New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 4781905 | 54 (0.940) | 5 (0.090) | 5/324 | NT | 9.3% | coding (5409/7887 nt) | pvdJ | non‑ribosomal peptide synthetase (subunit of ferribactin synthase) |
? | AE015451 | = 4781937 | 46 (0.840) | coding (5377/7887 nt) | pvdJ | non‑ribosomal peptide synthetase (subunit of ferribactin synthase) |
AGTGCTCGTGCTCGCGCAGGTTGAGGTTGTGGTCAAGCAGTGACTTGAGCCACGCCTTGGCCGTGACGCCGGCTTCGGCGCCCGGCAACCGGACCCGCAGCGGGATGCTGTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGGCGCGCTGCGCCACCTGCGCGCTTTGCTCGCGGGTCAGGTACACCAGCTCATCGGCCACTGCTGCATGGTTGTGCTCGGCGCTGGCGCTGCGGTCGAACGGCAGCGCGGTCGGCCGCTCGAAACCTTGCAGCTCATTGCGCCAGAAATCACGCGAAGCCTCACGGTCCCATCGCTGCAGCAAGGCGATGAA > AE015451/4781676‑4782135 | aGTGCTCGTGCTCGCGCAGGTTGAGGTTGTGGTCAAGCAGTGACTTGAGCCACGCCTTGGCCGTGACGCCGGCTTCGGCGCCCGGCAACCGGACCCGCAGCGGGATGCTGTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGc < 1:853087/236‑1 (MQ=255) ctcgCGCAGGTTGAGGTTGTGGTCAAGCAGTGACTTGAGCCACGCCTTGGCCGTGACGCCGGCTTCGGCGCCCGGCAACCGGACCCGCAGCGGGATGCTGTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGgtg < 1:885209/235‑1 (MQ=255) ctcgCGCAGGTTGAGGTTGTGGTCAAGCAGTGACTTGAGCCACGCCTTGGCCGTGACGCCGGCTTCGGCGCCCGGCAACCGGACCCGCAGCGGGATGCTGTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGGAACAGGGCCCAGGCGCCTTGccc > 1:106602/1‑226 (MQ=255) tgaggttgTGGTCAAGCAGTGACTTGAGCCACGCCTTGGCCGTGACGCCGGCTTCGGCGCCCGGCAACCGGACCCGCAGCGGGATGCTGTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAAc < 1:892923/236‑1 (MQ=255) gttgTGGTCAAGCAGTGACTTGAGCCACGCCTTGGCCGTGACGCCGGCTTCGGCGCCCGGCAACCGGACCCGCAGCGGGATGCTGTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACtg < 2:470380/234‑1 (MQ=255) tCAAGCAGTGACTTGAGCCACGCCTTGGCCGTGACGCCGGCTTCGGCGCCCGGCAACCGGACCCGCAGCGGGATGCTGTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCcgcctg < 1:331933‑M2/236‑7 (MQ=255) aGCAGTGACTTGAGCCACGCCTTGGCCGTGACGCCGGCTTCGGCGCCCGGCAACCGGACCCGCAGCGGGATGCTGTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCcgcctggg > 2:646188‑M2/1‑227 (MQ=255) tGAGCCACGCCTTGGCCGTGACGCCGGCTTCGGCGCCCGGCAACCGGACCCGCAGCGGGATGCTGTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGgcgc > 1:447507/1‑228 (MQ=255) ccACGCCTTGGCCGTGACGCCGGCTTCGGCGCCCGGCAACCGGACCCGCAGCGGGATGCTGTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCTAGGCGCCTTGCACCA‑ggg < 2:969827/194‑1 (MQ=255) ccGTGCCGCCGGCTTCGGCGCCCGGCAACCGGACCCGCAGCGGGATGCTGTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGGCGCGCTGCGCCACCTGCGCGCTTTGc < 1:145205/236‑1 (MQ=255) cGTGACGCCGGCTTCGGCGCCCGGCAACCGGACCCGCAGCGGGATGCTGTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGGCGCGCTGCGCCACCTGCGCGCTTTGc < 1:14021/235‑1 (MQ=255) aCGCCGGCTTCGGCGCCCGGCAACCGGACCCGCAGCGGGATGCTGTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGGCGCGCTGCGCCACCTGCGCGCTTTGCTcgc < 1:903598/235‑1 (MQ=255) 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aaCCGGACCCGCAGCGGGATGCTGTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGGCGCGCTGCGCCACCTGCGCGCTTTGCTCGCGGGTCAGGTACACCAGCTCATc < 1:78788/236‑1 (MQ=255) aCCGGACCCGCAGCGGGATGCTGTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑ggg < 2:277232/156‑1 (MQ=255) aCCGGACCCGCAGCGGGATGCTGTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGGCGCGCTGCGCCACCTGCGCGCTTTGCTCGCGGGTCAGGTACACCAGCTCATc < 1:512658/235‑1 (MQ=255) cGGACCCGCAGCGGGATGCTGTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGGCGCGCTGCGCCACCTgcgc > 2:904323/1‑200 (MQ=255) gATGCTGTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCcgcctgggcactgttac > 1:335067‑M2/1‑159 (MQ=255) tGCTGTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGGCGCGCCGCGCCa > 1:371448/1‑177 (MQ=255) aggTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGGCGCGCTGCGCCACCTGCGCGCTTTGCTCGCGGGTCAGGTACACCAGCTCATCGGCCACTGCTGCATGGTtgtg < 1:479685/234‑1 (MQ=255) gCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGGCGCGCTGCGCCACCTGCGCGCTTTGCTCGCGGGTCAGGTACACCa > 2:913026/1‑195 (MQ=255) cGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGgtg > 1:309009/1‑122 (MQ=255) cGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGgtg < 2:309006/122‑1 (MQ=255) cGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGAcc > 2:1074248/1‑128 (MQ=255) cGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGgcgcg > 2:850943/1‑151 (MQ=255) cGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGGCGCGCTGCGCCACCTGCGCGCTTTGCTCGCGGGTCAGGTACACCAGCt > 1:990498/1‑195 (MQ=255) cGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGGCGCGCTGCGCCACCTGCGCGCTTTGCTCGCGGGTCAGGTACACCAGCTCATCGGCCActgctg > 2:479682/1‑210 (MQ=255) cGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGAGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGGCGCGCTGCGCCACCTGCGCGCTTTGCTCGCGGGTCAGGTACACCAGCTCATCGGCCACTGCTGCATGGTTGTGCTCggcgctggcgct > 1:560831/1‑235 (MQ=255) tAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCcgcctgg < 2:863100‑M2/140‑8 (MQ=255) tAGCCGGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCcgcctgggcactgttactgcaacgctacagcggcg > 1:515716‑M2/1‑133 (MQ=255) 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gTAACAGTGCCCAGGCGgcacagttgacggtcaacaccctggtgcaaggcgcctgggcactgttactgcaacgctacagcggcgaccgtgacgtggtgttcggggtgaccgtggccggtcggccggtggaattccccgagatgcaggctaccgtcgggctgttcatcaacagcatc > 1:335067‑M1/1‑17 (MQ=255) tAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGGCGCGCTGCGCCACCTGCGCGCTTTGCTCGCGGGTCAGGTACACCAGCTCATCGGCCACTGCTGCATGGTTGTGCTCGGCGCTGGCGCTGCGGTCGAACGGCAGCGCGGTCGGCCGCGCGAAACCTTGCAGCTCAGTGCGCCAGACATCACGCGAGTCCTcgc > 1:352215/1‑216 (MQ=255) tAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGGCGCGCTGCGCCACCTGCGCGCTTTGCTCGCGGGTCAGGTACACCAGCTCATCGGCCACTGCTGCATGGTTGTGCTCGGCGCTGGCGCTGCGGCCGAACGGCa > 1:1061670/1‑158 (MQ=255) gTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGGCGCGCTGCGCCACCTGCGCGCTTTGCTCGCGGGTCAGGTACACCAGCTCATCGGCCACTGCTGCATGGTTGTGCTCGGCGCTGGCGCTGCGGTCGAACGGCAGCGCGGTCGGCCGCTCGAAACCTTGCAGCTCATTGCGCCAg > 2:586731/1‑194 (MQ=255) cccAGGCGgcacagttgacggtcaacaccctggtgcaaggcgcctgggcactgttactgcaacgctacagcggcgaccgtgacgtggtgttcggggtgaccgtggccggtcggccggtggaattccccgagatgcaggctaccgtcgggctgttcatcaacagcatcccgctgcgggtccggttgccgggcgccgaagccggcgtcacggccaaggcgtggctcaagtcactgct > 2:646188‑M1/1‑8 (MQ=255) cccAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGGCGCGCTGCGCCACCTGCGCGCTTTGCTCGCGGGTCAGGTACACCAGCTCATCGGCCACTGCTGCATGGTTGTGCTCGGCGCTGGCGCTGCGGTCGAACGGCCGCGCGGTCGGCCGCTCGAAACCTTGCAGCTCATTGCGCCAGAAATCACGCGAAGCCGCACGGTCCCATCGCTGCAGCAAGGCGAt > 1:590766/1‑235 (MQ=255) ccAGGCGgcacagttgacggtcaacaccctggtgcaaggcgcctgggcactgttactgcaacgctacagcggcgaccgtgacgtggtgttcggggtgaccgtggccggtcggccggtggaattccccgagatgcaggcta < 2:863100‑M1/140‑134 (MQ=255) cAGGCGgcacagttgacggtcaacaccctggtgcaaggcgcctgggcactgttactgcaacgctacagcggcgaccgtgacgtggtgttcggggtgaccgtggccggtcggccggtggaattccccgagatgcaggctaccgtcgggctgttcatcaacagcatcccgctgcgggtccggttgccgggcgccgaagccggcgtcacggccaaggcgtggctcaagtcactgcttga < 1:331933‑M1/236‑231 (MQ=255) cAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCcgcctgggccctgttactgcaacgctacagcggcgacc > 2:218422‑M2/1‑38 (MQ=255) cAGGCGCCTTGCACCA‑GGGGGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGGCGCGCTGCGCCACCTGCGCGCTTTGCTCGCGGGTCAGGTCCACCAGCTCATCGGCCACTGCTGCATGGtt > 2:248640/1‑116 (MQ=255) aGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGGCGCGCTGCGCCACCTGCGCGCTTTGCTCGCGGGTCAGGTACACCAGCTCATCGGCCACTGCTGCATGGTTGTGCTCGGCGCTGGCGCTGCGGTCGAACGGCAGCGCGGTCGGCCGCTCGAAACCTTGCAGCTCATTGCGCCAGAAATCACGCGAAGCCTCACGGTCCCATCGCTGCAGCAAGGCGATGaa > 1:115740/1‑235 (MQ=255) | AGTGCTCGTGCTCGCGCAGGTTGAGGTTGTGGTCAAGCAGTGACTTGAGCCACGCCTTGGCCGTGACGCCGGCTTCGGCGCCCGGCAACCGGACCCGCAGCGGGATGCTGTTGATGAACAGCCCGACGGTAGCCTGCATCTCGGGGAATTCCACCGGCCGACCGGCCACGGTCACCCCGAACACCACGTCACGGTCGCCGCTGTAGCGTTGCAGTAACAGTGCCCAGGCGCCTTGCACCA‑GGGTGTTGACCGTCAACTGTGCCGCCTGGGCGCGCTGCGCCACCTGCGCGCTTTGCTCGCGGGTCAGGTACACCAGCTCATCGGCCACTGCTGCATGGTTGTGCTCGGCGCTGGCGCTGCGGTCGAACGGCAGCGCGGTCGGCCGCTCGAAACCTTGCAGCTCATTGCGCCAGAAATCACGCGAAGCCTCACGGTCCCATCGCTGCAGCAAGGCGATGAA > AE015451/4781676‑4782135 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |