New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 1015817 = | 47 (0.820) | 4 (0.070) | 4/324 | NT | 8.1% | coding (424/1431 nt) | PP_0875 | conserved protein of unknown function |
? | AE015451 | 1015933 = | 46 (0.840) | coding (308/1431 nt) | PP_0875 | conserved protein of unknown function |
GTATTTTCGTAGATCGATACGCCCAGCGCCTCCACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTGCGGCGAGAGGGTGCCGAGCAGGCGGTCTTCGCCGAGCAGGTTGCCCATCAGCCAGCCCCCATTACGGCCGGAGGCGCCGAAGCCGGCGATTTGGGCTTCAATCACCGCGATG > AE015451/1015582‑1016049 | cgctgtgcgcgcgcccggcactgcgcaatgacctcgacgttgacgtgtgcatcatcggtgccggctataccggcctttggaccgcgtactacctcaagcgccaggccccccagctgaacatcgcggtgattgaagcccaaatcgccggcttcggcgcctccggccgtaatgggggctggctgatgggcaacctgctcggcgaagaccgcctgctcggcaccctctcgccgcaacag > 1:719872‑M1/236‑236 (MQ=255) aTCGATACGCCCAGCGCCTCCACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATa > 1:586141/1‑236 (MQ=255) gcCTCCACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCtt > 1:291768/1‑235 (MQ=255) cccGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAgcgcg < 2:670342/201‑1 (MQ=255) cGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAgcgcg < 2:610567/199‑1 (MQ=255) cGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGAc < 1:172027/215‑1 (MQ=255) cGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCa > 1:948590/1‑236 (MQ=255) ggCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGt < 1:345212/236‑1 (MQ=255) aaGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCg > 1:262786/1‑235 (MQ=255) gcgcACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCtt < 1:21230/236‑1 (MQ=255) atcatcggtgccggctataccggcctttggaccgcgtactacctcaagcgccaggccccccagctgaacatcgcggtgattgaagcccaaatcgccggcttcggcgcctccggccgtaatgggggctggctgatgggcaacctgctcggcgaagaccgcctgctcggcaccctctcgccgcaacag > 1:33741‑M1/186‑186 (MQ=255) cAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCttt < 1:170954/236‑1 (MQ=255) aGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAgcgcg < 2:880504/181‑1 (MQ=255) cgggATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCGCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAgcgcg < 2:109177/168‑1 (MQ=255) gATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTgcag > 2:1034853/1‑225 (MQ=255) gTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAg < 2:591817/195‑1 (MQ=255) gtgtGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAACGGAcgccg > 1:354461/1‑177 (MQ=255) cgcgtactacctcaagcgccaggccccccagctgaacatcgcggtgattgaagcccaaatcgccggcttcggcgcctccggccgtaatgggggctggctgatgggcaacctgctcggcgaagaccgcctgctcggcaccctctcgccgcaacaGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCggg > 1:751633‑M1/154‑236 (MQ=255) gCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTCGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCATGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGcgcgccg > 1:133088/1‑152 (MQ=255) aaTGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTg > 2:1064816/1‑198 (MQ=255) cgccaggccccccagctgaacatcgcggtgattgaagcccaaatcgccggcttcggcgcctccggccgtaatgggggctggctgatgggcaacctgctcggcgcagaccgcctgctcggcaccctctcgccgcaacaGcgcc < 2:157534‑M1/5‑1 (MQ=255) ccAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTgca > 1:749968/1‑226 (MQ=255) aagCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTc < 2:625577/179‑1 (MQ=255) aTTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTggcg < 1:621219/235‑1 (MQ=255) gCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCtt > 1:867662/1‑173 (MQ=255) gCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATg > 1:438498/1‑192 (MQ=255) gACCCGCATCTGGCTCCCCAGCTGCGCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTGCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTgcagc < 1:269436/181‑1 (MQ=255) cGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTg > 1:268833/1‑222 (MQ=255) gCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCCATGCCTTCGCTTTgc > 2:597957/1‑173 (MQ=255) cgggCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGGCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGt < 2:152107/174‑1 (MQ=255) cTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTgcggc > 1:595541/1‑235 (MQ=255) cTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGACGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCCCg > 2:586748/1‑175 (MQ=255) tGGCTCCCCAGCTGTTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTgcggcg < 1:64743/235‑1 (MQ=255) ctgctCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTgcggcg < 2:948587/224‑1 (MQ=255) cGGGGCGCAGCCCGCGGTAGGCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTgcggc < 2:329656/218‑1 (MQ=255) ggCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTGCGGCGAGAGGGTGCCGAGCAGGc > 2:455790/1‑234 (MQ=255) ccagcGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAGGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGc < 2:146668/154‑1 (MQ=255) gTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGGAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGCTGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTGCGGCGGGAgggc > 1:208940/1‑209 (MQ=255) cgtcCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATg < 1:538542/119‑1 (MQ=255) cgtcCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATg > 2:538539/1‑119 (MQ=255) cTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTgcggc > 1:656625/1‑193 (MQ=255) ggTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCCTCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTggcgcggcg > 2:81595/1‑180 (MQ=255) ccTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTggcgcggcgc < 1:988897/174‑1 (MQ=255) ttGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCg < 2:850456/137‑1 (MQ=255) ttGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCg > 1:850459/1‑137 (MQ=255) ttGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTGCGGCGAGAGGGTGCCGAGCa > 2:499518/1‑197 (MQ=255) aTACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTGCGGCGAGAGGGTGCCGAGCAGGCGGTCTTCGCCGAGCAGGTTGCCCATCAGCCAGCCCCCATTAc > 1:460229/1‑236 (MQ=255) gcaacctgctcggcgaagaccgcctgctcggcaccctctcgccgcaacaGCGCCGCGCAATACAGGACGCCGCCTTTGCGGGAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCCTCCGGGCTGCCGTGCAGCCGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTGCGGCGAGAGGGTGCCGAGCCGGCg < 1:3171‑M1/145‑1 (MQ=255) aCAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTGCGGCGAGAGGGTGCCGAGCAGGCGGTCTTCGCCGAGCAGGTTGCCCATCAGCCAGCCCCCATTACgg < 1:1067369/236‑1 (MQ=255) aaGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCggg > 2:98358/1‑129 (MQ=255) tgctcggcgaagaccgcctgctcggcaccctctcgccgcaacaGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATTCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTGCGGCGAGAGGGTGCCGAGCAGGCGGTCTTCGCCGAGCAGGTTGCCCATcagccag < 1:855908‑M1/176‑1 (MQ=255) gtcgAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTggcgcggc < 2:41984/155‑1 (MQ=255) ggTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTGCGGCGAGAGGGTGCCGAGCAGGCGGTCTTCGCCGAGCAGGTTGCCCATcagcc > 2:779420/1‑210 (MQ=255) cgcgcAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTGCGGCGAGAGGGTGCCGAGCAGGCGGTCTTCGCCGAGCAGGTTGCCCATCAGCCAGCCCCCAtt > 2:1017162/1‑214 (MQ=255) gcgcAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTGCGGCGAGAGGGTGCCGAGCAGGCGGTCTTCGCCGAGCAGGTTGCCCATCAGCCAGCCCCCATTACGGCCGGAGGCGCCGAAGCCg > 1:622680/1‑235 (MQ=255) gcgcAGGCTGCGTTCCTGCGCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGCCGCCGCCTTGGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTGCGGCgag < 2:708354/157‑1 (MQ=255) gctcggcaccctctcgccgcaacaGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTGCGGCGAGAGGGTGCCGAGCAGGCGGTCTTCGCCGAGCAGGTTGCCCATCAGCCAGCCCCCATTACGGcc < 1:1081151‑M1/190‑1 (MQ=255) tCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTGCGGCGAGAGGGTGCCGAGCAGGCgg > 2:160822/1‑156 (MQ=255) aGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTgcagc < 2:884983/65‑1 (MQ=255) aGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTgcagc > 1:884986/1‑65 (MQ=255) aGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTGCGGCGAGAGGGTGCCGAGCAGGCGGTCTTCGCCGAGCAGGTTGCCCATcc > 2:854708/1‑173 (MQ=255) gcgcgcCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTGCGGCGAGAGGGTGCCGAGCAGGCGGTCTTCGCCGAGCAGGTTGCCCATCAGCCAGCCCCCATTACGGCCGGAGGCGCCGAAGCCGGCGATTTGGGCTTCAATCACCGCGATg < 1:653946/235‑1 (MQ=255) | GTATTTTCGTAGATCGATACGCCCAGCGCCTCCACTGCCCGGGCAAGGCCGCGCACCAGCTTGGCTGGCTGGATGGTCGCCGTGTGCGGGCTGTAAATGGCTCCAAACGCATTGCTGACCCGCAGCTGGCTCCCCAGCTGCTCGGGGCTCAGCCAGCGGTAGTCGTCCTCGGTCATGCCTTGGCGATACAAGTCGTCGAGGTAGGCGCGCAGGCTGCGTTCCTGCTCCGGGTAGCGCGCCGCGCAATAAAGGACGCCGCCTTTGCGGTAGTCGCAGTCGATGCCTTCGCTTTGCAGCACGTGATGCACTTCATCCGGGATGCCGTGCAGCAGGTCGATGCTGGCGCGGCGCTGTTGCGGCGAGAGGGTGCCGAGCAGGCGGTCTTCGCCGAGCAGGTTGCCCATCAGCCAGCCCCCATTACGGCCGGAGGCGCCGAAGCCGGCGATTTGGGCTTCAATCACCGCGATG > AE015451/1015582‑1016049 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |