| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | AE015451 | 1,530,173 | A→C | 93.4% | *399S (TAA→TCA) noncoding (62/244 nt) |
ftsZ → PP_mr19 → |
Cell division protein FtsZ Xoo8 ncRNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AE015451 | 1,530,173 | 0 | A | C | 93.4% | 210.4 / 6.3 | 61 | *399S (TAA→TCA) noncoding (62/244 nt) | ftsZ PP_mr19 | Cell division protein FtsZ Xoo8 ncRNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/2); new base C (14/43); total (16/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.63e-01 | |||||||||||
GTGAAGGTGGTCGACAATACCCTGCAGACTGCCCAGCAGGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCACTCCGGGGAGAAGGTTTACCTGACCCTCAAGCCTGCACCTGTTGA > AE015451/1529947‑1530387 | gggAAGGTGGTCGACAATACCCTGCAGACTGCCCAGCAGGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAAtt < 1:707668/233‑1 (MQ=255) cAGACTGCCCAGCAGGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGTGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTgg < 1:391727/235‑1 (MQ=255) tGCCCAGCAGGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATtca < 1:541910/236‑1 (MQ=255) gCCCAGCAGGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAggg > 2:867319/1‑213 (MQ=255) cagcagGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGTGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAAttt > 2:391724/1‑203 (MQ=255) cagcagGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTg < 2:382846/225‑1 (MQ=255) agcagGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCaaa > 2:416922/1‑236 (MQ=255) gcagGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAg < 1:337381/236‑1 (MQ=255) gCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCa < 1:764152/201‑1 (MQ=255) aaGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGt < 1:195894/236‑1 (MQ=255) aGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTAt < 1:100956/191‑1 (MQ=255) cAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTatcatc < 1:735081/236‑1 (MQ=255) aaTCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTatc > 2:544355/1‑232 (MQ=255) agccTGCGCCGGTGAGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTg < 1:69033/201‑1 (MQ=255) 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cGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTttg > 1:490145/1‑236 (MQ=255) agcagcCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAg < 2:182576/218‑1 (MQ=255) cGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAAttt < 1:84634/235‑1 (MQ=255) tCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCTACCGTCAAGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAAGCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAg < 2:867489/206‑1 (MQ=255) aCCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTg < 2:251991/164‑1 (MQ=255) aCCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTg > 1:251994/1‑164 (MQ=255) ccTGGGGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGt < 2:134236/181‑1 (MQ=255) cgcCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCa > 2:618225/1‑233 (MQ=255) 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gcATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATAcc < 1:387180/236‑1 (MQ=255) gTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAAttt < 2:769256/178‑1 (MQ=255) aGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTc < 1:544358/236‑1 (MQ=255) aaCTGAACCCTCAGGATGCCCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCCCCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGt < 1:172510/231‑1 (MQ=255) aCTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCa > 1:438982/1‑235 (MQ=255) aCTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCAc < 1:618228/236‑1 (MQ=255) ccTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAAttt < 1:624176/152‑1 (MQ=255) ccTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAAttt > 2:624173/1‑152 (MQ=255) tCAGGATGACCTGGACTGCCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGaa < 2:252560/63‑1 (MQ=255) acgATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCACTCCGGGGAGaa < 1:497163/234‑1 (MQ=255) ggATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCACTCCGGGGAGAAg > 1:348548/1‑236 (MQ=255) cTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCACTCCGGGGAGAAGGTTTACCTGAcc < 1:141903/236‑1 (MQ=255) tCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGc < 2:697676/165‑1 (MQ=255) cGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAg > 1:560798/1‑103 (MQ=255) cGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAg < 2:560795/103‑1 (MQ=255) cGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCACTCCGGGTAGAAg > 2:817708/1‑218 (MQ=255) gATATCCGGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATAcc < 2:609208/178‑1 (MQ=255) gATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCg > 2:363820/1‑183 (MQ=255) atatCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGACTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGt < 2:122525/60‑1 (MQ=255) tCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCACTCCGGGGAGAAGGTTTACCTGACCCTCAAGCCt > 1:735635/1‑234 (MQ=255) aTTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCt < 1:372400/190‑1 (MQ=255) tCCTGTGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGTGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGTCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGCTTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCACTCCGGGGAGAAGGTTTACCTGACCCTCAAGCCTGCACCTGTTGa < 1:869296/236‑1 (MQ=255) cgtcgtCAGGCTGAGTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCgg < 2:83565/180‑1 (MQ=255) gtcgtcAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAg < 2:654386/172‑1 (MQ=255) gtcgtcAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCACTCCgg < 2:348105/191‑1 (MQ=255) gtcgtcAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCACTCCGGGGAGAAGGTTTACCTGACCCTCAAGCCTGCACCTGTTg < 1:130888/229‑1 (MQ=255) tcgtcAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCAccc < 2:63242/147‑1 (MQ=255) cgtcAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCAc < 2:438979/184‑1 (MQ=255) ggCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGACTACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCACTCCGGGGAGACGGTTTACCTGACCCTCa > 2:29438/1‑207 (MQ=255) ggCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCACTCCGGGga > 1:741493/1‑187 (MQ=255) tGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTTATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCACTCCGGGGAGAAGGTTTACCTGAc < 2:434737/199‑1 (MQ=255) | GTGAAGGTGGTCGACAATACCCTGCAGACTGCCCAGCAGGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCACTCCGGGGAGAAGGTTTACCTGACCCTCAAGCCTGCACCTGTTGA > AE015451/1529947‑1530387 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |