| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 6115123 | 54 (0.940) | 4 (0.070) | 4/320 | NT | 7.3% | coding (564/1287 nt) | PP_5365 | putative fatty acid methyltransferase |
| ? | AE015451 | = 6115151 | 51 (0.950) | coding (536/1287 nt) | PP_5365 | putative fatty acid methyltransferase | |||||
CTGACAACCTTGTCGAAGCGGCCATCCTGGGGCAGATCGCGATAATCGAGAATCTGCAGGTCGACCTTGTCGGCAAGCCCTTCCGCTTGCACACGCTTGCGGCCGAGCTTCAATTGCTCCTTGCTCAGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGACACGTCATAGTGGTAGGAGATTGCCTTGGCGTCGGTGGTCTTGTCATGAGAAACACGTGGCGGCGGCGTTTCATCCTCATCCGCCAGCAGCGCTTCGCTCAGC > AE015451/6114890‑6115348 | cTGACAACCTTGTCGAAGCGGCCATCCTGGGGCAGATCGCGATAATCGAGAATCTGCAGGTCGACCTTGTCGGCAAGCCCTTCCGCTTGCACACGCTTGCGGCCGAGCTTCAATTGCTCCTTGCTCAGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCt > 1:474331/1‑235 (MQ=255) aCCTTGTCGAAGCGGCCATCCTGGGGCAGATCGCGATAATCGAGAATCTGCAGGTCGACCTTGTCGGCAAGCCCTTCCGCTTGCACACGCTTGCGGCCGAGCTTCAATTGCTCCTTGCTCAGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGca > 1:188256/1‑236 (MQ=255) tCGAAGCGGCCATCCTGGGGCAGATCGCGATAATCGAGAATCTGCAGGTCGACCTTGTCGGCAAGCCCTTCCGCTTGCACACGCTTGCGGCCGAGCTTCAATTGCTCCTTGCTCAGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCgg > 2:530323/1‑228 (MQ=255) gAAGCGGCCATCCTGGGGCAGATCGCGATAATCGAGAATCTGCAGGTCGACCTTGTCGGCAAGCCCTTCCGCTTGCACACGCTTGCGGCCGAGCTTCAATTGCTCCTTGCTCAGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAggtggt > 1:360467/1‑236 (MQ=255) cgcgATAACCGAGAATCTGCAGGTCGACCTTGTCGGCAAGCCCTTCCGCTTGCACACGCTTGCGGCCGAGCTTCAATTGCTCCTTGCTCAGGGTAATGCCGAACCCCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTgctgcgcct > 1:172500‑M2/1‑225 (MQ=255) gcgATAATCGAGAATCTGCAGGTCGACCTTGTCGGCAAGCCCTTCCGCTTGCACACGCTTGCGGCCGAGCTTCAATTGCTCCTTGCTCAGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGC > 1:620578‑M1/1‑196 (MQ=255) cgATAATCGAGAATCTGCAGGTCGACCTTGTCGGCAAGCCCTTCCGCTTGCACACGCTTGCGGCCGAGCTTCAATTGCTCCTTGCTCAGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTc > 1:753100/1‑236 (MQ=255) aTAATCGAGAATCTGCAGGTCGACCTTGTCGGCAAGCCCTTCCGCTTGCACACGCTTGCGGCCGAGCTTCAATTGCTCCTTGCTCAGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGa < 1:833926/236‑1 (MQ=255) aTCGAGAATCTGCAGGTCGACCTTGTCGGCAAGCCCTTCCGCTTGCACACGCTTGCGGCCGAGCTTCAATTGCTCCTTGCTCAGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTgctgcgcctggatgcc > 2:474328‑M2/1‑218 (MQ=255) gCAGGTCGACCTTGTCGGCAAGCCCTTCCGCTTGCACACGCTTGCGGCCGAGCTTCAATTGCTCCTTGCTCAGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTgctgcgcctggccg < 2:412400‑M2/221‑15 (MQ=255) ccTTGTCGGCAAGCCCTTCCGCTTGCACACGCTTGCGGCCGAGCTTCAATTGCTCCTTGCTCAGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTgctgcgcctggatgccggtgactacctgctcgatgttg < 1:682112‑M2/236‑39 (MQ=255) cTTGCACACGCTTGCGGCCGAGCTTCAATTGCTCCTTGCTCAGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATa > 1:954199/1‑229 (MQ=255) tGCACACGCTTGCGGCCGAGCTTCAATTGCTCCTTGCTCAGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCg < 2:1089700/165‑1 (MQ=255) 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tCAATTGCTCCTTGCTCAGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAg > 1:906877/1‑236 (MQ=255) tGCTCAGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCagg > 1:304699/1‑198 (MQ=255) aGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGACACGt < 1:530326/235‑1 (MQ=255) ggTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGACACGTCa < 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cGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCGCACGGCAGTAGgcgc > 1:128217/1‑171 (MQ=255) cacCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTg < 1:870533/214‑1 (MQ=255) acCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGacac > 2:743788/1‑218 (MQ=255) acCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGACACGt > 2:324153/1‑220 (MQ=255) 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cAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGACACGTCATAGTGGTAGGAGATTGCCTTGGCGTCGGTGGGCTTGTCATGAGAAACACGTGGCGGCGGCGTTTCGTCCTCATCCGCca > 1:228924/1‑236 (MQ=255) ggTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGACACGTCATAGTGGTAGGAGATTGCCTTGGCGTCGGTGGTCTTGTCATGAGAAACACGTGGCGGCGGCGTTTCATCCTCATCCGCcag > 1:90723/1‑235 (MQ=255) ggTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGACACGTCATAGTGGTAGGAGATTGCCTTGGCGTCGGTGGTCTTGTCATGAGAAACACGTGGCGGCGGCGTTTCATCCTCATCCGCcag > 1:1085475/1‑235 (MQ=255) gTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGACACGTCATAGTGGTAGGAGATTGCCTTGGCGTCGGTGGTCTTGTCATGAGAAACACGTGGCGGCGGCGTTTCATCCTCATCCGCcagc > 1:14584/1‑232 (MQ=255) gTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGACACGTCATAGTGGTAGGAGATTGCCTTGGCGTCGGTGGTCTTGTCATGAGAAACACGTGGCGGCGGCGTTTCATCCTCATCCGCCagcagc > 1:672926/1‑235 (MQ=255) cGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGACACGTCATAGTGGTAGGAGATTGCCTTGGCGTCGGTGGTCTTGTCATGAGAAACACGTggcg < 2:333755/201‑1 (MQ=255) ggCATCCAGGCGCAGCaggacaagttcgaccacctgtgccgcaagctgcgcctggatgccggtgactacctgctcgatgttggctgtggctggggcgggctggcgcggttcgctgcccgtgaatatggcgccaaggtgttcggcattaccctgagcaaggagcaattgaagctcggccgcaagcgtgtgcaagcggaagggcttgccgacaaggtcgacctgcagattctcgat > 2:474328‑M1/1‑16 (MQ=255) cggccaggCGCAGCaggacaagttcgaccacctgtgccgcaagctgcgcctggatgccggtgactacctgctcgatgttggctgtggctggggcgggctggcgcggttcgctgcccgtgaatatggcgccaaggtgttcggcattaccctgagcaaggagcaattgaagctcggccgcaagcgtgtgcaagcggaagggcttgccgacaaggtcgacctgc < 2:412400‑M1/218‑208 (MQ=255) tCCAGGCGCAGCTTGCGGCACCGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGCGCGTCTTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGACTAGCCCATGTCCTGGTCCAGCCAAACCTGGGAgca > 2:83729/1‑123 (MQ=255) tCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGacac > 1:41613/1‑137 (MQ=255) tCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGacac < 2:41612/137‑1 (MQ=255) aGGCGCAGCaggacaagttcgaccacctgtgccgcaagctgcgcctggatgccggtgactacctgctcgatgttggctgtggctggggcgggctggcgcggttcgctgcccgtgaatatggcgccaaggggttcggcattaccctgagcaaggagcaattgaagctcggccgcaagcgtgtgcaagcggaagggcttgccgacaaggtcgacctgcagattctcggttatcgcg > 1:172500‑M1/1‑9 (MQ=255) aGGCGCAGCaggacaagttcgaccacctgtgccgcaagctgcgcctggatgccggtgactacctgctcgatgttggctgtggctggggcgggctggcgcggttcgctgcccgtga > 1:692537‑M1/1‑9 (MQ=255) aGGCGCAGCaggacaagttcgaccacctgtgccgcaagctgcgcctggatgccggtgactacctgctcgatgttggctgtggctggggcgggctggcgcggttcgctgcccgtga < 2:692534‑M1/115‑107 (MQ=255) gcgcAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTGTTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGCATAGGCCATGGCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAAcg > 2:289797/1‑122 (MQ=255) gcagcaggacaagttcgaccacctgtgccgcaagctgcgcctggatgccggtgactaccttctagatgttggcagtggctggggcgggctggcgcggtccgctgcccg > 2:594108‑M1/1‑5 (MQ=255) | CTGACAACCTTGTCGAAGCGGCCATCCTGGGGCAGATCGCGATAATCGAGAATCTGCAGGTCGACCTTGTCGGCAAGCCCTTCCGCTTGCACACGCTTGCGGCCGAGCTTCAATTGCTCCTTGCTCAGGGTAATGCCGAACACCTTGGCGCCATATTCACGGGCAGCGAACCGCGCCAGCCCGCCCCAGCCACAGCCAACATCGAGCAGGTAGTCACCGGCATCCAGGCGCAGCTTGCGGCACAGGTGGTCGAACTTGTCCTGCTGCGCCTGGTCGAGCGTATTGTCCGGCTCACGGAAGTAGGCGCAGGAATAGGCCATGTCCTGGTCCAGCCAAAGCTGGTAGAACGCGTTGGACACGTCATAGTGGTAGGAGATTGCCTTGGCGTCGGTGGTCTTGTCATGAGAAACACGTGGCGGCGGCGTTTCATCCTCATCCGCCAGCAGCGCTTCGCTCAGC > AE015451/6114890‑6115348 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |