCGTGCCGGCTAATGGCACCGTGGGTACTGCCACTGTCACTGCCCCGGATAACGTCTACGTCGGCAGCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGGCGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAGCCGACCTTCACCGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTT > AE015451/212386‑212850 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |