| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 3409928 = | 63 (0.920) | 5 (0.080) | 4/328 | NT | 6.0% | intergenic (‑494/‑42) | PP_3022/PP_3024 | Transcriptional regulator, AraC family/conserved protein of unknown function |
| ? | AE015451 | = 3450711 | 95 (1.430) | intergenic (‑125/+258) | PP_5558/PP_3069 | putative transcriptional xre family of phage origin/Outer membrane autotransporter | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CGGAAACCTAAAGGGAGGTCAGCGAAAAATTCTTCGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGAATGTTCAACCGGGTCAGCGCGTCCTTGCTGGGCTGCG > AE015451/3450483‑3450940 | cGGAAACCTAAAGGGAGGTCAGCGAAAAATTCTTCGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAAcccct > 1:706083/1‑235 (MQ=255) cAGCGAAAAATTCTTCGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTAc < 1:1082629/236‑1 (MQ=255) cGAAAAATTCTTCGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGcc < 2:584160/219‑1 (MQ=255) tcGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGc < 1:1150322/236‑1 (MQ=255) tttCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCa < 2:790745/195‑1 (MQ=255) gggATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGtctc > 1:1049019/1‑234 (MQ=255) cttcttCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCtcggtcgg < 2:408252/233‑1 (MQ=255) cttcttCCATGGTCGGTGTCGAGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTaaccctagcgactgacaatataaactctagcttcagggtaaattggtatcaacc > 1:412273‑M2/1‑177 (MQ=255) tcttcCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTATTGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGAGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTCCCTGc > 1:976958/1‑212 (MQ=255) ggTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCg < 1:261594/236‑1 (MQ=255) tCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGgt > 1:1168877/1‑236 (MQ=255) cGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCtcggt < 2:1056851/217‑1 (MQ=255) cGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAAGTAACCCCAAGCCCATCCTGATCTTTACCGCCt > 2:1191726/1‑189 (MQ=255) atgatgTCTGCCGTCATGTTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGtgagtgag < 1:373807/226‑1 (MQ=255) cGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTggg < 1:572927/236‑1 (MQ=255) gCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTagc < 2:1084993/199‑1 (MQ=255) ccGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCtcggtcgg > 2:450945/1‑194 (MQ=255) cGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTgctgtctctta > 1:1242450/1‑226 (MQ=255) cGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGGTCg > 1:53229/1‑183 (MQ=255) aTGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGtgttgt < 1:188504/236‑1 (MQ=255) tGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGGGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTgttgtt > 1:168721/1‑236 (MQ=255) tGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGCAGCAGCAcccc > 2:1018749/1‑200 (MQ=255) tCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGcc > 2:933824/1‑167 (MQ=255) actCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCctgctg > 1:836147/1‑235 (MQ=255) tCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCCGTTCGTCtcggtc > 2:1228793/1‑176 (MQ=255) tCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCtcggtcgg > 2:563434/1‑178 (MQ=255) tCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTagcag > 2:679967/1‑184 (MQ=255) cTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCgg < 1:535310/189‑1 (MQ=255) taCTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCtcggtcgg > 1:1257001/1‑172 (MQ=255) taCTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCtcggtcgg < 2:1256998/172‑1 (MQ=255) gTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGc < 2:1168874/203‑1 (MQ=255) gTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGggcgg > 1:62149/1‑236 (MQ=255) gTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGggcgg < 1:299997/236‑1 (MQ=255) 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cATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCt < 2:1041514/199‑1 (MQ=255) cATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCt > 1:1041517/1‑199 (MQ=255) cATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTGCCTGCTGCTGGaa > 2:299996/1‑224 (MQ=255) cATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGAGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTc > 2:300467/1‑152 (MQ=255) 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< 2:307302/212‑1 (MQ=255) aaGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACTCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTgg > 1:1189114/1‑236 (MQ=255) aGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGgccatgg > 1:170678/1‑215 (MQ=255) aGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGCGTGTTGTTCctgctgct > 2:769918/1‑200 (MQ=255) ccATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCCTCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGtgagtgag > 2:185714/1‑163 (MQ=255) 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ataCGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGTTCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTagcagt > 1:47211/1‑131 (MQ=255) cGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGtt < 1:1195135/236‑1 (MQ=255) aGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTcagccag > 1:883234/1‑236 (MQ=255) aGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTcagcca > 1:685544/1‑235 (MQ=255) 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cTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCgg < 1:1018752/234‑1 (MQ=255) tAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTa > 2:304551/1‑205 (MQ=255) tAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTAAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGccc > 1:9007/1‑235 (MQ=255) aGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTaaccctagcgactgacaatataaactctagcttcagggtaaattggtatcaaccctccatgcattgactcagcaggcgaacagaggcaaattgccacgcttgtcgtacttacaaatcacctgcgcattgaatggatatcatgtgaagcttttaaaaaaagactactaccttcgacataagcgcatt < 1:465867‑M2/235‑187 (MQ=255) aGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGgcc > 2:534503/1‑175 (MQ=255) aGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGgcc < 1:534506/175‑1 (MQ=255) ggaggGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCt > 2:613377/1‑188 (MQ=255) ggaggGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCt < 1:613380/188‑1 (MQ=255) 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gggTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGAATGt > 1:776611/1‑235 (MQ=255) ggtggtTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGc > 2:695708/1‑201 (MQ=255) gggtATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCAc < 1:637047/219‑1 (MQ=255) ttATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGgcc < 1:475145/159‑1 (MQ=255) ttATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGAATGTTCAACCg > 1:1084153/1‑236 (MQ=255) gCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGAATGTTCAACCggg > 2:1057158/1‑212 (MQ=255) cTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGAATGTTCAACCGGGTCAGCGCGTCCTTGCTGGGCTgcg > 1:64731/1‑235 (MQ=255) | CGGAAACCTAAAGGGAGGTCAGCGAAAAATTCTTCGATCTCTTTCGGGATGCCTTCTTCCATGGTCGGTGTCGGGAAGGTAATGATGTCGGCCGTCATGGTCACTACTCGCTATACTGTATGCATGAACAGTATAGCGAGAAAGCCATCTTAAGCAATGTATACGGATCAAGGCCTGCTTAGGGGCAGGAGGGTGGTTATTCTAAAAATTATATTATCAGTCGCTAGGTAACCCCAAGGCCATCCTGATCTTTACCGCCTTCCTGCCGCAGTTCGTCTCGGTCGGTAGCAGCACCCCGGTGAGTGAGCAGTTCCTTTGGCTGGGTGTGTTGTTCCTGCTGCTGGAATGGGCGGCCATCGCCATCTACTCAGGCCTGGGCGCCTACATGCAGCGTTGGTTCAGCCAGCCCGGCCCACGCCGAATGTTCAACCGGGTCAGCGCGTCCTTGCTGGGCTGCG > AE015451/3450483‑3450940 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |