Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | AE015451 | 4,083,051 | G→C | 5.1% | G17A (GGT→GCT) ‡ | PP_3593 → | Amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AE015451 | 4,083,051 | 0 | G | C | 5.1% | 268.9 / 6.8 | 78 | G17A (GGT→GCT) ‡ | PP_3593 | Amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (42/32); new base C (2/2); total (44/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.50e-01 |
TGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGAATGCACGCTGGTGGCGCAGGACTGGGAAGGCATCATCCCCGCCCTGATGGCGCGCAAGTATGACGCGATAGTGGCATCGATGATCGACAC > AE015451/4082821‑4083276 | tGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTg > 2:632705/1‑233 (MQ=255) gggAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTgccgc > 1:1072017/1‑236 (MQ=255) gAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCTGCCa < 1:632708/236‑1 (MQ=255) ccTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTg > 1:372402/1‑223 (MQ=255) ccTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGa > 1:1264705/1‑236 (MQ=255) cgacgaTGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTg > 2:1091209/1‑232 (MQ=255) cgaTGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAAcc < 2:694099/234‑1 (MQ=255) gTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCAc < 2:1072014/234‑1 (MQ=255) gCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAg > 1:1078427/1‑236 (MQ=255) gTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCt < 2:1264702/233‑1 (MQ=255) gTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTAc < 1:1044844/235‑1 (MQ=255) tCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCAc < 1:444453/221‑1 (MQ=255) gCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCgggggg > 1:265151/1‑176 (MQ=255) cTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGa < 1:337936/234‑1 (MQ=255) cGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAgcg > 2:813503/1‑177 (MQ=255) cGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTc < 1:16248/221‑1 (MQ=255) cGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGcc > 1:852407/1‑236 (MQ=255) gATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAAc < 1:1277276/235‑1 (MQ=255) ttGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGACCTTCAACTATGTAGACGCCGAt > 2:909747/1‑228 (MQ=255) tGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCt < 2:852404/235‑1 (MQ=255) cGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGt < 1:1137747/148‑1 (MQ=255) gCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAGGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAg < 2:448915/183‑1 (MQ=255) ggAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCac > 2:287072/1‑150 (MQ=255) ggAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAAccc > 1:236274/1‑162 (MQ=255) ggAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACaa > 2:872429/1‑220 (MQ=255) cGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGccc < 2:979317/182‑1 (MQ=255) aCATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATg < 1:781433/234‑1 (MQ=255) aCGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTAc < 2:836567/165‑1 (MQ=255) aTTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGc > 1:1026190/1‑233 (MQ=255) cgtcgGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGCACCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCa < 2:1100077/144‑1 (MQ=255) cgtcgGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGCACCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCa > 1:1100080/1‑144 (MQ=255) tcgGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCCGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAgg > 2:781430/1‑148 (MQ=255) tcgGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGt > 1:288015/1‑136 (MQ=255) cTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCg > 2:1103732/1‑129 (MQ=255) cTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCg < 1:1103735/129‑1 (MQ=255) cTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGccc > 1:439324/1‑213 (MQ=255) cTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGa < 1:13954/235‑1 (MQ=255) tCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGAAt < 1:452051/236‑1 (MQ=255) gTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTgcc > 1:951158/1‑101 (MQ=255) gTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTgcc < 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gagaTGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAAcc > 1:487362/1‑72 (MQ=255) aaCAATTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCTCCCGGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGTCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTg < 2:698380/139‑1 (MQ=255) ggTCCGTGGCCTTGCTGTGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGTAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTAt < 2:67594/103‑1 (MQ=255) cATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCCGCGCTGAAAACCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCCTCAAcca > 1:231943/1‑97 (MQ=255) ccTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGGgccgc > 2:161885/1‑40 (MQ=255) cTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGAATGCACGCtggtg < 1:590515/177‑1 (MQ=255) tGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGCACCCGCCATCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGcc < 2:675640/98‑1 (MQ=255) tGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGCACCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGcc > 1:675643/1‑98 (MQ=255) gggTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGa > 1:1245942/1‑147 (MQ=255) gggTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGa < 2:1245939/147‑1 (MQ=255) gtgcgCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGCCGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACCGATg > 2:54612/1‑148 (MQ=255) gtgcgCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGa > 2:526234/1‑120 (MQ=255) gtgcgCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGa < 1:526237/120‑1 (MQ=255) gtgcgCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGAATGCACGCTGGTGGCGCAGGACTGGGAAGGCATCATCCCCGCCCTGATGGCGCGCAAGTATGACGCGATAGTGGCATCga > 1:495633/1‑236 (MQ=255) gcCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGAATGCACGCTGGTGGCGCAGGACTGGGAAGGCATCATCCCCGCCCTGATGGCGCGCAAGTATGACGCGATAGTGGCATCgatgat > 1:711112/1‑236 (MQ=255) cccTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCt > 2:590512/1‑105 (MQ=255) ccTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGAATGCACGCTGGTGGCGCAGGACTGGGAAgg < 1:117757/180‑1 (MQ=255) ctgctgGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGccc > 2:602366/1‑124 (MQ=255) ctgctgGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGAATGCACGCTGGTGGCGCAGGACTGGGAAGGCATCATCCCCGCCCTGATGGCGCGCAAGTATGACGCGATAGTGGCATCGATGATCGacac > 1:633596/1‑236 (MQ=255) gCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGAATGCACGCTGGTGGCGCAGGACTGGGAAGGCATCATCCCCGccc > 1:921777/1‑184 (MQ=255) | TGGGAATCCACCTCGACGATGCTGTCGTGGGTGCATCTGATGGTCAACGAGGTCTGCAAGAAGCTCGGACCGGATGTTGAAAAACGCTTGGAAGCAACTGCCGCTCTACATAACGAATTCGTCGGCTACACCTCGTGGTCGACGGGCAAACAACAATAGCAAGAGTGCAATGAGGTGCGAGATGAACAAGTCCATGGCCTTGCTGGGTGCGTGCGCCCTGCTGCTGGCGGGTGCCGCCAGCGCTGAAACCCTGCGGTTCGCCACCGAGGGTGCCTACCCGCCCTTCAACTATGTAGACGCCGATAACAAGCTGCACGGCTTTGATGTCGACATCACCCATGCCCTGTGCGAACAGATGAAAGTCGAATGCACGCTGGTGGCGCAGGACTGGGAAGGCATCATCCCCGCCCTGATGGCGCGCAAGTATGACGCGATAGTGGCATCGATGATCGACAC > AE015451/4082821‑4083276 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |