New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 2310292 = | 36 (0.820) | 4 (0.100) | 4/322 | NT | 12.9% | coding (43/1311 nt) | PP_2033 | conserved protein of unknown function |
? | AE015451 | 2310373 = | 20 (0.490) | coding (124/1311 nt) | PP_2033 | conserved protein of unknown function |
TGCGGGCAAAGAAATGTCCCACGCATGGCTGGCCTTTGCCTGATGGTCCGTGACGGCGTGCTGGCGCCTGCTTGTGCTTTTCGGACAAGCAGGAGACACGATGATGAAAATGAGCAGCGCCAGCACGGCAAACCTTACGCCGGTCACCCTGCGTTTTGGCGTGTTCTTCGATGGCACCGGAAACAACCTGCACAATGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGGCCACCGGGCATGGGCGCACAGGGGCAGAGGCCCGGGTTGCCGAGGCGTTGCAGG > AE015451/2310150‑2310586 | tGCGGGCAAAGAAATGTCCCACGCATGGCTGGCCTTTGCCTGATGGTCCGTGACGGCGTGCTGGCGCCTGCTTGTGCTTTTCGGACAAGCAGGAGACACGATGATGAAAATGAGCAGCGCCAGCACGGCAAACCTTACGCCGGTCACCCTGCGTTTTGGCGTGTTCTTCGATGGCACCGGAAACAACCTGCACAATGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCa > 2:628169/1‑233 (MQ=255) gCAAAGAAATGTCCCACGCATGGCTGGCCTTTGCCTGATGGTCCGTGACGGCGTGCTGGCGCCTGCTTGTGCTTTTCGGACAAGCAGGAGACACGATGATGAAAATGAGCAGCGCCAGCACGGCAAACCTTACGCCGGTCACCCTGCGTTTTGGCGTGTTCTTCGATGGCACCGGAAACAACCTGCACAATGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATg < 2:421953/234‑1 (MQ=255) aaGAAATGTCCCACGCATGGCTGGCCTTTGCCTGATGGTCCGTGACGGCGTGCTGGCGCCTGCTTGTGCTTTTCGGACAAGCAGGAGACACGATGATGAAAATGAGCAGCGCCAGCACGGCAAACCTTACGCCGGTCACCCTGCGTTTTGGCGTGTTCTTCGATGGCACCGGAAACAACCTGCACAATGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATGGCAAc < 1:628171/236‑1 (MQ=255) gAAATGTCCCACGCATGGCTGGCCTTTGCCTGATGGTCCGTGACGGCGTGCTGGCGCCTGCTTGTGCTTTTCGGACAAGCAGGAGACACGATGATGAAAATGAGCAGCGCCAGCACGGCAAACCTTACGCCGGTCACCCTGCGTTTTGGCGTGTTCTTCGATGGCACCGGAAACAACCTGCACAATGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATGGCCAc > 2:412151/1‑234 (MQ=255) aTGGCTGGCCTTTGCCTGATGGTCCGTGACGGCGTGCTGGCGCCTGCTTGTGCTTTTCGGACAAGCAGGAGACACGATGATGAAAATGAGCAGCGCCAGCACGGCAAACCTTACGCCGGTCACCCTGCGTTTTGGCGTGTTCTTCGATGGCACCGGAAACAACCTGCACAATGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAAtgtg > 1:497440/1‑235 (MQ=255) ggACGGCGTGCTGGCGCCTGCTTGTGCTTTTCGGACAAGCAGGAGACACGATGATGAAAATGAGCAGCGCCAGCACGGCAAACCTTACGCCGGTCACCCTGCGTTTTGGCGTGTTCTTCGATGGCACCGGAAACAACCTGCACAATGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGcc < 2:119931/196‑1 (MQ=255) gCTGGCGCCTGCTTGTGCTTTTCGGACAAGCAGGAGACACGATGATGAAAATGAGCAGCGCCAGCACGGCAAACCTTACGCCGGTCACCCTGCGTTTTGGCGTGTTCTTCGATGGCACCGGAAACAACCTGCACAATGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGAtgct > 2:478457/1‑233 (MQ=255) tGCTTGTGCTTTTCGGACAAGCAGGAGACACGATGATGAAAATGAGCAGCGCCAGCACGGCAAACCTTACGCCGGTCACCCTGCGTTTTGGCGTGTTCTTCGATGGCACCGGAAACAACCTGCACAATGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGAc > 1:413186/1‑236 (MQ=255) gACAAGCAGGAGACACGATGATGAAAATGAGCAGCGCCAGCACGGCAAACCTTACGCCGGTCACCCTGCGTTTTGGCGTGTTCTTCGATGGCACCGGAAACAACCTGCACAATGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCg > 1:259288/1‑191 (MQ=255) aGCAGGAGACACGATGATGAAAATGAGCAGCGCCAGCACGGCAAACCTTACGCCGGTCACCCTGCGTTTTGGCGTGTTCTTCGATGGCACCGGAAACAACCTGCACAATGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACCAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCtt < 1:471191/234‑1 (MQ=255) agcagcGCCAGCACGGCAAACCTTACGCCGGTCACCCTGCGTTTTGGCGTGTTCTTCGATGGCACCGGAAACAACCTGCACAATGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGc < 2:685667/234‑1 (MQ=255) gcgcCAGCACGGCAAACCTTACGCCGGTCACCCTGCGTTTTGGCGTGTTCTTCGATGGCACCGGAAACAACCTGCACAATGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTg > 1:558220/1‑236 (MQ=255) cGGCAAACCTTACGCCGGTCACCCTGCGTTTTGGCGTGTTCTTCGATGGCACCGGAAACAACCTGCACAATGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTg < 1:518102/234‑1 (MQ=255) aCCTTACGCCGGTCACCCTGCGTTTTGGCGTGTTCTTCGATGGCACCGGAAACAACCTGCACAATGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGAc > 1:312563/1‑236 (MQ=255) ACCCTGCGTTTTGGCGTGTTCTTCGATGGCACCGGAAACAACCTGCACAATGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGGAGcc < 1:158738‑M1/219‑1 (MQ=255) ctgctccccctccgccgtggcattgtgcaggttgtttccggtgccatcgaagaacacgccaaaacgcaggttgacAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCt < 1:20203‑M2/63‑1 (MQ=255) ccgccgtggcattgtgcaggttgtttccggtgccatcgacgaacacgccaaaacgcagggtgacAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCCGGCGTTCtt > 2:109741‑M2/65‑162 (MQ=255) tcttcGATGGCACCGGAAACAACCTGCACAATGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGGCCACCGGGCATGGgc > 1:549837/1‑234 (MQ=255) cattgtgcaggttgtttccggtgccatcgaagaacacgccaaaacgcagggtgacAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCgg < 1:572211‑M2/160‑1 (MQ=255) cattgtgcaggttgtttccggtgccatcgaagaacacgccaaaacgcagggtgacAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCgg > 2:572209‑M2/56‑215 (MQ=255) aTGGCACCGGAAACAACCTGCACAATGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGGCCACCGGGCATGGGCGCACAggg < 1:725500/236‑1 (MQ=255) acCTGCACAATGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGGCCACCGGGCATGGGCGCACAGGGGCAGAGGCCCGGGtt < 1:790146/236‑1 (MQ=255) aaTGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGGGGGTGAAGcc < 1:651982/171‑1 (MQ=255) cggAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCg > 2:675593/1‑179 (MQ=255) cggAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGGCCACCGGGCATGGGCGCACAGGGGCAGAGGCCCGGGTTGCCGAGGCGTTGCAgg > 1:429462/1‑234 (MQ=255) gggggtggcAAGGGTGGCAGCGATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGCCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGGCCAcc < 2:95298‑M2/165‑1 (MQ=255) cAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGGCCACCGGGCATGGgc > 1:219346‑M2/2‑176 (MQ=255) | TGCGGGCAAAGAAATGTCCCACGCATGGCTGGCCTTTGCCTGATGGTCCGTGACGGCGTGCTGGCGCCTGCTTGTGCTTTTCGGACAAGCAGGAGACACGATGATGAAAATGAGCAGCGCCAGCACGGCAAACCTTACGCCGGTCACCCTGCGTTTTGGCGTGTTCTTCGATGGCACCGGAAACAACCTGCACAATGCCACGGCGGAGGGTGAGCAGGGTGACAAGGGTGGCAGCTATGGCAACGCCTTGAGCAATGTGGCCCTGTTGCATGCGTTGTATCCGGCTGATGCTGCCGGTGCCGACGGGCCGCAGGCGTTCTTGAAGCGCTATGTGGAAGGCGTGGGCACGCTGGCGGGTGAAGCCGACCATGTCTACGCCTCGGCCACCGGGCATGGGCGCACAGGGGCAGAGGCCCGGGTTGCCGAGGCGTTGCAGG > AE015451/2310150‑2310586 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |