| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | AE015451 | = 1777401 | 88 (1.430) | intergenic (+135/+157) | PP_5476/PP_1585 | conserved protein of unknown function/putative Antidote protein | |||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
GACGGCTGGGCCAGCATCAGCTCGACGGCCTTGGCCTGGTCGAGGTCTGCCTTGCTGGCGTCGTCCAGCTTGCGGAAGGTGGTGCCGGCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGTCGCTGTGCATCTCGACCTTCTTCGTCATGTAGCCTGGCCGCCAGGGACCGCTGCTCAT > AE015451/1737756‑1738222 | tgggatctcgagttgtttcggtttgagaatttttcagatcaagatcacggacggatcttggtcggcagaacgcctgggaaggatatcgttgcgtaaatcttccccaaaatgcatccgtaaacacctgattctattggggtcgaaacgaacaaaaaaggcgcaattccgatgcgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAg < 2:500677‑M1/3‑1 (MQ=255) aCGGCTGGGCCAGCATCAGCTCGACGGCCTTGGCCTGGTCGAGGTCTGCCTTGCTGGCGTCGTCCAGCTTGCGGAAGGTGGTGCCGGCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCt < 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1:399569‑M1/1‑236 (MQ=255) | GACGGCTGGGCCAGCATCAGCTCGACGGCCTTGGCCTGGTCGAGGTCTGCCTTGCTGGCGTCGTCCAGCTTGCGGAAGGTGGTGCCGGCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGTCGCTGTGCATCTCGACCTTCTTCGTCATGTAGCCTGGCCGCCAGGGACCGCTGCTCAT > AE015451/1737756‑1738222 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |