New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 208067 | NA (NA) | 5 (0.090) | 5/326 | NT | NA | coding (13573/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
? | AE015451 | = 209370 | NA (NA) | coding (14876/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
CAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACAGCCGACCAGACTTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AE015451/207826‑208067 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggtcgtgaGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTACCGACGTCCGCACCTCCAACGGTTGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGGTGCCG < AE015451/209370‑209140 CAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACAGCCGACCAGACTTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGG < 1:761030/236‑1 CAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACAGCCGACCAGACTTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGA < 1:857112/227‑1 ACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACAGCCGACCAGACTTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGG < 2:817388/208‑1 TGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACAGCCGACCAGACTTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTC > 1:176642/1‑193 TGTCGGAAAGTGCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACAGCCGACCAGACTTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGT < 1:287888/233‑1 CGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACAGCCGACCAGACTTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGG < 2:768423/188‑1 CAAGTGCGAACAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACAGCCGACCAGACTTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGG < 1:163328/185‑1 CGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACAGCCGACCAGACTTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACGGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCCGGTCtcg > 1:523830/1‑181 TCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACAGCCGACCAGACTTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGAGCCAGCGGCT > 1:131784/1‑166 ACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACAGCCGACCAGACTTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCG < 2:131782/148‑1 GTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACAGCCGACCAGACTTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGAGCCAGCGGC < 2:71650/158‑1 gtcACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACCGCCGACCAGACTTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTT < 1:1083258/156‑1 CGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACAGCCGACCAGACTTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTC < 2:868925/159‑1 aCCGACCACACTTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTG < 1:980170/83‑1 ACCAGACCTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTC < 2:1073706/77‑1 AGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGA > 2:584648/1‑63 ACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTTGCTCACGACCTGGTCGTG < 2:594115/52‑1 GGTCGTGAGCCAGAGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGACGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCT < 1:138698/174‑1 GTCGTGGGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCT < 2:763869/53‑1 GTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTTTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTACCGACGTCCGCACCTCCAACGGTTGCGATCGA < 2:935594/213‑1 GTCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACA < 2:493070/31‑1 TCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACGGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCT < 1:928481/143‑1 TCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGTGGGTGATAGAGACATTTACCAGGTCG > 1:861190/1‑99 TCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTACCGACGTCCGCACCTCCAACGGTTGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGGTGCC > 1:462237/1‑236 TCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTACCGACGTCCGCACCTCCAACGGTTGCGAT < 2:334150/209‑1 TCGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCCACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCT > 2:928478/1‑143 CGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTACCGACGTCCGCACCTCCAACGGTTGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGGTGCC > 1:562467/1‑235 CGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTACCGACGTCCGCACCTCCAACGGTTGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGGTG > 2:458287/1‑233 CGTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTACCGACGTCCGCACCTCCAACGGTTGCGAT < 2:1043770/208‑1 GTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTACCGACGTCCGCACCTCCAACGGTTGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGGTGCCG < 1:696880/235‑1 GTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTACCGACGTCCGCACCTCCAACGGTTGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGGTGCC > 2:557113/1‑234 GTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTC > 1:920091/1‑49 GTGAGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTC < 2:920088/49‑1 GAGCAAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTG < 1:949039/159‑1 CAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTCACCATCACAGCCGACCAGACTTCGGTGGCCGAGAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AE015451/207826‑208067 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggtcgtgaGCCAGCGGCTGGTTGACGTGAACAGTGAAGGTCGGTTTGACGTTCTCGGCTACCGAAGTCTGGTCGGCGGTGATGGTGACCTTGACCAGGTCGCCTTCGTTGCCTGGGGTACCCGGCTCGTCGGTGACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCGAGTGTCAGTTGCTCGAACTTACCGACGTCCGCACCTCCAACGGTTGCGATCGACATCACGACAGGGTCGTTGGTGCCG < AE015451/209370‑209140 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |