Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | AE015451 | 213,820 | T→C | 8.6% | G6442G (GGT→GGC) | PP_0168 → | putative surface adhesion protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AE015451 | 213,820 | 0 | T | C | 8.6% | 175.8 / 2.9 | 56 | G6442G (GGT→GGC) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (27/23); new base C (3/2); total (31/25) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
GACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGCGAGATTACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGACGGCCTGCCGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCC > AE015451/213589‑214039 | gACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGCGAGATTACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGACGGCCTGCCGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTg < 2:513952/233‑1 (MQ=255) cGAAGGCGGCGAGATTACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGACGGCCTGCCGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTc < 2:452191/235‑1 (MQ=40) aTCACGCTGACCAACAAAGACGGCCTGCCGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAg > 2:590604/1‑231 (MQ=255) cGCTGACCAACAAAGACGGCCTGCCGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTc > 1:298398/1‑236 (MQ=255) ccAACAAAGACGGCCTGCCGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGAAGGcgcg < 2:224700/185‑1 (MQ=18) aaGACGGCCTGCCGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTca > 1:26280/1‑232 (MQ=255) aaGACGGCCTGCCGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGt < 1:409510/235‑1 (MQ=255) ccTGCCGATCAACAACCCCAGTGCAGTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGCACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACcgac < 1:244674/235‑1 (MQ=255) cGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGcc < 1:85888/235‑1 (MQ=255) cacaGTGCAGTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGACGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAAc < 2:171983/178‑1 (MQ=255) tGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCg < 1:690407/182‑1 (MQ=255) tGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCg > 2:690404/1‑182 (MQ=255) aTTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGa > 2:765166/1‑180 (MQ=255) aTTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTAGGCAAGTTCGAgac > 1:35772/1‑166 (MQ=255) ttGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTc < 2:244484/162‑1 (MQ=255) ttGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTc > 1:244486/1‑162 (MQ=255) ttGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGAcc > 2:733792/1‑186 (MQ=255) ttGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTCATGTCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGAcc < 1:733795/186‑1 (MQ=255) aCCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCac > 2:644215/1‑222 (MQ=255) ttCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACcga > 1:641010/1‑203 (MQ=255) aCGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGGAGGTGCGGACGTCGGTAAGTTCGAGCAACTGac < 2:750359/164‑1 (MQ=255) aCGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTCGGTAAGTTCGAGCAACTGac > 1:750362/1‑164 (MQ=255) gCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCa > 1:77534/1‑218 (MQ=255) gCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACg > 1:201731/1‑216 (MQ=255) gACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCa < 1:550452/235‑1 (MQ=255) ccGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGAAGGGGCGGACGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACtt > 1:192758/1‑171 (MQ=255) aCCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGa < 1:410151/235‑1 (MQ=255) cGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGCCCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTgc > 2:114699/1‑128 (MQ=255) gCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTgg > 1:786357/1‑235 (MQ=255) tGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGc > 1:418742/1‑223 (MQ=255) tGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTc < 2:298395/181‑1 (MQ=255) cGTCACTGCCCCGGACAATGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTc < 1:31726/220‑1 (MQ=255) tCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGACGGCGACCGGGTCAAgg > 2:771804/1‑170 (MQ=255) cgcaCAAGGTCTACGTCGGGAGCAACGACCCTGTCGCGATGTCGGTCGGTACCGTGGACGGTGCGGAGGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACt < 2:412504/91‑1 (MQ=11) cGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAAc > 1:289873/1‑236 (MQ=255) ggACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGt > 2:732993/1‑168 (MQ=255) ggACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTc < 1:472118/208‑1 (MQ=255) ccAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGc < 1:617286/134‑1 (MQ=255) ccAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGc > 2:617283/1‑134 (MQ=255) cAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGAcc < 2:544734/82‑1 (MQ=255) cAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGCGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGAcccc < 1:395159/84‑1 (MQ=255) cAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGAAGGCGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGAcc > 1:544737/1‑82 (MQ=9) aCCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTg < 1:407563/236‑1 (MQ=255) gTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACTCCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCGCACGACCTGGTCGTGcccc > 1:680153/1‑235 (MQ=255) cGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTa < 2:798720/104‑1 (MQ=255) cGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCGCt > 2:514998/1‑210 (MQ=255) cGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGCGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTa > 1:798723/1‑104 (MQ=255) gTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGAc > 1:6446/1‑182 (MQ=255) tGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCAcc < 2:331671/143‑1 (MQ=255) tGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCAcc > 1:331674/1‑143 (MQ=255) aTGTCGATCGCTACCGTTGAAGGCGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGca < 1:913105/235‑1 (MQ=255) tcgatcgaTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGcaaca < 1:251259/235‑1 (MQ=255) tCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGcaaca > 1:629249/1‑235 (MQ=255) gATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCATCTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCaa > 2:878597/1‑168 (MQ=255) gATCGCTACCGATGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCt < 1:788097/176‑1 (MQ=255) cGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGcc > 1:365052/1‑235 (MQ=255) cGCAACCGTTGAAGGCGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTGACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCt > 1:217476/1‑222 (MQ=255) | GACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGCGAGATTACCTACACCATCACGCTGACCAACAAAGACGGCCTGCCGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTCGACAAGACCCCGGTCAGCACTTCGGTCACCGACGAGCCGGGTACCCCAGGCAACGAAGGCGACCCGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTGCACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCC > AE015451/213589‑214039 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |