| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ? | AE015451 | 5218 = | 66 (1.210) | coding (1165/1371 nt) | trmE | GTPase | |||||
GCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCA > AE015451/4903‑5367 | gCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCC < 1:768096‑M1/236‑1 (MQ=255) tCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCAc < 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tGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGct < 1:24638/236‑1 (MQ=255) cAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGc > 2:948472/1‑233 (MQ=255) ttCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGgcg < 1:823302/235‑1 (MQ=255) cAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGctggcctgg < 2:1085508/231‑1 (MQ=255) tCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCg > 1:1072330‑M2/1‑235 (MQ=255) ccTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGc > 2:1059710/1‑190 (MQ=255) tAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCggcgg > 1:522141‑M2/1‑231 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cgcTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCaa > 2:283528/1‑156 (MQ=255) gcTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGa > 2:638527/1‑232 (MQ=255) gcTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGc > 1:302870/1‑235 (MQ=255) gcTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCACGCGCCCGCCAAGGTCACTTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCacg > 2:1054867/1‑202 (MQ=255) 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cccAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGCTGGTcccg > 2:603846/1‑188 (MQ=255) ccggcgcATGCTGTGCCTGGCGTACGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACgg < 2:703290/71‑1 (MQ=255) gcgcATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCggcgggcgcgggagagcttctggctgagga > 2:805922‑M2/1‑120 (MQ=255) cgcATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATCCAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGgc > 1:80956/1‑216 (MQ=255) cATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCAAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCActc < 1:256251/137‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tgCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCa < 1:451747/235‑1 (MQ=255) tgggttatgagcagactgcagagagtggcttcaGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCGCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCCCTCTCTGCAGTCTGCGCATAACCCATCCCgcctctc < 1:885767‑M1/129‑4 (MQ=255) gCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATc < 1:823560/236‑1 (MQ=255) gCCTGGCGTAAGGCCTCAGCCAGACGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATc < 1:119967/236‑1 (MQ=255) ccTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCGCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCCGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGgc < 1:867214/205‑1 (MQ=255) cgggCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATc < 2:599100/232‑1 (MQ=255) tGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCggcgggccctgg < 1:219784‑M2/118‑13 (MQ=255) tGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCgg > 1:318964/1‑171 (MQ=255) 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aGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGc < 2:777271/107‑1 (MQ=255) aGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGCCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGc < 1:327406/107‑1 (MQ=255) ccAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGaa > 1:713412/1‑103 (MQ=255) ccAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGaa < 2:713409/103‑1 (MQ=255) agagagtggcttcaGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGt < 2:621660‑M1/147‑1 (MQ=255) gcgctcCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAg < 2:312478/151‑1 (MQ=255) gCTCTCCCGCGCCCGCCggcgccatctggatgccttgcgccaggccagcgagcacctggagcacggccgtgctcaattgaccttggcgggcgcgggagagcttctggctgaggacttacgccaggcacagcatgcgctgggggagatcacaggagcattcagctcggatgacctgcttgggcggattttctccagcttctgcatcggcaagtaatccacagccacgcaaggccaa > 1:1037908‑M1/1‑17 (MQ=255) gCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGGAGCCCCTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCCTACCGCCCTTCa > 2:108458/1‑138 (MQ=255) tctcCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTcacc < 1:153690/236‑1 (MQ=255) cgcgCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACa > 2:972897/1‑123 (MQ=255) cgcgCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCa < 1:423355/236‑1 (MQ=255) GCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCATGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACAt > 2:485242‑M1/1‑193 (MQ=255) | GCTCCCACAGGTGCTTGGGTCAGCGGCCTGCATTCATCTTCTGCAACGAATTTCAGGCAAAAAAAAGCCGCTCCCTAAGGAGCGGCGCTTGGCCTTGCGTGGCTGTGGATTACTTGCCGATGCAGAAGCTGGAGAAAATCCGCCCAAGCAGGTCATCCGAGCTGAATGCTCCTGTGATCTCCCCCAGCGCATGCTGTGCCTGGCGTAAGTCCTCAGCCAGAAGCTCTCCCGCGCCCGCCAAGGTCAATTGAGCACGGCCGTGCTCCAGGTGCTCGCTGGCCTGGCGCAAGGCATCCAGATGGCGCCGGCGGGCGCTGAAGCCACTCTCTGCAGTCTGCTCATAACCCATACAGCCTTTCAGATGGTCGCGGAGCAGTTGCAGCCCTGTGTCGTCGCCCTTGGCGCTCAGGGTAATGGTCACATGGCCGTCATCGCACTGTTCCAGCGCTACCCGCTCACCACTCA > AE015451/4903‑5367 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |