Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | AE015451 | 212,155 | T→C | 6.9% | G5887G (GGT→GGC) | PP_0168 → | putative surface adhesion protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AE015451 | 212,155 | 0 | T | C | 6.9% | 209.5 / 3.1 | 70 | G5887G (GGT→GGC) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/35); new base C (2/3); total (32/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATTAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACCCTGAGCGACGGCAAAACCG > AE015451/211924‑212387 | cAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGCGATGACGTTTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATc > 2:576321/1‑235 (MQ=17) ggTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGTGGTGGACGCCACTg < 1:1221173/236‑1 (MQ=18) ggTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTg < 1:926571/236‑1 (MQ=33) tAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCt < 2:1136997/232‑1 (MQ=33) aaCGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAg > 2:1138201/1‑222 (MQ=32) aCGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGCGATGACGTTTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCt < 1:576324/236‑1 (MQ=255) gACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGCCg > 1:912203/1‑182 (MQ=18) tGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGac > 1:1211140/1‑235 (MQ=255) ttCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCt < 2:293027/202‑1 (MQ=33) tgcACGTCAACCAGCCGCTGGCCCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAACGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGACGCGCAAGGCGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGacac < 1:824030/233‑1 (MQ=11) aCGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGAcaccac > 1:829176/1‑235 (MQ=255) aCGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGCCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGCGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACaccacc > 1:1268345/1‑236 (MQ=255) cGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCtt < 1:948967/183‑1 (MQ=33) cGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACcg < 1:1055175/236‑1 (MQ=255) ccAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAag < 1:1233573/236‑1 (MQ=255) cACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTGGAGCTGGGCGGTGccg > 2:406123/1‑188 (MQ=11) aCGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGTGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCt < 1:688697/235‑1 (MQ=255) aCCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAagtagt < 1:371980/212‑1 (MQ=255) cTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGCCGTCTACCACGATGCTGACCAGACCAGCCTGGGTAGCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACcgacg > 1:986467/1‑202 (MQ=255) caacaaTGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTGGAGCTGGGCGGTGCCGcgaaggtg > 1:626832/1‑168 (MQ=2) caacaaTGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCg > 1:405428/1‑236 (MQ=255) cgCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAGACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTcc > 2:962935/2‑170 (MQ=2) cgCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAGACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTcc < 1:962938/169‑1 (MQ=2) ccAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGt < 1:709112/235‑1 (MQ=255) ccAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTg < 1:637972/236‑1 (MQ=255) ccAGGTCACCAGCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGa < 1:535764/228‑1 (MQ=255) aCCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAc < 1:1026265/236‑1 (MQ=255) cATCAAGGCTGGCGAGACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAc < 1:702265/234‑1 (MQ=255) cAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGc > 2:418063/1‑147 (MQ=21) ccGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGc > 2:926589/1‑109 (MQ=35) ccGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAc > 1:98439/1‑226 (MQ=255) cGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCAtt < 1:829510/235‑1 (MQ=255) tGACACCAGCGCGCCGTACACCCTCGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACGCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCg < 2:221164/206‑1 (MQ=255) gAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGt > 2:713607/1‑149 (MQ=255) aaaCCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGGGCGACCTTCGAGAACCTCGAGcg > 1:114494/1‑123 (MQ=25) cacgcgcgcCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCgg < 2:250579/129‑1 (MQ=14) gcgcgcCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTg < 2:829173/207‑1 (MQ=255) cGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGt < 1:836556/200‑1 (MQ=255) aCGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGt < 1:1057673/178‑1 (MQ=255) cTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGa > 1:992026/1‑213 (MQ=255) tGCGCAGGGTGATGACGTTTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGa > 2:909686/1‑180 (MQ=9) tGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGAtt > 2:873159/1‑235 (MQ=255) tGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCgg < 1:1267748/110‑1 (MQ=17) cgcAGGGTGATGACGTTTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGa > 1:130415/1‑174 (MQ=12) cgcAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCgg < 2:1143860/108‑1 (MQ=40) cgcAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCgg > 1:1143863/1‑108 (MQ=40) cgcAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGc < 1:1136644/228‑1 (MQ=255) gcAGGGTGATGACGTCTACAGCGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTAGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGt < 1:159664/184‑1 (MQ=255) aGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACAcc > 1:398558/1‑197 (MQ=255) ggTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACACAGACGGTCTGCCGATTAACAACca > 1:1116240/1‑236 (MQ=255) ggTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATTAACAAcc < 1:873162/235‑1 (MQ=255) 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cGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGAcacc > 1:231072/1‑118 (MQ=255) cGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGAcacc < 2:231072/118‑1 (MQ=255) cGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAc > 1:560864/1‑180 (MQ=255) cGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAc < 2:560861/180‑1 (MQ=255) cTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATTAACAACCACAGTGCATTGa < 1:1053187/236‑1 (MQ=255) 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gggTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATTAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACCCTGAGCGACGGCAAAACCg > 1:592878/1‑236 (MQ=255) | CAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACGGCCGACCAGACTTCGGTAGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGATGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCGGCTTCGGTCCAAGTGACCGACACCACCGACGAAGTAGTGGCCAAGCTGACTGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGTCTGCCGATTAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACCCTGAGCGACGGCAAAACCG > AE015451/211924‑212387 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |