New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 3616215 = | 43 (0.980) | 5 (0.120) | 5/328 | NT | 11.9% | coding (550/1266 nt) | codB | Cytosine transporter |
? | AE015451 | 3616308 = | 33 (0.790) | coding (643/1266 nt) | codB | Cytosine transporter |
GCTTTTCGGGCTGGGTTTCAGCATTACGGCCATTATCGGTTTCAAGGGGCTGGACCTGCTGTCGCGGGTGTCGGTGCCATTGATGTTCGTGCTGCTGTTGGTGTCCATGTACATCGCCACCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGCCTGATGGTGGTGGCCGGGGCGTGGTGCGCGATGGTTTACCAGCAGGCCGATATCGTCGACGTGATGATGCTGCAGGGCCTGTCGTTCGCGGCCGTGGTTATGCTGTGCCTAAACCTGTGGACCATTCAGGGGCCGAC > AE015451/3616073‑3616522 | gCTTTTCGGGCTGGGTTTCAGCATTACGGCCATTATCGGTTTCAAGGGGCTGGACCTGCTGTCGCGGGTGTCGGTGCCATTGATGTTCGTGCTGCTGTTGGTGTCCATGTACATCGCCACCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGcca > 1:312730/1‑236 (MQ=255) gCTTTTCGGGCTGGGTTTCAGCATTACGGCCATTATCGGTTTCAAGGGGCTGGACCTGCTGTCGCGGGTGTCGGTGCCATTGATGTTCGTGCTGCTGTTGGTGTCCATGTACATCGCCACCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGcca > 1:675798/1‑236 (MQ=255) ggTTTCAAGGGGCTGGACCTGCTGTCGCGGGTGTCGGTGCCATTGATGTTCGTGCTGCTGTTGGTGTCCATGTACATCGCCACCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACt < 1:768004/205‑1 (MQ=255) gACCTGCTGTCGCGGGTGTCGGTGCCATTGATGTTCGTGCTGCTGTTGGTGTCCATGTACATCGCCACCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGc < 2:635854/199‑1 (MQ=255) gACCTGCTGTCGCGGGTGTCGGTGCCATTGATGTTCGTGCTGCTGTTGGTGTCCATGTACATCGCCACCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGc > 1:635856/1‑199 (MQ=255) ctgcggTCGCGGGTGTCGGTGCCATTGATGTTCGTGCTGCTGTTGGTGTCCATGTACATCGCCACCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGccac < 1:190095/182‑1 (MQ=255) gTCGCGGGTGTCGGTGCCATTGATGTTCGTGCTGCTGTTGGTGTCCATGTACATCGCCACCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCAc > 2:691449/1‑197 (MQ=255) gTCGCGGGTGTCGGTGCCATTGATGTTCGTGCTGCTGTTAGTGTCCATGTACATCGCCACCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGaca > 2:755520/1‑187 (MQ=255) tCGCGGGTGTCGGTGCCATTGATGTTCGTGCTGCTGTTGGTGTCCATGTACATCGCCACCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGacac > 2:325183/1‑187 (MQ=255) ggTGTCGGTGCCATTGATGTTCGTGCTGCTGTTGGTGTCCATGTACATCGCCACCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATtcctc > 1:558351/1‑235 (MQ=255) cGTGCTGCTGTTGGTGTCCATGTACATCGCCACCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTATTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGCCTGAtggtg > 1:786634/1‑235 (MQ=255) ttGGTGTCCATGTACATCGCCACCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTGGGCAACGGCCTGATGGGGGTGGCCGGGGc > 1:153266/1‑236 (MQ=255) gtCCATGTACATCGCCACCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGCCTGATGGTGGTGGCCGGGGCgtggt < 1:571302/236‑1 (MQ=255) ccATGTACATCGCCACCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTgg < 1:634281/189‑1 (MQ=255) tGTACATCGCCACCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGCCt > 2:282563/1‑208 (MQ=255) tCGCCGCCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTg < 1:198787/192‑1 (MQ=255) gccgccCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGCCTGATGGTGGTGGCCGGGGCgtggtg < 1:86615/224‑1 (MQ=255) ccACCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGc > 2:558377/1‑197 (MQ=255) ccACCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGCCTGATGGTGGTGGCCGGGGCgt > 1:58362/1‑219 (MQ=255) cACCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGCCTGATGGTGGTGGCCGGGGCGTGGTGCGCGATGGt > 1:637536/1‑231 (MQ=255) aCCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGCCTGATGGTGGTGGCCGGGGCGTGGTGCGCGATGGTTTAcc > 1:373497/1‑235 (MQ=255) cccGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGcc < 2:465756/195‑1 (MQ=255) gcgATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGCCTGATGGTGGGGGCCGGGGCgtggtg > 1:206624/1‑217 (MQ=255) cgATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGCCTGATGGTGGTGGCCGGGGCgtggtg < 1:500362/216‑1 (MQ=255) gTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGc < 1:57096/182‑1 (MQ=255) ggCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTgg > 1:664970/1‑173 (MQ=255) ggCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTgg < 2:664968/173‑1 (MQ=255) gCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGCCTGATGGTGGTGGCCGGGGCGTGGTGCGCGATGGTTTACCAGCAGGCCGATATCGTCGACGTGATGATGCTGCAGGGCCTGTCGt < 1:787633/236‑1 (MQ=255) gtgccgaagaccatggtcactgccgccgaaaaggtcatggtttcatgcgggacgactgccgccaggccACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGt > 2:38242‑M2/69‑103 (MQ=255) caaCCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGCCTGATGGTGGTGGCCGGGGCGTGGTGCGCGATGGTTTACCAGCAGGc < 2:564555/192‑1 (MQ=255) ccATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGCCTGATGGTGGTGGCCGGGGc < 1:509480/163‑1 (MQ=255) ccATGACCTTTTAGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATtcct < 2:434168/130‑1 (MQ=255) aCCGTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGCCTGAtg < 2:35889/144‑1 (MQ=255) cggcggCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGCCTGATGGTGGTGGCCGGGGCGTGGTGCGCGATGGTTTACCAGCAGGCCGATATCGTCGACGtg < 1:130107/194‑1 (MQ=255) aaaaggtcatggtttcgtgcgggacgactgcagccaggccACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGTCAGCg < 2:747327‑M2/52‑1 (MQ=255) gtcatggtttcatgcgggacgactgcagccaggccACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGCCTGATGGTGGTGGCCGGGGCGTGGTGCGCGATGGTTTACCAGCAGGcc > 2:23068‑M2/36‑161 (MQ=255) cGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCgg < 2:19499/84‑1 (MQ=255) cGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGCCTGATGGTGGTGGCCGGGGCGTGGTGCGCGATGGTTTACCAGCAGGCCGATATCGTCGACGTGATGATGCTGCAGGGCCTGTCGTTCGCGGCCGTGGTTATGCTGTGCCTAAACCTGTGGACCATTCAGGGGCCGa > 1:745511/1‑236 (MQ=255) ccAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGCCTGATGGTGGTGGCCGGGGCGTGGTGCGCGATGGTTTACCAGCAGGCCGATATCGTCGACGTGATGATGCTGCAGGGCCTGTCGTTCGCGGCCGTGGTTATGCTGTGCCTAAACCTGTGGACCATTCAGGGGCCGAc < 1:296722/235‑1 (MQ=255) gactgcagccaggccACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTgg > 2:593074‑M2/16‑86 (MQ=255) gactgcagccaggccACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTgg < 1:593076‑M2/71‑1 (MQ=255) tcccAGGCCACCAACTGGACCCGGCTGGCGCGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCCCCTTGGCAACGGCCTGATGGTGGTGGCCGGGGCGTGGTGCGCGATGGTTTACCAGCAGGCCGATATCGTCGACGTGATGATGCTGCAGGGCCTGTCGTTcgc < 2:223538/175‑1 (MQ=255) ccaggccACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTg > 2:32681‑M2/8‑77 (MQ=255) ccaggccACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTg < 1:32681‑M2/70‑1 (MQ=255) gccACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGCCTGATGGTGGTGGCCGGGGCGTGGTGCGCGATGGTTTACCAGCAGGCCGATATCGTCGACGTGATGATGCTGCAGGGCCTGTCGTTCGCGGCCGTGGTTATGCTGTGCCTAAACCTGTGGACCATTCAgg < 2:786632‑M2/208‑1 (MQ=255) | GCTTTTCGGGCTGGGTTTCAGCATTACGGCCATTATCGGTTTCAAGGGGCTGGACCTGCTGTCGCGGGTGTCGGTGCCATTGATGTTCGTGCTGCTGTTGGTGTCCATGTACATCGCCACCCGCGATGCCGGTGGCTTTGCCGGCCTGGCTGCAGTCGTCCCGCATGAAACCATGACCTTTTCGGCGGCAGTGACCATGGTCTTCGGCACCTTCGCCAGTGGCGCCACCCAGGCCACCAACTGGACACGGCTGGCACGCAGTGGCCGGGTAGCGGTGATCGCCAGCGGGGTGGCATTCCTCCTTGGCAACGGCCTGATGGTGGTGGCCGGGGCGTGGTGCGCGATGGTTTACCAGCAGGCCGATATCGTCGACGTGATGATGCTGCAGGGCCTGTCGTTCGCGGCCGTGGTTATGCTGTGCCTAAACCTGTGGACCATTCAGGGGCCGAC > AE015451/3616073‑3616522 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |