New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 248876 = | 46 (0.800) | 6 (0.120) | 6/302 | NT | 14.4% | coding (457/633 nt) | PP_0198 | putative transporter |
? | AE015451 | 248896 = | 31 (0.610) | coding (477/633 nt) | PP_0198 | putative transporter |
AGTGGTTTGGCGTCGGCTACCTTGTGTACCTGGCCTACAAGCAGTGGCGTGCCCTGCCGATGGACATGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGTTGCGCATGCTGCGCACGCCCAAACAGCAGAAGCGTTTGAACCGCACCTTTGCCGGGTTGTTCATTGGTGCAGCCACCTTCCTCGCGACCTTGCGCCGCGCGCCGGTCTGACAGACCGCATACAGGCCATTCGCGGGCAAACCCGCGATTGGCCCATCACTATTTC > AE015451/248646‑249107 | ggTGGTTTGGCGGCGGCTACCTTGTGTACCTGGCCTCCAAGCAGTGGCGTGCCCTGCCGATGGACATGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTg < 1:399203/235‑1 (MQ=255) gTGGTTTGGCGTCGGCTACCTTGTGTACCTGGCCTACAAGCAGTGGCGTGCCCTGCCGATGGACATGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTg < 2:842410/235‑1 (MQ=255) tttGGCGTCGGCTCCCTTGTGTACCTGGCCTCCAAGCAGTGGCGTGCCCTGCCGATGGACATGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCAc < 1:153700/227‑1 (MQ=255) aCCTTGTGTACCTGGCCTACAAGCAGTGGCGTGCCCTGCCGATGGACATGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTc < 2:876131/233‑1 (MQ=255) tgtgTACCTGGCCTACAAGCAGTGGCGTGCCCTGCCGATGGACAGGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGtgatcg < 1:15960/233‑6 (MQ=255) tACCTGGCCTACAGGCAGTGGCGTGCCCTGCCGATGGACATGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCAc < 1:245074/221‑1 (MQ=255) cTGGCCTACAAGCAGTGGCGTGCCCTGCCGATGGACATGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGAt > 1:838250/1‑236 (MQ=255) ggccaatcgcgggtttgcccgcgaatggcctgtatgcggtctgtcagaccggcgcgcggcgcaaggtcgcgaggaaggtggctgcaccaatgaacaacccggcaaaggtgcggttcaaacgcttctgctgtttgggcgtgcgcagcatgcgcaacacatgcgaagccaacctggtgtatcccgccatcaccagcaggtcgACCGTGACCATGGTCAc < 1:1024159‑M1/17‑1 (MQ=255) ccTACAAGCAGTGGCGTGCCCTGCCGATGGACATGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTgg < 1:930619/228‑1 (MQ=255) cAAGCAGTGGCGTGCCCTGCCGATGGACATGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACgg > 2:469127/1‑212 (MQ=255) cAAGCAGTGGCGTGCCCTGCCGATGGACATGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACgg < 1:469130/212‑1 (MQ=255) aGTGGCGTGCCCTGCCGATGGACATGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGa < 2:741377/222‑1 (MQ=255) ggggCGTGCGCTGCCGATGGACATGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGATGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGa < 1:313327/192‑1 (MQ=255) cccTGCCGATGGTCATGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGtga < 2:661183/201‑3 (MQ=255) ccTGCCGATGGACATGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCAt > 2:1026246/1‑189 (MQ=255) ccTGCCGATGGACATGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACctgct < 2:116115/207‑1 (MQ=255) cGATGGACATGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGa > 2:1043501/1‑207 (MQ=255) cGATGGACATGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGtt < 2:833101/226‑1 (MQ=255) cGATGGACATGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGtt > 1:833104/1‑226 (MQ=255) gATGGACATGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCAtg < 1:939403/236‑1 (MQ=255) cGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGt > 2:447824/1‑180 (MQ=255) gATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCa < 1:901568/160‑1 (MQ=255) gtcagaccggcgcgcggcgcaaggtcgcgaggaaggtggctgcaccaatgaacaacccggcaaaggtgcggttcaaacgcttctgctgtttgggcgtgcgcagcatgcgcaacacatgcgaagccaacccggtgtatcccgccatcaccagcaggtcgACCGGGACCATg < 2:98861‑M1/12‑1 (MQ=255) gaccggcgggcggcgcaaggtcgcgaggaaggtggctgaaccaatgaacaacccggcaaaggtgcggttcaaacgcttctgctgtttgggcgtgcgcagcatgcgcaacacatgcgaagccaacccggtgtatcccgccatcaccagcaggtcgACCGTGACCATGGTCAc > 1:196642‑M1/155‑171 (MQ=255) cgcgcggcgcaaggtcgcgaggaaggtggctgcaccaatgaacaacccggcaaaggtgcggttcaaacgcttctgctgtttgggcgtgcgcagcatgcgcaacacatgcgaagccaacccggtgtatcccgccatcaccagcaggtcgACAGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGtt < 2:877595‑M1/68‑1 (MQ=255) cgcggcgcaaggtcgcgaggacggtggctgcaccaaggaacagcccggcaaaggtgcggttcaaacgcttctgctgtttgggcgtgcgcagcatgcgcaacacatgcgaagccaacccggtgtatcccgccatcaccagcaggtcgACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACAcc > 1:290164‑M1/147‑194 (MQ=255) cgcggcgcaaggtcgcgaggaaggtggctgcaccaatgaacaacccggcaaaggtgcggttcaaacgcttctgctgtttgggcgtgcgcagcatgcgcaacacatgcgaagccaacccggtgtatcccgccatcaccagccggtcgCCCGCGAccacg < 2:252409‑M1/12‑3 (MQ=255) cgcggcgcaaggtcgcgaggaaggtggctgcaccaatgaacaacccggcaaaggtgcggttcaaacgcttctgctgtttgggcgtgcgcagcatgcgcaacacatgcgaagccaacccggtgtatcccgccatcaccagcaggtcgACCGTg > 1:845025‑M1/147‑152 (MQ=255) gcgcCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGTTgcgc < 1:128226/217‑1 (MQ=255) ccGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTg > 2:561627/1‑147 (MQ=255) ccGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTg < 1:561630/147‑1 (MQ=255) cAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCgg < 2:169842/183‑1 (MQ=255) ggctgcaccaatgaacaacccggcaaaggtgcggttcaaacgcttctgctgtttgggcgtgcgcagcatgcgcaacacatgcgaagccaacccggtgtatcccgccatcaccagcaggtcgACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCAtg < 1:675178‑M1/64‑1 (MQ=255) cTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCg < 1:32212/180‑1 (MQ=255) 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ggttcaaccgcttctgctgtttgggcgggcgcagcctgagcaacacatgcgaagccaccccggtgtatcccgccatcaccagcagggcgACCGTGACCATGGTCACGGTCGACctgct > 2:202252‑M1/90‑118 (MQ=255) aCCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGTTGCGCATGCTGCGCACGCCCAAACAGCAGAAGCGTTTGAACCGCACCTTTGCCGGGTTGTTCATTGGTGCAGCCACCTTCCt > 1:391289/1‑235 (MQ=255) tGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGTTGCGCATGCTGCGCACGCCCAAACAGCAGAAGCGTTTGAACCGCACCTTTGCCGGGTTGTTCATTGGTGCAGCCACCTTCCTCGCGACCTTgcgc > 1:452429/1‑236 (MQ=255) gtgtTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGTTGCGCATGCTGCGCACGCCCAAACAGCAGAAGCGTTTGAACCGCACCTTTGCCGGGTTGTTCATTGGTGCAGCCACCTTCCTCGCGACCTTGcgccg < 1:95877/236‑1 (MQ=255) tgtTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGTTGCGCAtg > 2:769867/1‑146 (MQ=255) ggTGCTGCCGCAGTTCCTCACTCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGTTGCGCATGCTGCGCACGCCCAAACAGCAGAAGCGTTTGAACCGCACCTTTGCCGGGTTGTTCATTGGTGCAGCCACCTTCCTCGCGACCTTGCGCCGCGCGCCGGTCTGAc < 1:147755/236‑1 (MQ=255) ggTGCTGCCGCAGTGCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATAGGTGGCGATCACCGTGAACATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCtt < 1:51243/116‑1 (MQ=255) ccGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGTTGCGCATGCTGCGCACGCCCAAACAGCAGAAGCGTTTGAACCGCACCTTTGCCGGGTTGTTCATTGGTGCAGCCACCTTCCTcgcta > 2:516346/1‑203 (MQ=255) aacacatgcgaagccaacccggtgtatcccgccatcaccagcaggtcgACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGTTGCGCATGCTGCGCACGCCCAAAcagca < 1:877598‑M1/95‑1 (MQ=255) 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cgccgcTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGTTGCGCATGCTGCGCACGCCCAAACAGCAGAAGCGTTTGAACCGCACCTTTGCCGGGTTGTTc < 2:282461/158‑1 (MQ=255) tgctgcCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGTTGCGCATGCTGCGCACGCCCAAACAGCAGAAGCGTTTGAACCGCACCTTTGCCGGGTTGTTCATTGGTGCAGCCACCTTCCTCGCGACCTTGCGCCGCGCGCCGGTCTGACAGACCGCATACAGGCCATTCGCGGGCAAACCcgc < 1:34377/235‑1 (MQ=255) ctgcCGCAATATGTGGCGATCCCCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGTTGCGCATGCTGCGCACGCCCAAACAGCAGAAGCGTTTGAACCGCACCTTTGCCGGGTTGTTCATTGGTGCAGCCACCTTCCTCGCGACCTTGcgccg < 2:292235/185‑1 (MQ=255) cGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGTTGCGCATGCTGCGCACGCCCAAACAGCAGAAGCGTTTGAACCGCACCTTTGCCGGGTTGTTCATTGGTGCAGCCACCTTCCTCGCGACCTTGCGCCGCGCGCCGGTCTGACAGACCGCATACAGGCCATTCGCGGGCAAACCCGCGATTgg < 1:947487/235‑1 (MQ=255) atGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGTTGCGCATGCTGCGCACGCCCAAACAGCAGAAGCGTTTGAACCGCACCTTTGCCGGGTTGTTCATTGGTGCAGCCACCTTCCTCGCGACCTTGCGCCGCGCGCCGGTCTGACAGACCGCATACAGGCCATTCGCGGGCAAACCCGCGAt < 1:447827/226‑1 (MQ=255) gCGGTCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGTTGCGCATGCTGCGCACGCCCAAACAGCAGAAGCGTTTGAACCGCACCTTTGCCGGGTTGTTCATTGGTGCAGCCACCTTCCTCGCGACCTTGCGCCGCGCGCCGGTCTGAc < 2:500292/184‑1 (MQ=255) gATCACCGTTACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGTTGCGCATGCTGCGCACGCCCAAACAGCAGAAGCGTTTGAACCGCACCTTTGCCGGGTTGTTCATTGGTGCAGCCACCTTCCTCGCGACCTTGCGCCGCGCGCCGGTCTGACAGACCGCATACAGGCCATTCGCGGGCAAACCcgc < 1:66659/216‑1 (MQ=255) acgACCGTGACCATGGTCACGGTCGGCGTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGTTGCGCAtgctgc > 1:896379‑M1/4‑82 (MQ=255) aTCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGTTGCGCATGCTGCGCACGCCCAAACAGCAGAAGCGTTTGAACCGCACCTTTGCCGGGTTGTTCATTGGTGCAGCCACCTTCCTCGCGACCTTGCGCCGCGCGCCGGTCTGACAGACCGCATACAGGCCATTCGCGGGCAAACCCGCGATTGGCCCATCACTATTtc > 1:1038959/1‑235 (MQ=255) gACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGTTGCGCATGCTGCGCACGCCCAAACAGCAGAAGCGTTTGAACCGCACCTTTGCCGGGTTGTTCATTGGTGCAGCCACCTTCCTCGCGACCTTGCGCCGCGCGCCGGTCTGACAGACCGCATACAGGCCATTCGCGGGCAAACCCGCGa < 1:533154‑M1/214‑1 (MQ=255) | AGTGGTTTGGCGTCGGCTACCTTGTGTACCTGGCCTACAAGCAGTGGCGTGCCCTGCCGATGGACATGAGCGATGAATCAGGCGTGCGCCCGATCGGCAAGCCGCTGAGCCTGGTGTTCCGTGGTTTCCTGGTCAACATCAGCAACCCCAAGGCGCTGGTGTTCATGCTGGCGGTGCTGCCGCAGTTCCTCAATCCCCATGCGCCGCTGCTGCCGCAATATGTGGCGATCACCGTGACCATGGTCACGGTCGACCTGCTGGTGATGGCGGGATACACCGGGTTGGCTTCGCATGTGTTGCGCATGCTGCGCACGCCCAAACAGCAGAAGCGTTTGAACCGCACCTTTGCCGGGTTGTTCATTGGTGCAGCCACCTTCCTCGCGACCTTGCGCCGCGCGCCGGTCTGACAGACCGCATACAGGCCATTCGCGGGCAAACCCGCGATTGGCCCATCACTATTTC > AE015451/248646‑249107 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |