| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 902775 | 91 (1.060) | 7 (0.090) | 7/338 | NT | 7.6% | coding (724/849 nt) | nadC | quinolinate phosphoribosyltransferase (decarboxylating) monomer |
| ? | AE015451 | = 902859 | 84 (1.030) | coding (640/849 nt) | nadC | quinolinate phosphoribosyltransferase (decarboxylating) monomer | |||||
GCAATCAGCTCACAGGCTCAGTCGCATCGACAGGTCCACCGCTTTCACATCCTTGGTCATGGCACCAATCGAGATGTAGTCCACCCCCGTCTCGGCAATCACCCGCAGGGTCGTTTCGTTGACCCCGCCGCTGGCTTCAAGTTTGGCTTTGCCCGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCC > AE015451/902641‑903076 | gCAATCAGCTCACAGGCTCAGTCGCATCGACAGGTCCACCGCTTTCACATCCTTGGTCATGGCACCAATCGAGATGTAGTCCACCCCCGTCTCGGCAATCACCCGCAGGGTCGTTTCGTTGACCCCGCCGCTGGCTTCAAGTTTGGCTTTGCCCGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGcc > 1:1326604/1‑235 (MQ=255)gCAATCAGCTCACAGGCTCAGTCGCATCGACAGGTCCACCGCTTTCACATCCTTGGTCATGGCACCAATCGAGATGTAGTCCACCCCCGTCTCGGCAATCACCCGCAGGGTCGTTTCGTTGACCCCGCCGCTGGCTTCAAGTTTGGCTTTGCCCGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCt > 1:105294/1‑236 (MQ=255)gCAATCAGCTCACAGGCTCAGTCGCATCGACAGGTCCACCGCTTTCACATCCTTGGTCATGGCACCAATCGAGATGTAGTCCACCCCCGTCTCGGCAATCACCCGCAGGGTCGTTTCGTTGACCCCGCCGCTGGCTTCAAGTTTGGCTTTGCCCGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCt > 1:544052/1‑236 (MQ=255) tCAGCTCACAGGCTCAGTCGCATCGACAGGTCCACCGCTTTCACATCCTTGGTCATGGCACCAATCGAGATGTAGTCCACCCCCGTCTCGGCAATCACCCGCAGGGTCGTTTCGTTGACCCCGCCGCTGGCTTCAAGTTTGGCTTTGCCCGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTg > 2:1011069/1‑233 (MQ=255) aGCTCACAGGCTCAGTCGCATCGACAGGTCCACCGCTTTCACATCCTTGGTCATGGCACCAATCGAGATGTAGTCCACCCCCGTCTCGGCAATCACCCGCAGGGTCGTTTCGTTGACCCCGCCGCTGGCTTCAAGTTTGGCTTTGCCCGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTgg < 1:862110/232‑1 (MQ=255) ggCTCAGTCGCATCGACAGGTCCACCGCTTTCACATCCTTGGTCATGGCACCAATCGAGATGTAGTCCACCCCCGTCTCGGCAATCACCCGCAGGGTCGTTTCGTTGACCCCGCCGCTGGCTTCAAGTTTGGCTTTGCCCGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCgccagcggccagcg > 1:1521038/1‑219 (MQ=255) tCGCATCGACAGGTCCACCGCTTTCACATCCTTGGTCATGGCACCAATCGAGATGTAGTCCACCCCCGTCTCGGCAATCACCCGCAGGGTCGTTTCGTTGACCCCGCCGCTGGCTTCAAGTTTGGCTTTGCCCGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGAGCCAGCGGCCAGCGCCTgg > 1:370117/1‑217 (MQ=255) cATCGACAGGTCCACCGCTTTCACATCCTTGGTCATGGCACCAATCGAGATGTAGTCCACCCCCGTCTCGGCAATCACCCGCAGGGTCGTTTCGTTGACCCCGCCGCTGGCTTCAAGTTTGGCTTTGCCCGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGa > 1:1262648/1‑236 (MQ=255) cATCGACAGGTCCACCGCTTTCACATCCTTGGTCATGGCACCAATCGAGATGTAGTCCACCCCCGTCTCGGCAATCACCCGCAGGGTCGTTTCGTTGACCCCGCCGCTGGCTTCAAGTTTGGCTTTGCCCGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTGCGTCCAGGCTTTcca > 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cccGCCGCTGGCTTCAAGTTTGGCTTTGCCGGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCa < 1:745251/233‑1 (MQ=255) cccGCCGCTGGCTTCAAGGTTGGCTTTGCCCGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGc < 2:336409/158‑1 (MQ=255) ccgcTGGCTTCAAGTTTGGCTTTGCCCGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAg < 2:790306/234‑1 (MQ=255) cgcTGGCTTCAAGTTTGGCTTTGCCCGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCgccagcggcggggtcaacgaaacgaccctgcgggtgatttccgagacgggggtggactacatctcgattggtgccatgaccaaggatgtgaaagcggtggacctgtcgatgcgactga < 2:795125‑M2/209‑119 (MQ=255) 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cTTCAAGTTTGGCTTTGCCCGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAg < 1:831576/227‑1 (MQ=255) tCAAGTTTGGCTTTGCCCGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCgccagcggcggggtcaacgaaacgaccctgcgggtgattgccgag > 1:1087759‑M2/1‑83 (MQ=255) gTTTGGCTTTGCCCGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCtt < 2:406093/139‑1 (MQ=255) ttGGCTTTGCCCGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTa < 1:498085/235‑1 (MQ=255) tGGCTTTGCCCGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAg < 2:1104048/218‑1 (MQ=255) cccGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCCCCTCGGCTACGCCGCCGCTggcg > 2:929670/1‑183 (MQ=255) cgGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCa < 2:1225793/201‑1 (MQ=255) tAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGgcg > 2:866012/1‑129 (MQ=255) tGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGcaccca < 1:755428/236‑1 (MQ=255) gcACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTggcggc > 1:185915/1‑172 (MQ=255) gcACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCCCGGCTa > 1:223285/1‑156 (MQ=255) cTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAg < 2:1342263/191‑1 (MQ=255) ttCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTc < 1:1348608/235‑1 (MQ=255) ttCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCa > 1:192431/1‑236 (MQ=255) cgcgCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCataggcct < 2:1262645/236‑8 (MQ=255) gcATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGgcgcc > 1:151415/1‑112 (MQ=255) 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gTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCTCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCCCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAgg < 1:1434802/221‑1 (MQ=255) gcgcAGCTCGTGGGGCATGAGGAGGTCCGCgccagcggcgggggcaacgaaacgaccctgcgggtgattgccgagacgggggtggacta > 2:116776‑M2/1‑30 (MQ=255) aGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGttt < 2:1215649/153‑1 (MQ=255) cgcgtggagCTGGTTGATGCCCGCgccagcggcggggtcaacgaaccgcccctgcgggtgattgccgagacgggggtggactacatctcg > 2:1201102‑M2/3‑24 (MQ=255) tcgtcgAGCATGATGATGTCCGCGCCCGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGcgtcg > 1:1077730/1‑171 (MQ=255) tcgtcgAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAg > 1:700119/1‑236 (MQ=255) tcgtcgAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGGCGTa > 1:336337/1‑173 (MQ=255) aGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGccc > 2:841502/1‑234 (MQ=255) tgatgatgTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGgcgc > 1:926617/1‑224 (MQ=255) tgTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGGGATGTGGTTTTCCTTGCTCAGGAAGGcgt > 2:949041/1‑153 (MQ=255) gcgcCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGt > 1:575539/1‑196 (MQ=255) | GCAATCAGCTCACAGGCTCAGTCGCATCGACAGGTCCACCGCTTTCACATCCTTGGTCATGGCACCAATCGAGATGTAGTCCACCCCCGTCTCGGCAATCACCCGCAGGGTCGTTTCGTTGACCCCGCCGCTGGCTTCAAGTTTGGCTTTGCCCGCGGTAATGCGCACGGCTTCGCGCATTTCGTCCAGGCTCAGCTCGTCGAGCATGATGATGTCCGCGCCAGCGGCCAGCGCCTGGCGCAGTTCGTCCAGGCTTTCGACCTCGATTTCCACCGGCTTGCCCGGCGCAATGCGGTGTGCTGCGGCCACCGCCTCGGCTACGCCGCCGCTGGCGGCGATGTGGTTTTCCTTGATCAGGAAGGCGTCGTACAGGCCTATGCGGTGGTTGTCGCACCCACCGCAGGTCACTGCGTATTTTTGCGCCAGGCGCAGGCCC > AE015451/902641‑903076 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |