Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | AE015451 | 2,980,087 | T→G | 5.7% | E66D (GAA→GAC) | PP_2605 ← | conserved protein of unknown function |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AE015451 | 2,980,087 | 0 | T | G | 5.7% | 233.3 / 3.0 | 66 | E66D (GAA→GAC) | PP_2605 | conserved protein of unknown function |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (41/21); new base G (2/2); total (43/23) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.06e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.31e-01 |
GCCCTAGCCGTCGCCCGTCGTAAGGTAATGCACACAGCGAGCGACCGCCGCGTGCACTGCCATCGCCTTCACGCATGTCGGGCATACGGCTACCGCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCCGCGACGACCACTGTCAGGCCATGATGCGCGGCGGTTACGGCGGCAGCCAGGCCAGAGGCGCCGGAGCCGATGACGAGTACGTCACATTCAAGGGGGGGCATGGAAGGGGTCCGCTCGGATGTTGGAAGAAGTGGC > AE015451/2979855‑2980318 | gCCCTAGCCGTCGCCCGTCGTAAGGTAATGCACACAGCGAGCGACCGCCGCGTGCACTGCCATCGCCTTCACGCATGTCGGGCATACGGCTACCGCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTcg < 1:1178876/236‑1 (MQ=255) cTAGCCGTCGCCCGTCGTAAGGTAATGCACACAGCGAGCGACCGCCGCGTGCACTGCCATCGCCTTCACGCATGTCGGGCATACGGCTACCGCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTcgac > 1:426309/1‑235 (MQ=255) cGTCGCCCGTCGTAAGGTAATGCACACAGCGAGCGACCGCCGCGTGCACTGCCATCGCCTTCACGCATGTCGGGCATACGGCTACCGCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATg > 2:795852/1‑234 (MQ=255) cGTCGCCCGTCGTAAGGTAATGCACACAGCGAGCGACCGCCGCGTGCACTGCCATCGCCTTCACGCATGTCGGGCATACGGCTACCGCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGc < 1:422488/235‑1 (MQ=255) acacaGCGAGCGACCGCCGCGTGCACTGCCATCGCCTTCACGCATGTCGGGCATACGGCTACCGCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGACCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGc > 1:35521/1‑219 (MQ=255) gaCCGCCGCGTGCACTGCCATCGCCTTCACGCATGTCGGGCATACGGCTACCGCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCcac > 1:801374/1‑236 (MQ=255) cgccgcGTGCACTGCCATCGCCTTCACGCATGTCGGGCATACGGCTACCGCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCcaca < 1:283794/234‑1 (MQ=255) ccgcGTGCACTGCCATCGCCTTCACGCATGTCGGGCATACGGCTACCGCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTgc < 2:1140841/220‑1 (MQ=255) cgcgTGCACTGCCATCGCCTTCACGCATGTCGGGCATACGGCTACCGCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAaccac > 1:1113826/1‑236 (MQ=255) cTGCCATCGCCTTCACGCATGTCGGGCATACGGCTACCGCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTcg < 2:819637/180‑1 (MQ=255) gatggcagtgcACGCATGTCAGGCATACGGCTACCGCACTGGAAGTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGAAGCCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGGATCca > 1:665612/11‑218 (MQ=255) ccATCGCCTTCACGCATGTCGGGCATACGGCTACCGCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCa < 2:976201/236‑1 (MQ=255) aTCGCCTTCACGCATGTCGGGCATACGGCTACCGCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCa > 1:910356/1‑234 (MQ=255) gCATGTCGGGCATACGGCTACCGCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTgc > 1:496520/1‑195 (MQ=255) gCATGTCGGGCATACGGCTACCGCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTgcc > 1:996015/1‑235 (MQ=255) gggCATACGGCTACCGCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGc > 2:663809/1‑171 (MQ=255) gggCATACGGCTACCGCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGc < 1:663812/171‑1 (MQ=255) ggCTACCGCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCGTTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGgc > 1:776833/1‑211 (MQ=255) cTACCGCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGCCCAGGCGCTGGTGCCGccc > 1:51032/1‑222 (MQ=255) gCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCcg > 1:478883/1‑236 (MQ=255) cACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTAt > 2:526791/1‑179 (MQ=255) aCTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCcgc < 1:795855/235‑1 (MQ=255) tGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCCGcgac < 1:483673/236‑1 (MQ=255) cGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCCGCGACGACCACTGt > 1:1128739/1‑235 (MQ=255) ggCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAgctggctg > 1:1115213/1‑211 (MQ=255) ggCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCCGCGACGACCAc < 1:1032725/231‑1 (MQ=255) ggCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCCGCGACGACCAc > 2:1032722/1‑231 (MQ=255) ggCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCCGCGACGACCACTGTCa > 1:429991/1‑236 (MQ=255) tgtgCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAgct > 1:800622/1‑201 (MQ=255) tgtgCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGctggctgg > 1:824488/1‑207 (MQ=255) tgtgCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTggctggct > 1:516844/1‑209 (MQ=255) tatgctgcTCGAAGAACGCTACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCCGCGACGACCACTGTCAGGCCa > 1:761188/3‑236 (MQ=255) 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aCGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCCGCGACGACCACTGTCAGGCCATGATGCGCGGCGGt > 1:495423/1‑235 (MQ=255) accaTTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCCCCCCCCCGACCAGGCGCTGGTgc > 1:906073/1‑172 (MQ=255) gccATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTgc < 1:217798/121‑1 (MQ=255) cATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCCGCGACGACCACTGTCAGGCCATGATGCGCGGCGGTTACGGCGGCAgccaggcc < 1:927172/235‑1 (MQ=255) cgcAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCCGCGACGACCACTGTCAGGcc > 1:67881/1‑197 (MQ=255) cgcAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCCGCGACGACCACTGTCAGGCCATGATGCGCGGCGGTTACGGCGGCAGCCAGGCCAGAgg > 1:864339/1‑235 (MQ=255) cgcAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGAGGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCCGCGACGACCACTGTCAGGCCATGATGCGCGGCGGTTACGGCGGCAGCCAGGCCAGAGgc > 1:714455/1‑236 (MQ=255) gcAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCCGCGACGACCACTGTCAGGCCAGGATGCGCGGCGGtt > 1:794302/1‑212 (MQ=255) ggAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCCGCGACGACCACTGTCAGGCCATGATGCGCGGCGGTTACggcggc < 2:877699/217‑1 (MQ=255) gAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTgc < 2:283882/110‑1 (MQ=255) gAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCCGCGACGACCACTGTCAGGCCATGATGCGCGGCGGTTACGGCGGCAGCCAGGCCAGAGGCGCCg < 1:931823/235‑1 (MQ=255) ggCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCCGCGACGACCACTGTCAGGCCATGATGCGCGGCGGTTACGGCGGCAGCCAGGCCAGAGGCGCCGGAGc > 1:511660/1‑236 (MQ=255) 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ggTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCCGCGACGACCACTGTCAGGCCATGATGCGCGGCGGTTACGGCGGCAGCCAGGCCAGAGGCGCCGGAGCCGATGACGAGTACGTCACATTCAAgggggg < 2:761185/233‑1 (MQ=255) gTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCCGCGACGACCACTGTCAGGCCATGATGCGCGGCGGTTACGGCGGCAGCCAGGCCAGAGGCGCCGGAGCCGATGACGAGTACGTCACATTCAAGGGGGGGCAt > 1:604130/1‑236 (MQ=255) gcacgcaGGTAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCGTCGACGATGCCGTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCcg < 2:35521/130‑1 (MQ=255) cacgcaGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGAACGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTACGCGACGACCACTGTCAGGCCATGATGCGCGGCGGTTa > 2:632046/1‑165 (MQ=255) acgcaGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGAAGCCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCtt > 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gCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCCGCGACGACCACTGTCAGGCCATGATGCGCGGCGGTTAcggcg > 1:124800/1‑141 (MQ=255) | GCCCTAGCCGTCGCCCGTCGTAAGGTAATGCACACAGCGAGCGACCGCCGCGTGCACTGCCATCGCCTTCACGCATGTCGGGCATACGGCTACCGCACTGGAACTGCACGGCTGTGTGCTGCTCGAAGAACGCCACCATTTCCGGACCATGGCGCAGGAAGGCGCGTTGACGCGGGTCCAGCTCGCGGGTGTGGGTTTGCGCACGCAGATAGCGCTCCGGGGCATCGTCGGCTTCGACGATGCCTTCGGCGATGGCCAGCGGGTTGCGCGGTATCCACAACCACCCCCCCGACCAGGCGCTGGTGCCGCCCAGCTGGCTGGCTTTTTCCGCGACGACCACTGTCAGGCCATGATGCGCGGCGGTTACGGCGGCAGCCAGGCCAGAGGCGCCGGAGCCGATGACGAGTACGTCACATTCAAGGGGGGGCATGGAAGGGGTCCGCTCGGATGTTGGAAGAAGTGGC > AE015451/2979855‑2980318 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |