New junction evidence | |||||||||||
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cagccagacgcatcgctggggcgaaacccaggtctatgcctgtggcaatgccacgatgatcagccaggcccgcgagcaatgccttgcagcaggggtaccgccccatcgctttgtcgccgaggcctttgtcgccagcggtgcactgacaacgcaggcttcctcagccaacccgctgcaccctgagctggaaaaggtcggcccacgttattcgctggacggcatgctcgCGGCCCGc < 1:492644‑M1/8‑1 (MQ=255) ccATACCGGGCCAACGTCGACCACGACGATGTCCGTGGTACGTAACACGCGTTGAAGGTCAATGCCTTGCCGTGGCGTACGCACGGTATCGTCACCAAAACGGATGTAGGTGGGGTGCCAGGTGTGTGAGGCGCCCATCGCCTGAAGGGTATGCGCGGCCATCTCCAGTGCCTGGGCGGTGGTCATACCGACCTGCAGTTGGCTGGCAATGGCAGCCACGGCCCGCACCGACTGt > 1:1046415/1‑235 (MQ=255) ccATACCGGGCCAACGTCGACCACGACGATGTCCGTGGTACGTAACACGCGTTGAAGGTCAATGCCTTGCCGTGGCGTACGCACGGTATCGTCACCAAAACGGATGTAGGTGGGGTGCCAGGTGTGTGAGGCGCCCATCGCCTGAAGGGTATGCGCGGCCATCTCCAGTGCCTGGGCGGTGGTCATACCGACCTGCAGTTGGCTGGCAATGGCAGCCACGGCCCGCACCGACTGt > 1:529038/1‑235 (MQ=255) cATACCGGGCCAACGTCGACCACGACGATGTCCGTGGTACGTAACACGCGTTGAAGGTCAATGCCTTGCCGTGGCGTACGCACGGTATCGTCACCAAAACGGATGTAGGTGGGGTGCCAGGTGTGTGAGGCGCCCATCGCCTGAAGGGTATGCGCGGCCATCTCCAGTGCCTGGGCGGTGGTCATACCGACCTGCAGTTGGCTGGCAATGGCAGCCACGGCCCGCACCGACTg > 2:547969/1‑233 (MQ=255) tACCGGGCCAACGTCGACCACGACGATGTCCGTGGTACGTAACCCGCGTTGAAGGTCAATGCCTGGCCGTGGCGTACGCACGGTATCGTCACCAAAACGGATGTAGGTGGGGTGCCAGGTGTGTGAGGCGCCCATCGCCTGAAGGGTATGCGCGGCCATCTCCAGTGCCTGGGCGGTGGTCATACCGACCTGCAGTTGGCTGGCAATGGCAGCCACGGCCCGCACCGACTGTTcgc < 1:315963/236‑1 (MQ=255) cAACGTCGACCACGACGATGTCCGTGGTACGTAACACGCGTTGAAGGTCAATGCCTTGCCGTGGCGTACGCACGGTATCGTCACCAAAACGGATGTAGGTGGGGTGCCAGGTGTGTGAGGCGCCCATCGCCTGAAGGGTATGCGCGGCCATCTCCAGTGCCTGGGCGGTGGTCATACCGACCTGCAGTTGGCTGGCAATGGCCGCCACGGCCCGCACCGa > 1:630204/1‑220 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |