New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 2274562 = | 28 (0.490) | 4 (0.070) | 4/332 | NT | 12.5% | coding (928/1119 nt) | PP_2005 | conserved exported protein of unknown function |
? | AE015451 | 2274588 = | 29 (0.520) | coding (902/1119 nt) | PP_2005 | conserved exported protein of unknown function |
CAACCGACAGTTCGCCCAGGCGCACGCGGGGGCGGGCCATGGGTTTACAACCACACATTCAACAGGCGGGCGCCTGGGCTGGGGGGGCCGGCGAGCAACGCTCCCGACTGGCGAGCAAAGCCCTGGCCATCGCTGCCCTGTTCCCAGAACTGCCCGCGCATGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTGGCGACCAGTTGTACGGCTTGTTCAGTCAGTTGCTGGTGGTTTTCCGGGTACCAGCTGTCACTGCCCACCAGTATCCCGAGG > AE015451/2274327‑2274740 | aatatcccgacagtgaaatgcgccgctacgtccaccacggccgccagcacccgctgcaggtcgtgcagaccccggccgggcgcctcgggatactggtgggcagtgacagctggtacccggaaaaccaccagcaactgactgaacaagccgtacaactggtcgccaacccggcgtttctcagtggcaagggcagctggcaagcaccctggcggggaaatcgccatcaggatgccagc < 1:766071‑M1/1‑1 (MQ=255) cccgacagtgaaatgcgccgctacgtccaccacggccgccagcacccgctgcaggtcgtgcagaccccggccgggcgcctcgggatactggtgggcagtgacagctggtacccggaaaaccaccagcaactgactgaacaagccgtacaactggtcgccaacccggcgtttctcagtggcaagggcagctggcaagcaccctggcggggaaatcgccatcaggatgccagcgccg > 1:788869‑M1/231‑235 (MQ=255) aGGCGGGCGCCTGGGCTGGGGGGGCCGGCGAGCAACGCTCCCGACTGGCGAGCAAAGCCCTGGCCATCGCTGCCCTGTTCCCAGAACTGCCCGCGCATGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGc > 1:451500/1‑225 (MQ=255) gcgcCTGGGCTGGGGGGGCCGGCGAGCAACGCTCCCGACTGGCGAGCAAAGCCCTGGCCATCGCTGCCCTGTTCCCAGAACTGCCCGCGCATGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGca > 2:826162/1‑235 (MQ=255) gcCTGGGCTGGGGGGGCCGGCGAGCAACGCTCCCGACTGGCGAGCAAAGCCCTGGCCATCGCTGCCCTGTTCCCAGAACTGCCCGCGCATGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGc > 1:401947/1‑236 (MQ=255) ctgggctgggGGGGCCGGCGAGCAACGCTCCCGACTGGCGAGCAAAGCCCTGGCCATCGCTGCCCTGTTCCCAGAACTGCCCGCGCATGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGgcgc < 1:813156/189‑1 (MQ=255) gggCCGGCGAGCAACGCTCCCGACTGGCGAGCAAAGCCCTGGCCATCGCTGCCCTGTTCCCAGAACTGCCCGCGCATGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTga > 1:578592/1‑235 (MQ=255) gCCGGCGAGCAACGCTCCCGACTGGCGAGCAAAGCCCTGGCCATCGCTGCCCTGTTCCCAGAACTGCCCGCGCATGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCcgcg > 2:813153/1‑156 (MQ=255) ggCGAGCAACGCTCCCGACTGGCGAGCAAAGCCCTGGCCATCGCTGCCCTGTTCCCAGAACTGCCCGCGCATGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTg > 2:428851/1‑156 (MQ=255) gCGAGCAACGCTCCCGACTGGCGAGCAAAGCCCTGGCCATCGCTGCCCTGTTCCCAGAACTGCCCGCGCATGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGcgc > 2:227793/1‑156 (MQ=255) gAGCAACGCTCCCGACTGGCGAGCAAAGCCCTGGCCATCGCTGCCCTGTTCCCAGAACTGCCCGCGCATGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGcc < 1:826165/235‑1 (MQ=255) cAACGCTCCCGACTGGCGAGCAAAGCCCTGGCCATCGCTGCCCTGTTCCCAGAACTGCCCGCGCTTGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCg < 2:572220/233‑1 (MQ=255) gCTCCCGACTGGCGATCAAAGCCCTGGCCATCGCTGCCCTGTTCCCAGAACTGCCCGCGCATGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTcgccg > 2:515573/1‑141 (MQ=255) gCTCCCGACTGGCGAGCAAAGCCCTGGCCATCGCTGCCCTGTTCCCAGAACTGCCCGCGCATGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTg < 2:648884/234‑1 (MQ=255) ccTGGCCATCGCTGCCCTGTTCCCAGAACTGCCCGCGCATGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTGGCGACCAGTTGTACGGCTTGTtc < 1:764017/235‑1 (MQ=255) ccGCGCATGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGAt > 2:201434/1‑121 (MQ=255) ccGCGCATGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTGGCGACCAGt > 1:290105/1‑189 (MQ=255) ccGCGCATGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTGGCGACCAGTTGTACGGCTTGTTCAGTCAGTTGCtggtg > 2:680890/1‑218 (MQ=255) ccGCGCATGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTGGCGACCAGTTGTACGGCTTGTTCAGTCAGTTGCTGGTGGTTTTCCGGGTACCAg > 1:22135/1‑234 (MQ=255) ccGCGCATGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTGGCGACCAGTTGTACGGCTTGTTCAGTCAGTTGCTGGTGGTTTTCCGGGTACCAGc > 1:916077/1‑235 (MQ=255) gcgcATGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTGGCGACCAGTTGTACGGCTTGTTCAGTCAGTTGCTGGTGGTTTTCCGGGTACCAGCTg > 1:809680/1‑235 (MQ=255) tGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTGGCGACCAGTTGTACGGCTTGTTCAGTCAGTTGCTGGTGGTTTTCCGGGTACCAGCTGTCACTg > 1:9043/1‑236 (MQ=255) tgctgcTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTGGCGACCAGTTGTACGGCTTGTTCAGTCAGTTGCTGGTGGTTTTCCGGGTACCAGCTGTCACTGCCCACCAGTATc > 1:751744/1‑236 (MQ=255) ctgctgATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTGGCGACCAGTTGTACGGCTTGTTCAGTCAGTTGCTGGTGGTTTTCCGGGTACCAGCTGTCACTGCCCACCAGTATcc > 1:756981/1‑235 (MQ=255) caagggcagctggcaagcaccctggcggggaaatcgccatcatgatgccagCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCGTCCGGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTGGCGACCAGt > 1:610293‑M1/52‑158 (MQ=255) ccACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCa > 1:847051/1‑122 (MQ=255) cACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTcgcc > 1:428854/1‑45 (MQ=255) caagcaccctggcggggaaatcgccatcaggaggccagCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCAGCGCTGGCATCCTGATGGCGGTTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGccc < 2:610290‑M1/74‑1 (MQ=255) cctggcggggaaatcgccatcaggatgccagCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTGGCGACCAGTTGTACGGCTTGTTCAGTCAGTTGCTGGTGGTTTTCCGGGTAc > 2:1058164‑M1/32‑180 (MQ=255) cctggcggggaaatcgccatcaggatgccagCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTGGCGACCAGTTGTACGGCTTGTTCAGTCAGTTGCTGGTGGTTTTCCGGGTAc < 1:1058167‑M1/149‑1 (MQ=255) tGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTGGCGACCCGTTGTACGGCTTGTTCAGTCAGTTGCtgggg > 2:312551/1‑159 (MQ=255) gTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTGGc < 1:994793/116‑1 (MQ=255) gTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTGGc > 2:994790/1‑116 (MQ=255) tCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGgcgc < 2:479180/42‑1 (MQ=255) tCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTGGCGACCAGTTGTACGGCTTGTTCAGTCAGTTGCTGGTGGTTTTCCGGGTACCAGCTGTCCCTGCCCACCAGTATCCCGAgg > 2:778069/1‑189 (MQ=255) tGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCGTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTGGCGACCAGTTGTACGGCTTGTTCAGTCAGTTGCTGGTGGTTTTcc > 2:969883/1‑149 (MQ=255) gACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGCGAAACGCCGGGTTGGCGACCAGTTGTACGGCTTGTTCAGTCAGTTGCTGGTGGTTTTCCGGGTACCCGCTGTCACTTCccacca > 2:138122/1‑173 (MQ=255) ttCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATg > 1:479183/1‑42 (MQ=255) tCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTGGCGACCAGTTGTACGGCTTGTTCAGTCAGTTGCTGGTGGTTTTCCGGGTGCCAGCTGt > 2:993912/1‑157 (MQ=255) | CAACCGACAGTTCGCCCAGGCGCACGCGGGGGCGGGCCATGGGTTTACAACCACACATTCAACAGGCGGGCGCCTGGGCTGGGGGGGCCGGCGAGCAACGCTCCCGACTGGCGAGCAAAGCCCTGGCCATCGCTGCCCTGTTCCCAGAACTGCCCGCGCATGAACACGCTCATGCTGCTGATGCCGGTTCCGGCCACTTCGGTCAGGCGTTGCCAAGCCGTCTGTTCACTGACTTCGCCGCGCTGCAAGGCCAGCCCGGCGCTGGCATCCTGATGGCGATTTCCCCGCCAGGGTGCTTGCCAGCTGCCCTTGCCACTGAGAAACGCCGGGTTGGCGACCAGTTGTACGGCTTGTTCAGTCAGTTGCTGGTGGTTTTCCGGGTACCAGCTGTCACTGCCCACCAGTATCCCGAGG > AE015451/2274327‑2274740 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |