| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | AE015451 | 4,089,886 | Δ1 bp | 6.2% | intergenic (+41/‑64) | kdgD → / → gudP | 5‑dehydro‑4‑deoxyglucarate dehydratase/glucarate transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AE015451 | 4,089,886 | 0 | C | . | 6.2% | 222.3 / 7.9 | 64 | intergenic (+41/‑64) | kdgD/gudP | 5‑dehydro‑4‑deoxyglucarate dehydratase/glucarate transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (21/39); new base . (2/2); total (23/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.14e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.72e-02 | |||||||||||
ACGATTTCTTCCTGCCCTACCTGGACATCCGCAACCGCAAGGCCGGCTACGCCGTGAGCATCGTCAAGGCCGGCGCCAGAATTGCCGGTTACGACGCCGGCCCGGTGCGTACCCCGCTGACCGACCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACCGCGCGACCATTGCTATCGCAGGCTCCAGCCTGCAGAAAGACCTCGGCATTGACGCCGTAACCCTCGGTTATATCTTTTCCGCCTTCG > AE015451/4089661‑4090118 | acgaTTTCTTCCTGCCCTACCTGGACATCCGCAACCGCAAGGCCGGCTACGCCGTGAGCATCGTCAAGGCCGGCGCCAGAATTGCCGGTTACGACGCCGGCCCGGTGCGTACCCCGCTGACCGACCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACt > 1:412738/1‑236 (MQ=255) cGCCGTGAGCATCGTCAAGGCCGGCGCCAGAATTGCCGGTTACGACGCCGGCCCGGTGCGTACCCCGCTGACCGACCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACaaa < 1:842864/215‑1 (MQ=255) gCCGTGAGCATCGTCAAGGCCGGCGCCAGAATTGCCGGTTACGACGCCGGCCCGGTGCGTACCCCGCTGACCGACCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGc < 1:628887/235‑1 (MQ=255) gTGAGCATCGTCAAGGCCGGCGCCAGAATTGCCGGTTACGACGCCGGCCCGGTGCGTACCCCGCTGACCGACCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGcaca < 1:933709/209‑1 (MQ=255) gCATCGTCAAGGCCGGCGCCAGAATTGCCGGTTACGACGCCGGCCCGGTGCGTACCCCGCTGACCGACCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGca > 2:452399/1‑203 (MQ=255) gTCAAGGCCGGCGCCAGAATTGCCGGTTACGACGCCGGCCCGGTGCGTACCCCGCTGACCGACCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGa < 1:73294/216‑1 (MQ=255) gTCAAGGCCGGCGCCAGAATTGCCGGTTACGACGCCGGCCCGGTGCGTACCCCGCTGACCGACCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCg < 1:464615/236‑1 (MQ=255) ggCCGGCGCCAGACTTGCCGGTTACGACGCCGGCCCGGTGCGTACCCCGCTGACCGCCCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGccc < 1:350990/190‑1 (MQ=255) ggCCGGCGCCAGAATTGCCGGTTACGACGCCGGCCCGGTGCGTACCCCGCTGACCGACCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACaa < 1:581703/196‑1 (MQ=255) ccGGCGCCAGAATTGCCGGTTACGACGCCGGCCCGGTGCGTACCCCGCTGACCGCCCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTa < 1:123732/233‑1 (MQ=255) ccGGCGCCAGAATTGCCGGTTACGACGCCGGCCCGGTGCGTACCCCGCTGACCGACCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTa > 2:650044/1‑233 (MQ=255) cGGCGCCAGAATTGCCGGTTACGACGCCGGCCCGGTGCGTACCCCGCTGACCGACCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCa > 2:691729/1‑217 (MQ=255) ccAGAATTGCCGGTTACGACGCCGGCCCGGTGCGTACCCCGCTGACCGACCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGGGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTa > 2:73294/1‑168 (MQ=255) tGCCGGTTACGACGCCGGCCCGGTGCGTACCCCGCTGACCGACCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGCTGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTgc < 1:920033/235‑1 (MQ=255) cccGGTTACGACGCCGGCCCGGTGCGTACCCCGCTGACCGCCCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTACACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACaaaaa < 2:977108/182‑1 (MQ=255) ggTTACGACGCCGGCCCGGTGCGTACCCCGCTGACCGACCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTCCCAg > 2:1274028/1‑202 (MQ=255) cgacgCCGGCCCGGTGCGTACCCCGCTGACCGACCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGa < 1:452402/235‑1 (MQ=255) cgCCGGCCCGGGGCGGACCCCGCTGACCGACCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGccc < 2:26572/163‑1 (MQ=255) cccGCTGACCGCCCTCCCCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGc < 1:295891/226‑1 (MQ=255) ccGCTGACCGACCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTg < 1:962229/236‑1 (MQ=255) gaccgaccTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCAc < 1:409458/236‑1 (MQ=255) accgaccTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCAc < 1:944090/235‑1 (MQ=255) cgaccTCCCCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACaa < 1:246338/142‑1 (MQ=255) cgaccTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGa < 1:650047/235‑1 (MQ=255) cgaccTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCAGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGa < 1:1236955/235‑1 (MQ=255) ccTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAAc < 2:554778/185‑1 (MQ=255) ccgccgAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATaa > 2:1062701/1‑140 (MQ=255) gccgAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGa < 1:946695/225‑1 (MQ=255) ccgAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGCGCGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGt > 2:197953/1‑119 (MQ=255) aaGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGAc > 1:4481/1‑235 (MQ=255) aaGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGAc < 1:444061/235‑1 (MQ=255) tACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACcgcgcg < 1:278408/236‑1 (MQ=255) gAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACcgcgcg > 2:511256/1‑233 (MQ=255) cTCGCCGCGCTGATGGACCAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCACGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACGAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGAcc < 1:229255/203‑1 (MQ=255) gATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACCGCGCGACCa > 2:499159/1‑220 (MQ=255) tGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACCGCGCGACCATTGCTATCGCAGGCTCCa < 1:691732/236‑1 (MQ=255) cAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACg < 2:1169770/144‑1 (MQ=255) aaGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCCGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGt < 1:296005/181‑1 (MQ=255) aTGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACCGCGCGACCATTGCTATCGCAGGCTCCAGCCTGCa < 1:840045/235‑1 (MQ=255) gCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACCGCGCGACCATTGCTATCGCAGGCTCCAGCCTGCAGaa > 2:1241632/1‑234 (MQ=255) cccGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACCGCGCGACCa < 1:28834/205‑1 (MQ=255) ccGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACCGCGCGACCATTGCTATCGCAGGCTCCAGCCTGCAGAAAGAc < 1:80105/236‑1 (MQ=255) aGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGGGAGCCCGCACAAAAATAACTAGCGGGa > 2:296004/1‑98 (MQ=255) gTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGAcc < 1:565916/190‑1 (MQ=255) tAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGG‑GTAGG‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAAc < 2:1104648/127‑1 (MQ=255) tAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGG‑GTA‑GGCCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAAc > 1:1104651/1‑127 (MQ=255) aaCGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACCGCGCGACCATTGCTATCGCAgg < 1:20244/209‑1 (MQ=255) ccGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGG‑GTAGG‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACaa > 2:1189239/1‑71 (MQ=25) ccGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGG‑GTAGG‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACaa < 1:1189242/71‑1 (MQ=255) gcgGCCTGCCAGACGCCGGGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCgg < 1:235600/46‑1 (MQ=255) gcgGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACCAAAATAACTAGCGGGa > 2:161194/1‑84 (MQ=255) ggCCTGCCAGACGCCGCGCACGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATGGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCAtgt < 2:603439/119‑1 (MQ=255) ccgcGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACCGCGCGACCATTGCTATCGCAGGCTCCAGCCTGCAGAAAGACCTCGGCATTGACGCCGTAACCCTCGGTtata > 2:753497/1‑234 (MQ=255) gcCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATg > 2:344041/1‑124 (MQ=255) gcCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATg < 1:344042/124‑1 (MQ=255) agccGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACCGCGCGACCATTGCTATCGCAGGCTCAAGCCTGCAGAAAGACCTCGGCCTTGACGCCGTAACCCTCGGTta > 2:1186082/3‑228 (MQ=255) ccGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACCGCGCGACCATTGCTATCGCAgg > 2:796052/1‑178 (MQ=255) ggAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACCGCGCGACCATTGCTATCGCAGGCTCCAGCCTGCAGAAAGACCTCGGCATTGACGCCGTAACCCTCGGTTATATCTTTTCCGc > 1:1040867/1‑236 (MQ=255) tGGGCCTA‑C‑CCCCCTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACCGCGCGACCATTGCTATCGCAGGCTCCAGCCTGc < 2:276242/183‑1 (MQ=255) tGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGTCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACCGCGCGACCATTGCTATCGCAGGCTCCAGCCTGCAGAAAGACCTCGGCATTGACGCCGTAACTCTCgtt > 2:1088614/1‑216 (MQ=255) tGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACCGCGCGACCATTGCTATCGCAGGCTCCAGCCTGCAGAAAGACCTCGGCATTGACGCCGTAACCCTCGGTTATATCTTTTCCGCCtt > 1:750364/1‑235 (MQ=255) tGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACCGCGCGACCATTGCTATCGCAGGCTCCAGCCTGCAGAAAGACCTCGGCATTGACGCCGTAACCCTCGGTTATATCTTTTCCGCCTTc < 1:1241635/236‑1 (MQ=255) ggCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACCGCGCGACCATTGCTATCGCAGGCTCCAGCCTGCAGAAAGACCTCGGCATTGACGCCGTAACCCTCGGTTATATCTTTTCCGCCTTCg < 1:125970/235‑1 (MQ=255) gCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACCGCGCGACCATTGCTATCGCAGGCTCCAGCCTGCAGAAAGACCTCGGCATTGACGCCGTAACCCTCGGTTATATCTTTTCCGCCTTc < 2:1040864/233‑1 (MQ=255) | ACGATTTCTTCCTGCCCTACCTGGACATCCGCAACCGCAAGGCCGGCTACGCCGTGAGCATCGTCAAGGCCGGCGCCAGAATTGCCGGTTACGACGCCGGCCCGGTGCGTACCCCGCTGACCGACCTCACCGCCGAAGAGTACGAAATGCTCGCCGCGCTGATGGACAAGATGGGCCCGCAGTAAACGCTGCCCGCGGCCTGCCAGACGCCGCGCCCGGAGTGGGCCTA‑C‑CCCACTCCGGCTACAATTCGTGAGCCCGCACAAAAATAACTAGTGGGAGTATTGCCAGCATGCAAGCGACTAAGAAAACGCATGTGCGCTACCTGATCCTGTTCATGCTGTTTCTGGTGACCACGATCAACTATGCCGACCGCGCGACCATTGCTATCGCAGGCTCCAGCCTGCAGAAAGACCTCGGCATTGACGCCGTAACCCTCGGTTATATCTTTTCCGCCTTCG > AE015451/4089661‑4090118 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |