| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 25750 | 37 (0.850) | 5 (0.120) | 5/322 | NT | 11.5% | intergenic (+180/‑131) | PP_0020/PP_0021 | hypothetical protein/conserved hypothetical protein |
| ? | AE015451 | = 25768 | 42 (1.020) | intergenic (+198/‑113) | PP_0020/PP_0021 | hypothetical protein/conserved hypothetical protein | |||||
TCAGTGTTGGGGATACCGATGAAGATGAAGAAGGTGCCGATGATGCTGACTGAGCTGCTATCGGCCTCCCCTTTAGGATCTGGGTTTGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAGATGGATGTCTATAAGGTCCGCATCGAAGACACAGAAAGCAAGATCATCGACAAGGAAGGTTTCGAGGCCGAGACCTTCCGCAGAGATCCATGGTACCAGCCTGG > AE015451/25518‑25984 | tCAGTGTTGTGGATACCGATGAAGATGAAGAAGGTGCCGATGATGCTGACTGAGCTGCTATCGGCCTCCCCTTTAGGATCTGGGTTTGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAgg < 1:491847/235‑1 (MQ=255) aCCGATGAAGATGAAGAAGGTGCCGATGATGCTGACTGAGCTGCTATCGGCCTCCCCTTTAGGATCTGGGTTTGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAgg > 1:225731/1‑230 (MQ=255) gatgaagatgaaGAAGGTGCCGATGATGCTGACTGAGCTGCTATCGGCCTCCCCTTTAGGATCTGGGTTTGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTtg < 1:623518‑M2/236‑3 (MQ=255) aagatgaagaAGGTGCCGATGATGCTGACTGTGCTGCTATCGGCCTCCCCTTTAGGATCTGGGTTTGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTc < 1:62756/216‑1 (MQ=255) atgaagaAGGTGCCGATGATGCTGACTGAGCTGCTATCGGCCTCCCCTTTAGGATCTGGGTTTGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTtgggcgggc > 1:194821‑M2/1‑227 (MQ=255) agaagGTGCCGATGATGCTGACTGAGCTGCTATCGGCCTCCCCTTTAGGATCTGGGTTTGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCa < 1:766225/236‑1 (MQ=255) gaagGTGCCGATGATGCTGACTGAGCTGCTATCGGCCTCCCCTTTAGGATCTGGGTTTGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGcct > 1:604506/1‑220 (MQ=255) cGATGATGCTGACTGAGCTGCTATCGGCCTCCCCTTTAGGATCTGGGTTTGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGGCGCTCAGGCATGCTCTGGGCGGGCCTCAAACCAGTgg > 1:118680/1‑236 (MQ=255) tgatgCTGACTGCGCGGCTCTCGGCCTCCCCGTTAGGATCTGGGTTTGCCCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTc < 1:175108/197‑1 (MQ=255) cccTTTAGGATCTGGGTTTGTCCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAATCCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCCCCAAGAATCGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTtgggcgggccctagaaacaactaaccccctggtgcgcagtacaggtctgg > 1:93033‑M2/1‑183 (MQ=255) ccTTTAGGATCTGGGTTTGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATc < 2:769186/172‑1 (MQ=255) cTTTAGGATCTGGGTTTGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTgg < 2:278672/203‑1 (MQ=255) tAGGATCTGGGTTTGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTtgggcg < 1:470465‑M2/184‑7 (MQ=255) gggTTTGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCctc > 1:34948/1‑236 (MQ=255) gTTTGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGaccac > 1:101832/1‑198 (MQ=255) tttGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACAAAAAGGGTCAGTTAGGCCt > 2:603166/1‑217 (MQ=255) ccTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTtgggcgggc > 2:495115‑M2/1‑162 (MQ=255) cggACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTc < 2:22696/140‑1 (MQ=255) cGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAgaga < 1:645228/236‑1 (MQ=255) ctctACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTg < 1:225841/166‑1 (MQ=255) ctctACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGAccc > 2:742095/1‑233 (MQ=255) aaaCCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGCATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTAtt < 2:687088/233‑1 (MQ=255) ccAATTGATTTTCCCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCGTACTGCTGCCTATCCCCGCTCGTTACCATCCa < 2:762419/217‑1 (MQ=255) aTTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTggg > 1:665825/1‑152 (MQ=255) cGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGt < 1:247892/139‑1 (MQ=255) cGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAGATGGATGTc < 1:697/236‑1 (MQ=255) tGTCGCTCCAAGACTAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAgat < 1:78442/220‑1 (MQ=255) tCCAGGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCagag < 1:106398/184‑1 (MQ=255) cAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAgatg < 1:1652/213‑1 (MQ=255) cccccACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGTGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAGATGGATGTc < 1:708081/210‑1 (MQ=255) cccACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTtgggcgggccctagaaacaa < 1:53936‑M2/107‑21 (MQ=255) cccACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTtgggcgggccctagaaacaa > 2:53936‑M2/1‑87 (MQ=255) gCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCCCCAGGGGGTTAGTTGTTTCTCGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTtgggcgggccctagaaacaactaaccccctggt > 1:616114‑M2/1‑82 (MQ=255) ccTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCa < 2:104288/162‑1 (MQ=255) ccTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAGATGGATGTCTATAAGGTCCGCATCGAAg > 1:57651/1‑221 (MQ=255) cTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAgat < 1:17394/194‑1 (MQ=255) ccAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAaagcatgcctgatcgacctgggcgggccctagaaacaactaaccccctggtgcgcagtacaggtctgggacctgcccgaggcgtgggggcgattcttggggcgacagtgacaccggctccggagaaaatcaattggattgtagagcagccggtcagctaaggacaaacccagatcctaaaggg > 1:93033‑M1/1‑50 (MQ=255) cgACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAGATGGATGTCTATAAg < 2:561736/192‑1 (MQ=255) ccTGTACTGCGCACCAGGGGGCTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAaagcatgcctgatcgacccgggcgggccctagaaacaactaaccccctggtgcgcag > 2:636761‑M1/1‑45 (MQ=255) cTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAGATGGATGTCTATAAGGTCCGCATCGAAGACACAGAAAGCAAGATCATCGACAAGGAAGGtt < 1:742097/235‑1 (MQ=255) tGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCGAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTGTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAGATGGATGTCTATAAGGTCCGCATCGAAGac < 1:74199/203‑1 (MQ=255) cTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCGGGTCGATCAGGCATGCTTtgggcgggccctagaaacaactagccccctggtgcgcagtacagg > 2:636761‑M2/1‑57 (MQ=255) cTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAGATGGATGTCTATaa < 2:29246/183‑1 (MQ=255) cTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAGATGGATGTCTATaa > 1:29246/1‑183 (MQ=255) tGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTT‑GGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGCGACCCTCTATTGATACGGTTTCAg > 2:214653/1‑162 (MQ=255) cACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGAcc > 2:192029/1‑139 (MQ=255) aCCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAaagcatgcctgatcgacctgggcgggcccgagaaacaactaaccccctggggcgcagtacaggtctgggacctgcccgaggc > 1:616114‑M1/1‑33 (MQ=255) cAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAGATGGATGTCTATAAGGTCCGCATCGAAGACACAGAAAGCAAGATCATCGACAAGGAAGGTTTCGAGGCCGAGAc > 1:282154/1‑235 (MQ=255) 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tAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAGATGGATGTCTATAAGGTCCGCATCGAAGACACAGAAAGCAAGATCATCGACAAGGAAGGTTACGAGGCCGAGACCTTCCGCAGAGATCCATg > 1:459697/1‑235 (MQ=255) gcccgcccAaagcatgcctgatcgacctgggcgggccctagaaacaactaaccccctggtgcgcagtacaggtctgggacctgcccgaggcgtgggggctattcttggagcgacagtgacaccggctccggagaaaatcaattggtttgtagagcagccggtcagctaaggtcaaacccagatcctaaaggggaggccgatagcagctcagtcagcatcatcggcaccttcttcat > 1:194821‑M1/1‑9 (MQ=255) gcccgcccAaagcatgcctgatcgacctgggcgggccctagaaacaactaaccccctggtgcgcagtacaggtctgggacctgcccgaggcgtgggggctattcttggagcgacagtgacaccggctccggagaaaatcaattggtttgtagagcagccggtcagctaagg > 2:495115‑M1/1‑9 (MQ=255) cgcccAaagcatgcctgatcgacctgggcgggccctagaaacaactaaccccctggtgcgcagtacaggtctgggacctgcccgaggcgtgggggctattcttggagcgacagtgacaccggctccggagaaaatcaattggtttgtagagcagccggtcagctaaggtcaaacccagatccta < 1:470465‑M1/184‑179 (MQ=255) ccAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAGATGGATGTCTATAAGGTCCGCATCGAAGACACAGAAAGCaa > 2:739764/1‑174 (MQ=255) cAaagcatgcctgatcgacctgggcgggccctagaaacaactaaccccctggtgcgcagtacaggtctgggacctgcccgaggcgtgggggctattcttggagcgacagtgacaccggctccggagaaaatcaattggtttgtagagcagccggtcagctaaggtcaaacccagatcctaaaggggaggccgatagcagctcagtcagcatcatcggcaccttcttcatcttcatc < 1:623518‑M1/236‑235 (MQ=255) cAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAGATGGATGTCTATAAGGTCCGCATCGAAGACACAGAAAGCAAGATCATCGACACGGAAGGTGTCg > 2:320361/1‑196 (MQ=255) aGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAGATGGATGTCTATAAGGTCCGCATCGAAGACACAGAAAGCAAGATCATCGACAAGGAAGGTTTCGAGGCCGAGACCTTCCGCa > 2:647045/1‑213 (MQ=255) aGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAGATGGATGTCTATAAGGTCCGCATCGAAGACACAGAAAGCAAGATCATCGACAAGGAAGGTTTCGAGGCCGAGACCTTCCGCa < 1:647047/213‑1 (MQ=255) aGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAGATGGATGTCTATAAGGTCCGCATCGAAGACACAGAAAGCAAGATCATCGACAAGGAAGGTCTCGAGGCCGAGACCTTCCGCAGAGATCCATGGTACCAGCCTgg > 1:530882/1‑235 (MQ=255) | TCAGTGTTGGGGATACCGATGAAGATGAAGAAGGTGCCGATGATGCTGACTGAGCTGCTATCGGCCTCCCCTTTAGGATCTGGGTTTGACCTTAGCTGACCGGCTGCTCTACAAACCAATTGATTTTCTCCGGAGCCGGTGTCACTGTCGCTCCAAGAATAGCCCCCACGCCTCGGGCAGGTCCCAGACCTGTACTGCGCACCAGGGGGTTAGTTGTTTCTAGGGCCCGCCCAGGTCGATCAGGCATGCTTTGGGCGGGCCTCAAACCAGTGGGTGACCACCAAAAGGGTCAGTTAGGCCTACTGCTGCCTATCCTCGCTCGTTACCATCCAGAGACCCTCTATTGATACGGTTTCAGCAAAGATGGATGTCTATAAGGTCCGCATCGAAGACACAGAAAGCAAGATCATCGACAAGGAAGGTTTCGAGGCCGAGACCTTCCGCAGAGATCCATGGTACCAGCCTGG > AE015451/25518‑25984 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |