| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AE015451 | 4743577 = | 66 (0.960) | 12 (0.180) | 10/322 | NT | 13.5% | coding (415/1593 nt) | PP_4197 | Transcriptional regulator, GntR family |
| ? | AE015451 | 4743666 = | 91 (1.390) | coding (326/1593 nt) | PP_4197 | Transcriptional regulator, GntR family | |||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
CGTCACCTTGGCGATTTGCTGATGCAGGGCGCGCACTGGCAGGTAGTCGACATGCGGCACAGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGGCGATACGCTGGTACAGCAGCAGGTTGGTCATGTCGACATGCTCGTTGTTCTTGTACGGGTCACTGACGGTAGAGGATACCGTAACA > AE015451/4743437‑4743896 | caactggccgatgatatccgtcgcggtgtctaccagccaggcgagcgggtaccctccgtgcgcaagatgagcgcccagctcaatgtcagccatgccacggtgttgcaggcctatgccaatctcgaggaccaagggcttatccgggcgcggccgcagtctggctattacgtgcaccagacccctgccttgaccgcgcaaacccccgacatcgctcgggtggagcgcccggATAAGc < 1:757614‑M2/6‑1 (MQ=255) gTCACCTTGGCGATTTGCTGATGCAGGGCGCGCACTGGCAGGTAGTCGACATGCGGCACAGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGcc > 1:821089/1‑235 (MQ=255) tGGCGATTTGCTGATGCAGGGCGCGCACTGGCAGGTAGTCGACATGCGGCACAGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGt < 2:1228735/234‑1 (MQ=255) tGATGCAGGGCGCGCACTGGCAGGTAGTCGACATGCGGCACAGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTg < 2:394080/234‑1 (MQ=255) cgcggtgtctaccagccaggcgagcgggtaccctccgtgcgcaagatgagcgcccagctcaatgtcagccatgccacggtgttgcaggcctatgccaatctcgaggaccaagggcttatccgggcgcggccgcagtctggctattacgtgcaccagacccctgccttgaccgcgcaaacccccgacatcgctcgggtggagcgcccggATAAGCCCTTGGTCCTCga < 1:817019‑M2/19‑1 (MQ=255) tGGCAGGTAGTCGACATGCGGCACAGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACAcc > 1:1068230/1‑235 (MQ=255) gCAGGTAGTCGACATGCGGCACAGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGt < 1:319897/235‑1 (MQ=255) aTGCGGCACAGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTc > 2:1247255/1‑192 (MQ=255) cgtgcgcaagatgagcgcccagctcaatgtcagccatgccacggtgttgcaggcctatgccaatctcgaggaccaagggcttatccgggcgcggccgcagtctggctattacgtgcaccagacccctgccttgaccgcgcaaacccccgacatcgctcgggtggagcgcccggATAAGCCCTTGGt < 1:481122‑M2/13‑1 (MQ=255) agcagcACCAAACGGGAACACCCCATCGCGGCGCGCCCCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCa < 1:128922/196‑1 (MQ=255) agcaCCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGgcg > 1:441323/1‑235 (MQ=255) agcaCCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGgc > 1:760608/1‑234 (MQ=255) gatgagcgcccagctcaatgtcagccatgccacggtgttgcaggcctatgccaatctcgaggaccaagggcttatCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGCCCTCGAGATTGGCATAGGc < 1:160704‑M1/121‑1 (MQ=255) caCCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCa < 2:1128657/191‑1 (MQ=255) caCCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCt < 1:772713/235‑1 (MQ=255) cAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCAt > 1:336994/1‑235 (MQ=255) tcccagctcaatgtcagccatgcaccggtgttgcaggcctatgccaatctcgaggaccaagggcttatccgggcgcggccgcagtctggctattacgtgcaccagacccctgccttgaccgcgcaaacccccgacatcgctcgggtggagcgcccggATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGt < 1:968095‑M2/44‑1 (MQ=255) cacacCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGTACCCTGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACg > 1:769284/1‑235 (MQ=255) aatgtcagccatgccacggtgttgcaggcctatgccaatctcgaggaccaagggcttatccgggcgcggccgcagtctggctattacgtgcaccagacccctgccttgaccgcgcaaacccccgacatcgctcgggtggagcgcccggATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTgg < 1:1274534‑M2/25‑1 (MQ=255) gtcagccatgccacggtgttgcaggcctatgccaatctcgaggaccaagggcttatccgggcgcggccgcagtctggctattacgtgcaccagacccctgccttgaccgcgcaaacccccgacatcgctcgggtggagcgcccggATAGGCCCTTGGTCCTCga < 1:399593‑M2/19‑1 (MQ=255) atgccacggtgttgcaggcctatgccaatctcgaggaccaagggcttatCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCAt < 1:424616‑M1/138‑1 (MQ=255) gcgcCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTAccc < 1:18724/231‑1 (MQ=255) cTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACAtt > 2:424391/1‑192 (MQ=255) cTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCctg > 1:626356/1‑236 (MQ=255) acggtgttgcaggcctatgccaatctcgaggaccaagggcttatCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGGTGCATGGCTGACATTGAGCtggga < 1:968095‑M1/157‑2 (MQ=255) cagtcagCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGc > 1:798959/1‑137 (MQ=255) agtcagCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTgc < 1:446466/209‑1 (MQ=255) gtcagCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGa < 1:456791/190‑1 (MQ=255) agCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCAt < 1:487028/175‑1 (MQ=255) 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< 2:153644‑M2/25‑1 (MQ=255) gTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGGCGATACGCTGGTAcagcagca < 2:789684/217‑1 (MQ=255) cctgccttgaccgcgcaaacccccgacatcgctcgggtggagcgcccggATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGGCGATACGCTGGTACAGCAGCAGGTTGGTCATGTCGACATGc > 1:398952‑M2/50‑235 (MQ=255) gTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGAGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGGCGATACGCTGGTACAGCAGCAGGTTGGTCATGTCGACATGCTCGTTGTTCtt < 1:879535/236‑1 (MQ=255) 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AE015451/4743437‑4743896 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |