| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | AE015451 | 1,129,431 | A→T | 6.8% | A40A (GCT→GCA) | gcvP‑I ← | glycine dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AE015451 | 1,129,431 | 0 | A | T | 6.8% | 191.7 / 6.2 | 59 | A40A (GCT→GCA) | gcvP‑I | glycine dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/24); new base T (2/2); total (33/26) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.79e-03 | |||||||||||
TTGGGAAATTTCTGGCTGATACGGGGTGTAGGCGGTGTACCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGTTGGCGGTGCCGAGGTTGATGGTCATGGCGGGATTCCTCAGGCGTCGTCGTTGGCTTTGAGCAGGCGGTCGTAGGCGTCCTGGTCGAGCAGAGCGGTTACGGCTTCTGCATCGGCAGGGATGAAGCGGAA > AE015451/1129197‑1129654 | ttGGGAAATTTCTGGCTGATACGGGGTGTAGGCGGTGTACCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAg > 1:498114/1‑236 (MQ=255) tGGGAAATTTCTGGCTGATACGGGGTGTAGGCGGTGTACCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGc > 1:29147/1‑236 (MQ=255) gAAATTTCTGGCTGATACGGGGTGTAGGCGGTGTACCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGt < 1:773271/236‑1 (MQ=255) cGGGGTGTAGGCGGTGTACCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAg > 1:72441/1‑235 (MQ=255) aCCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCcagtgcagtg < 1:604047/236‑1 (MQ=255) ccAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGc > 1:724793/1‑214 (MQ=255) ccAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCca > 2:809003/1‑227 (MQ=255) gTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCTGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGcc > 1:436967/1‑235 (MQ=255) tttCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGt > 1:182993/1‑236 (MQ=255) cagGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCTGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCa < 2:436964/235‑1 (MQ=255) ttGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAgcggc < 1:249066/236‑1 (MQ=255) cgggATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCa < 2:265483/183‑1 (MQ=255) ggATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCgg < 1:338602/235‑1 (MQ=255) cGGTGCGGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGgcgc < 1:117613/227‑1 (MQ=255) gTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAgcggcg < 2:182991/224‑1 (MQ=255) gTGCCGGAGGGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAg < 2:302342/182‑1 (MQ=255) gAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGc < 2:453109/157‑1 (MQ=255) gtgtGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGc > 1:699646/1‑236 (MQ=255) tgtgGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTc < 1:573884/175‑1 (MQ=255) gtgtTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCTGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGaa > 2:320184/1‑173 (MQ=255) gtgtTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCTGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGaa < 1:320187/173‑1 (MQ=255) gtgtTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAg > 1:385796/1‑168 (MQ=255) gtgtTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAg < 2:385793/168‑1 (MQ=255) gtgtTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAgcggc > 2:344200/1‑209 (MQ=255) gtgtTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAgcggc < 1:344203/209‑1 (MQ=255) gtgtTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAG‑CCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGCTGag > 1:162751/1‑234 (MQ=255) gtagCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCt > 1:113827/1‑211 (MQ=255) agCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAgcggc < 2:364745/199‑1 (MQ=255) agCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGTTGGCg > 1:815919/1‑236 (MQ=255) cTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGgcgc > 2:224863/1‑197 (MQ=255) cTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGgcgc < 1:224865/197‑1 (MQ=255) cTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGTTGGCGGTGc < 1:654879/236‑1 (MQ=255) gCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGagt > 2:642520/1‑218 (MQ=255) cGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCcagtgca > 2:394390/1‑164 (MQ=255) cGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGGCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGGGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTc > 2:205775/1‑184 (MQ=255) gATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCt > 2:637133/1‑199 (MQ=255) aGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCg > 2:692315/1‑134 (MQ=255) ttGCCAGCGATGGCCGTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAgcgg < 2:136121/163‑1 (MQ=255) tGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGTTGGCGGTGCCGAGGTTGATGGTCATGGCGGGATTCCTCAgg > 2:463624/1‑236 (MQ=255) cAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGGCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCGTg > 2:231299/1‑143 (MQ=255) tGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGc < 2:324698/120‑1 (MQ=255) tGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGc > 1:324701/1‑120 (MQ=255) tGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGTTGGCGGTGCCGAGGTTGATGGTCATGGCGGGATTCCTCAGGcgtcgtc > 1:48210/1‑234 (MQ=255) agcgagcgCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGt < 1:528310/173‑1 (MQ=255) cgagcgCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGTTGGCGGTGCCGAGGTTGATGGTc > 1:450054/1‑194 (MQ=255) gagcgCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGcgcgcg > 1:826943/1‑143 (MQ=255) gcgTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGTTGGCGGTGCCGAGGTTGATGGTCATGGCGGGATTCCTCAg > 1:640924/1‑206 (MQ=255) 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tGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCAAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGTTGGCGGTGCCGAGGGTGATGGTCATGGCggggt > 2:907840/1‑173 (MQ=255) agttGATGCTGTCGGGGATGGCCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTTTTCGTCAGCGGcgcgcg < 2:2163/91‑1 (MQ=255) aTGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGTTGGCGGTGCCGAGGTTGATGGTCATGGCggggt > 2:159472/1‑146 (MQ=255) tCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGTTGGCGGTGCCGAGGTTGATGGTCATGGCGGGATTCCTCAGGCGTCGTCGTTGGCTTTGAGCAGGCgg > 2:463256/1‑176 (MQ=255) cGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGTTGGCGGTGCCGAGGTTGATGGTCATGGCGGGATTCCTCAGGcggcgtcgg > 2:58466/1‑157 (MQ=255) ggggATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGTTGGCGGTGCCGa > 2:787461/1‑119 (MQ=255) gggATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGTTGGCGGTGCCGAGGTTGATGGTCATGGCGGGATTCCTCAGGCGTCGTCGTTGGCTTTGAGCAGGCGGTCGTAGGCGTCCTGGTCGAGCAGAGCGGTTACGGCTTCTGCATCGGCAGGGATGAAGCGgaa > 1:431164/1‑235 (MQ=255) | TTGGGAAATTTCTGGCTGATACGGGGTGTAGGCGGTGTACCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGTTGGCGGTGCCGAGGTTGATGGTCATGGCGGGATTCCTCAGGCGTCGTCGTTGGCTTTGAGCAGGCGGTCGTAGGCGTCCTGGTCGAGCAGAGCGGTTACGGCTTCTGCATCGGCAGGGATGAAGCGGAA > AE015451/1129197‑1129654 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |