New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | AE015451 | = 1901548 | 87 (1.270) | 3 (0.050) | 3/320 | NT | 3.5% | coding (2099/4026 nt) | PP_1703 | assimilatory nitrate reductase/sulfite reductase |
? | AE015451 | = 1901589 | 84 (1.290) | coding (2140/4026 nt) | PP_1703 | assimilatory nitrate reductase/sulfite reductase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
CAAACTGGAGCCCGGCCCCTACCTTGAGATTCACCCCGAGGATGCCGCCCGGCTGGGTGTCGCTGAAAAGGACCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTA > AE015451/1901318‑1901783 | cAAACTGGAGCCCGGCCCCTACCTTGAGATTCACCCCGAGGATGCCGCCCGGCTGGGTGTCGCTGAAAAGGACCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGACGCGGTCGACCCGCT > 1:118566‑M1/1‑231 (MQ=255) tGGAGCCCGGCCCCTACCTTGAGATTCACCCCGAGGATGCCGCCCGGCTGGGTGTCGCTGAAAAGGACCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCa < 1:354357/235‑1 (MQ=255) ccGGCCCCTACCTTGAGATTCACCCCGAGGATGCCGCCCGGCTGGGTGTCGCTGAAAAGGACCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGGTGCGGTCGACCCGCTGTc > 1:291813/1‑223 (MQ=255) ccGGCCCCTACCTTGAGATTCACCCCGAGGATGCCGCCCGGCTGGGTGTCGCTGAAAAGGACCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCg > 1:888007/1‑224 (MQ=255) gCCCCTACCTTGAGATTCACCCCGAGGATGCCGCCCGGCTGGGTGTCGCTGAAAAGGACCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAgcctgcc < 2:715332/233‑1 (MQ=255) cccTACCTTGAGATTCACCCCGAGGATGCCGCCCGGCTGGGTGTCGCTGAAAAGGACCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCa > 1:881634/1‑235 (MQ=255) ttGAGATTCACCCCGAGGATGCCGCCCGGCTGGGTGTCGCTGAAAAGGACCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCa < 2:475661/232‑1 (MQ=255) tGAGATTCACCCCGAGGATGCCGCCCGGCTGGGTGTCGCTGAAAAGGACCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTgcg < 1:610411/236‑1 (MQ=255) tGAGATTCACCCCGAGGATGCCGCCCGGCTGGGTGTCGCTGAAAAGGACCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTgcg < 1:780336/236‑1 (MQ=255) tGAGATTCACCCCGAGGATGCCGCCCGGCTGGGTGTCGCTGAAAAGGACCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTgcg < 1:1002223/236‑1 (MQ=255) aTTCACCCCGAGGATGCCGCCCGGCTGGGTGTCGCTGAAAAGGACCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTg > 1:407526/1‑230 (MQ=255) 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gtCGCTGAAAAGGACCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCAt < 1:410859/236‑1 (MQ=255) tCGCTGAAAAGGACCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTgcgc < 1:108673/202‑1 (MQ=255) tCGCTGAAAAGGACCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCAt < 1:683566/235‑1 (MQ=255) tCGCTGAAAAGGACCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCAt < 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aaGGACCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCa < 1:528124/216‑1 (MQ=255) gggaCCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTccagggctacggcgcagtgcttgaaggcaggctgcagcgacagcgggtcgaccgcatcgcaggtcgcggcat < 1:548020‑M1/234‑73 (MQ=255) aGGACCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGCCCCGCTGTCGCTg > 2:172145/1‑170 (MQ=255) gACCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGa > 1:1007588/1‑236 (MQ=255) aCCAGGTGGCCGTTCGCGCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGcc < 2:748638/230‑1 (MQ=255) gTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGa > 1:625485/1‑235 (MQ=255) ggCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGCGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGc > 2:299756/1‑158 (MQ=255) ggCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGccc > 1:527996/1‑224 (MQ=255) 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ttCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAacac < 2:777073/232‑1 (MQ=255) ttCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGcc > 1:15716/1‑236 (MQ=255) gctcgcGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACg < 1:206905/213‑1 (MQ=255) cgcCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACt < 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tttCACTGGACCGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGc < 2:1001374/235‑1 (MQ=255) tgtCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGtt < 1:1121238/226‑1 (MQ=255) aCTGGAACGACCTGATCGGAGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCtt < 2:444705/203‑1 (MQ=255) gAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCtt < 1:117767/213‑1 (MQ=255) cGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCCACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCCGGagcg < 2:139351‑M2/105‑5 (MQ=255) aCCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACt > 2:589927/1‑143 (MQ=255) aCCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACt < 1:589930/143‑1 (MQ=255) ccTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGa > 2:47475/1‑137 (MQ=255) gtGATCGGCGAGGAACTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGGTGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACg < 2:197987/123‑1 (MQ=255) tGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGcccgt > 2:152636/1‑126 (MQ=255) tGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGt < 1:410371/236‑1 (MQ=255) tGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGt < 1:251606/236‑1 (MQ=255) gATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGCCGCCCTTGATCTGcaca > 2:900830/1‑137 (MQ=255) gtCGGCGAGCAATTGGCGATGAATGCCGCGACCTGCGGTGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGcc < 2:50656/122‑1 (MQ=255) aTCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCGGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCg < 2:880103/223‑1 (MQ=255) gCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTccagggctacggcgcagtgcttgaaggcaggctgcagcgacagcgggtcgaccgcatcgcaggt > 1:1046688‑M1/1‑45 (MQ=255) aTCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTg > 2:1271225/1‑168 (MQ=255) aTCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTg < 1:1271228/168‑1 (MQ=255) aTGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGagcgggtcgaccgcatcgcaggtcgcggcattgatcgccaattgctcgccgatcaggtcgttccagtgaaacggcgcaaagcagttgcccggcatgacccggtcactgatgcgcgccggcaacacggcctgcccccggcgcgagcgaacggccacctggtccc < 1:548020‑M2/235‑164 (MQ=255) aTGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAg < 1:433003/225‑1 (MQ=255) tGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGagcgggtcgaccgcatcgcaggtcgcggcattgatcgccaattgctcgccgatcaggtcgttccagtgaaacggcgcaaagcagttgcccggcatgacccggtcactgatgcgcgccggcaacacggcctgcccccggcgcgagcgaa > 2:548017‑M2/1‑71 (MQ=255) tGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTgg < 1:505843/236‑1 (MQ=255) tGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTgg < 1:872323/236‑1 (MQ=255) ccGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTgg < 2:524158/234‑1 (MQ=255) ccGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCGGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCGGGCGAGCGCATCGCCGCCCtt > 2:119133/1‑101 (MQ=255) cgcgACCTTCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAATCACTGCGCCGTAGCCCTGGATCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGt < 1:8690/152‑1 (MQ=255) cgcgACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCgaaga < 2:947586/201‑1 (MQ=255) cgcgACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCgaaga > 1:947589/1‑201 (MQ=255) aCCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGagcgggtcgaccgcatcgcaggtcgcggcattgatcgccaattgc > 1:1046688‑M2/1‑64 (MQ=255) aCCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCAt < 2:21825/131‑1 (MQ=255) tGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGc < 2:752477/159‑1 (MQ=255) tGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTcc < 1:933076/220‑1 (MQ=255) tGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTGCGCATGCCGAACGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTcc < 1:475262/215‑1 (MQ=255) ggTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCcgc < 1:759482/235‑1 (MQ=255) tgcGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTg < 1:919749/220‑1 (MQ=255) tgcGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTg > 2:919746/3‑222 (MQ=255) gACCCGCTccagggctacggcgcagtgcttgaaggcaggctgcagcgacagcgggtcgaccgcatcgcaggtcgcggcattgatcgccaattgctcgccgatcaggtcgttccagtgaaacg < 2:1104368‑M1/122‑115 (MQ=255) cGCTccggggctacggcgcagtgcttgaaggcaggctgcagcgacagcgggtcgaccgcatcgcaggtggcggcattgatcgccaattgctcgccgatcaggtcg < 2:139351‑M1/105‑102 (MQ=255) tccagggctacggcgcagtgcttgaaggcaggctgcagcgacagcgggtcgaccgcatcgcaggtcgcggcattgatcgccaattgctcgccgatcaggtcgttccagtgaaacggcgcaaagcagttgcccggcatgacccggtcactgatgcgcgccggcaacacggcctgcccccggcgcgagcgaacggccacctggtccttttcagcgacacccagccgggcggcatcctc > 1:1059130‑M1/1‑1 (MQ=255) | CAAACTGGAGCCCGGCCCCTACCTTGAGATTCACCCCGAGGATGCCGCCCGGCTGGGTGTCGCTGAAAAGGACCAGGTGGCCGTTCGCTCGCGCCGGGGGCAGGCCGTGTTGCCGGCGCGCATCAGTGACCGGGTCATGCCGGGCAACTGCTTTGCGCCGTTTCACTGGAACGACCTGATCGGCGAGCAATTGGCGATCAATGCCGCGACCTGCGATGCGGTCGACCCGCTGTCGCTGCAGCCTGCCTTCAAGCACTGCGCCGTAGCCCTGGAGCGGGTCGCAGGCGAGCGCATCGACGCCCTTGATCTGAACACTGCCACTGTAGAGCCTGTCCGCATGCCGACCGCCACCCTGTCCCGTCTGCTTGGCCTGCACACCTTGCCGGTTCCGGTGCTGGCCGAAGAAGAGCGTCATTACCTGCAAGGTTTCCTGCTGGGCCTGGACCAGGCCCGCGCCGAGGGCGTA > AE015451/1901318‑1901783 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |