| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | AE015451 | 5,128,814 | C→A | 7.0% | L97L (CTG→CTT) | PP_4515 ← | Transcriptional regulator, MarR family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AE015451 | 5,128,814 | 0 | C | A | 7.0% | 190.0 / 6.7 | 57 | L97L (CTG→CTT) | PP_4515 | Transcriptional regulator, MarR family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/17); new base A (2/2); total (38/19) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.94e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.45e-01 | |||||||||||
CGCCAACAGTGCGCATGAGCAAGCGGTGTACCTGAACCTTGGGCACACCTTCTGAGGCTTGCACTGCACCTGCATCGATGGGTGAGCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGCCAGGTGCAGCAACACCAGCCAGCGCGCCTGGGACAGGTTGAGCCCGGCCAGGCGGC > AE015451/5128580‑5129025 | cgcCAACAGTGCGCATGAGCAAGCGGTGTACCTGAACCTTGGGCACACCTTCTGAGGCTTGCACTGCACCTGCATCGATGGGTGAGCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGcaca < 1:815226/236‑1 (MQ=255) ccAACAGTGCGCATGAGCAAGCGGTGTACCTGAACCTTGGGCACACCTTCTGAGGCTTGCACTGCACCTGCATCGATGGGTGAGCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGcac > 2:795838/1‑233 (MQ=255) cATGAGCAAGCGGTGTACCTGAACCTTGGGCACACCTTCTGAGGCTTGCACTGCACCTGCATCGATGGGTGAGCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAAtcttc > 2:516143/1‑234 (MQ=255) agtgtACCTGAACCTTGGGCACACCTTCTGAGGCTGGCACTGCACCTGCATCGATGGGTGAGCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGt < 2:1181403/213‑1 (MQ=255) aCCTTGGGCACACCTTCTGAGGCTTGCACTGCACCTGCATCGATGGGTGAGCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTTAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCAcc < 1:637577/236‑1 (MQ=255) tGGGCACACCTTCTGAGGCTTGCACTGCACCTGCATCGATGGGTGAGCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCt > 1:519642/1‑236 (MQ=255) cacaCCTTCTGAGGCTTGCACTGCACCTGCATCGATGGGTGAGCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCg > 1:1172623/1‑236 (MQ=255) cacaCCTTCTGAGGCTTGCACTGCACCTGCATCGATGGGTGAGCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGCACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCAccgcccgc > 1:157227/1‑234 (MQ=255) aGGCTTGCACTGCACCTGCATCGATGGGTGAGCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGc < 1:556398/235‑1 (MQ=255) tgcactgcacCTGCATCGATGGGTGAGCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTg > 1:800808/1‑235 (MQ=255) actgcacCTGCATCGATGGGTGAGCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGAGCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTcgcccgc > 1:67461/1‑194 (MQ=255) cTGCATCGATGGGTGAGCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGagc > 1:249072/1‑190 (MQ=255) gCATCGATGGGTGAGCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGctca > 1:259703/1‑165 (MQ=255) cGATGGGTGAGCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGa < 1:795841/236‑1 (MQ=255) aggggTGAGCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCg < 1:599265/200‑1 (MQ=255) gggTGAGCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCCCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGACCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTg < 1:1084382/197‑1 (MQ=255) gggTGAGCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATCCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTg > 2:1084379/1‑197 (MQ=255) ggTGAGCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAg > 1:887130/1‑235 (MQ=255) gCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCTGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGACGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAAcc > 2:857357/1‑205 (MQ=255) gCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCg > 1:944977/1‑225 (MQ=255) gCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACgcgc > 1:811765/1‑236 (MQ=255) gAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGgcg > 2:1178926/1‑183 (MQ=255) gAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGccc > 1:18630/1‑192 (MQ=255) gAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCgg > 1:909654/1‑231 (MQ=255) tGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGc < 2:471472/156‑1 (MQ=255) aCGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTc > 1:511591/1‑185 (MQ=255) cgcATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTgcg < 1:457417/169‑1 (MQ=255) cAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTc < 1:1022283/227‑1 (MQ=255) tGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGCCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCgggg > 1:806077/1‑235 (MQ=255) cAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTg > 2:635214/1‑166 (MQ=255) cAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGAACCTCCAGccc > 1:289046/1‑127 (MQ=255) aGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGAccc > 2:1132753/1‑196 (MQ=255) aGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCCCCCGCCGGCGCACCCGCCCtt > 2:113818/1‑150 (MQ=255) cACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGcc < 1:516146/235‑1 (MQ=255) aCGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGCCAg > 1:545857/1‑236 (MQ=255) ggTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGc > 2:787890/1‑196 (MQ=255) gTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACg < 2:402147/177‑1 (MQ=255) aCAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCGAAGAAGATTGTACTGTGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCgggg > 1:1121170/1‑207 (MQ=255) ctACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGcttctt > 2:1225676/1‑207 (MQ=255) tACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGctct < 1:796469/176‑1 (MQ=255) tACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTg > 1:396738/1‑177 (MQ=255) tACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGCCAGGTGCAGCAACAccagc > 1:588853/1‑235 (MQ=255) aCCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGCCAGGTGCAGCAACAccagcc < 1:635217/235‑1 (MQ=255) cccGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCCGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGGCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCCGCTCCCGCTGGGTCggg > 1:215643/1‑197 (MQ=255) cccGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGCCAGGCgccgca > 1:1026014/1‑225 (MQ=255) ccGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGCCAGGTGCAGCAACAccagccag > 1:1201787/1‑235 (MQ=255) gCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCGAAGAAGATTGTACTGTGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGcc > 2:1258353/1‑95 (MQ=16) gCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCGAAGAAGATTGTACTGTGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGcc < 1:1258356/95‑1 (MQ=21) gCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGCCAGGTGCAGCAACACCAGCCAgcg > 1:1243689/1‑235 (MQ=255) tGGTTGGCGTTGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTCCGATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCtt < 2:902259/115‑1 (MQ=255) tGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCGAAGAAGATTGTACTGTGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCa < 2:1121167/177‑1 (MQ=255) ggTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGCCAGGTGCAGCAACACCAGCCAgcg < 1:723712/229‑1 (MQ=255) ggCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGGCCAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCCCCgg > 2:382153/1‑83 (MQ=255) ggCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGAc > 2:243044/1‑128 (MQ=255) tcGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGCCAGGTGCAGCAACACCAGCCAGCGCGCCTGGGACa < 1:704205/226‑1 (MQ=255) tcGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGCCAGGTGCAGCAACACCAGCCAGCGCGCCTGGGACAGGTTGAGcc > 1:779032/1‑235 (MQ=255) cGATCTGACCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGGACAGTACAATCTGCTTCGCcagccg < 2:75724/58‑1 (MQ=255) gatcAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGCCAGGTGCAGCAACACCAGCCAGCGCGCCTGGGACAGGTTGAGCCCGGCCAggcggc > 1:1067693/1‑236 (MQ=255) gaggatcggcggGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCCGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCCCACGCCGTGTCgg > 2:1010922/7‑153 (MQ=255) gcggGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGCCAGGTGCAGCAACACCAGCCAGCGCGCCTggg > 2:1098376/1‑195 (MQ=255) | CGCCAACAGTGCGCATGAGCAAGCGGTGTACCTGAACCTTGGGCACACCTTCTGAGGCTTGCACTGCACCTGCATCGATGGGTGAGCTCAGGACTTTTCGAGGTTGGCCAGGATCTTGGCATGCACGCGCATACAGACCTGCAAGTCCGCCTCGTCCACGCCGGTAAACAGCTCTACCCGCAGCTGGTTGGCGATGGTCTCGATCTGATCGATCAACGGCTTGGCCGGCGGGCACAGTACAATCTTCTTCGCCCGCCGATCCTCCAGCACCGCCTGCCGGCGCACCAGCCCTTGCGCTTCCAGGCTGTCGAGCAGACGCGCCAGGGTCGGGCCTTCGACGCCTACGCTCTGGGCCAGCTCACGCTGTGTCGGGGCTTCTTCGAAGCGGGCCAGGTGCAGCAACACCAGCCAGCGCGCCTGGGACAGGTTGAGCCCGGCCAGGCGGC > AE015451/5128580‑5129025 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |