Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | AE015451 | 1367467 | 1367936 | 470 | 32 [29] | [29] 30 | [PP_1193] | [PP_1193] |
GGTGGTGGAAGCGGCGGTGGCGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGATCACGGCAACCATGTGGGTGGCGAACCCGGTAATGACCACGGTGTTCATGCCGGCGGCGAGGCCGGGGATGACAACAGCAGAAGCTGATTGGCGCTGAC > AE015451/1367739‑1368172 | ggtggtggAAGCGGCGGTGGCGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCa > 1:646679/1‑235 (MQ=255) gtggAAGCGGCGGTGGCGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCAc > 1:1355469/1‑236 (MQ=255) tggAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCa > 2:817889/1‑228 (MQ=255) tggAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTaa > 2:1405725/1‑234 (MQ=255) tggAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCa > 1:52527/1‑236 (MQ=255) gAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCa > 2:103083/1‑162 (MQ=255) ggtggCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATg > 1:615181/1‑235 (MQ=255) cggTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCAGGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGgatga > 2:629915/1‑177 (MQ=255) gaagTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCa > 2:1382350/1‑202 (MQ=255) cACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGACGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACg > 2:1405526/1‑184 (MQ=255) ggCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGATCACGGCAACCATGTGGGTGGCGa > 1:92030/1‑236 (MQ=255) ggtggtGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGATCACGGCAACCATGTGGGTGGCGAACCCGGTAATGAcc < 1:817891/235‑1 (MQ=255) gtggCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGATCACGGCAACCATGTGGGTGGCGAACCCGGTaa < 2:1355466/226‑1 (MQ=255) ggCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTa > 1:848988/1‑118 (MQ=255) ggCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGAc > 1:1000732/1‑180 (MQ=255) ggCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGATCACGGCAACCATGTGGGTGGCGAACCCGGTAATGACCACGGTGTTCATGc > 1:1234084/1‑233 (MQ=255) ggCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGATCACGGCAACCATGTGGGTGGCGAACCCGGTAATGACCACGGTGTTCATGCcg > 1:1336322/1‑235 (MQ=255) gCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGCGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGc > 2:1137400/1‑146 (MQ=255) ggCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGa > 2:989767/1‑173 (MQ=255) cAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGATCACGGCAACCATGTGGGTGGCGAACCCGGTAATGACCACGGTGTTCATGCCGGCGGCGAGGCCg > 1:1349800/1‑236 (MQ=255) gTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGATCACGGCAACCATGTGGGTGGCGAACCCGGTAGTGACCAc > 2:629208/1‑209 (MQ=255) acgacgGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGATCACGGCAACCATGTGGGTGGCGAACCCGGTAATGACCACGGTGTTCATGCCGGCGGCGAGGCCGGGGa > 2:1334755/1‑232 (MQ=255) acgacgGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGATCACGGCAACCATGTGGGTGGCGAACCCGGTAATGACCACGGTGTTCATGCCGGCGGCGAGGCCGGGGATGac > 1:1406152/1‑236 (MQ=255) acgacgGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATAGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCTGTAAGCCTGGCGATGATCACGGAAATCATGTtggtgg > 1:16070/1‑148 (MQ=255) ggCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGgtggtg < 2:1225336/129‑1 (MQ=255) ggCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGgtggtg > 1:1225339/1‑129 (MQ=255) gcagcagcaACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGgat > 2:316379/1‑65 (MQ=255) gcagcagcaACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGAGGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGATCACGGCAACCATGTGGGTGGCGAACCCGGTAATGACCACGGGGTTCATGCcggcg > 2:455174/1‑195 (MQ=255) gcagcagcaACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGT‑GGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGATCACGGCAACCATGTGGGTGGCGAACCCGGTAATGACCACGGTGTTCATGCCGGCGGCGAGGCCGGGGATGACAACAGCAGAAGCTGATCGGCGCTGa > 1:1305143/1‑236 (MQ=255) agcagcaACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGATCACGGCAACCATGTGGGTGGCGAACCCGGTAATGACCACGGTGTTCATGCCGGCGGCGAGGCCGGGGATGACAACAGCAGAAGCTGATTGGCGCTGAc > 1:1287806/1‑236 (MQ=255) | GGTGGTGGAAGCGGCGGTGGCGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGCGGCGGTGGTGGTGGCCACGGTGGTGGTGGAAGTGGTGGCGGCGGTGGCCATGGTGGCGGAAGCGGAAGTGGTGGCCACGGCAGCGGCGGTGACGGTGGTGGCCATGCCGGCAACAGCGGCAGTGGCCACGACGGTAATTCAAACGCTGGGCGCAGCAGCAACCATGCTGAAGCGGGTGACGATCATGGCAATCACGTGGGTGGGGAACCCGGGGATGATCATGGTAATCATGTCGGCGGTAAGCCTGGCGATGATCACGGCAATCATGTTGGTGGTGAACCTGGTGACGATCACGGCAACCATGTGGGTGGCGAACCCGGTAATGACCACGGTGTTCATGCCGGCGGCGAGGCCGGGGATGACAACAGCAGAAGCTGATTGGCGCTGAC > AE015451/1367739‑1368172 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |