| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 4578272 = | 58 (1.010) | 3 (0.050) | 3/328 | NT | 5.5% | coding (1839/2211 nt) | glgB | 1,4‑alpha‑glucan branching enzyme |
| ? | AE015451 | 4578296 = | 47 (0.850) | coding (1815/2211 nt) | glgB | 1,4‑alpha‑glucan branching enzyme | |||||
GCTCGCCGAACGGCACGCCAATGCGGTAACCCTCACGGGGTACCGGGGTGAAGTTGGCCACCACCAGCACCGGCTCGCCGCTGCTGCTCCAGCGCAGCCAGGCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCGAATGCTTGCCGTGCACCACCTCATCATGGGAAATGGGCAGGATGAAGTGCTCG > AE015451/4578061‑4578527 | gCTCGCCGAACGGCACGCCAATGCGGTAACCCTCACGGGGTACCGGGGTGAAGTTGGCCACCACCAGCACCGGCTCGCCGCTGCTGCTCCAGCGCAGCCAGGCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGc < 1:647701/236‑1 (MQ=255) ccGAACGGCACGCCAATGCGGTAACCCTCACGGGGTACCGGGGTGAAGTTGGCCACCACCAGCACCGGCTCGCCGCTGCTGCTCCAGCGCAGCCAGGCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCg < 1:506381/234‑1 (MQ=255) aaCGGCACGCCAATGCGGTAACCCTCACGGGGTACCGGGGTGAAGTTGGCCACCACCAGCACCGGCTCGCCGCTGCTGCTCCAGCGCAGCCAGGCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATa < 1:136610/236‑1 (MQ=255) aaCGGCACGCCAATGCGGTAACCCTCACGGGGTACCGGGGTGAAGTTGGCCACCACCAGCACCGGCTCGCCGCTGCTGCTCCAGCGCAGCCAGGCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATa > 1:832525/1‑236 (MQ=255) aaCGGCACGCCAATGCGGTAACCCGCACGGGGTACCGGGGTGAAGTTGGCCACCACCAGCACCGGCTCGCCGCTGCTGCTCCAGCGCAGCCAGGCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCg < 1:677400/231‑1 (MQ=255) cTCACGGGGTACCGGGGTGAAGTTGGCCACCACCAGCACCGGCTCGCCGCTGCTGCTCCAGCGCAGCCAGGCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTAccagtccagt > 1:471971/1‑235 (MQ=255) ggggTACCGGGGTGAAGTTGGCCACCACCAGCACCGGCTCGCCGCTGCTGCTCCAGCGCAGCCAGGCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGc > 1:376177/1‑235 (MQ=255) gCCACCACCAGCACCGGCTCGCCGCTGCTGCTCCAGCGCAGCCAGGCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGtt < 1:722680/224‑1 (MQ=255) accaccaGCACCGGCTCGCCGCTGCTTCTCCAGCGCAGCCAGGCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTg > 1:666518/1‑236 (MQ=255) accaccaGCACCGGCTCGCCGCTGCTGCTCCAGCGCAGCCAGGCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACt > 1:600739/1‑235 (MQ=255) ccaccaGCACCGGCTCGCCGCTGCTGCTCCAGCGCAGCCAGGCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTgcagc > 1:690932/1‑191 (MQ=255) gcaGCACCGGCTCGCCGCTGCTGCTCCAGCGCAGCCAGGCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATa < 1:670249/180‑1 (MQ=255) caGCACCGGCTCGCCGCTGCTGCTCCAGCGCAGCCAGGCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGa > 1:858714/1‑236 (MQ=255) aCCGGCTCGCCGCTGCTGCTCCAGCGCAGCCAGGCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACt < 1:1040233/235‑1 (MQ=255) ctCCAGCGCCGCCAGGCGTACACGCTGTTCTCCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAACCCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCAc < 1:97924/198‑1 (MQ=255) ccAGCGCAGCCAGGCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAg < 2:865962/220‑1 (MQ=255) ccAGCGCAGCCAGGCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACagcagc < 2:858711/235‑1 (MQ=255) gcAGCCAGGCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGcttctt < 1:521128/235‑1 (MQ=255) cgCCAGGCGGACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCACCCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGGACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGCCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCAt < 1:42024/217‑1 (MQ=255) cAGGCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCg < 1:391072/235‑1 (MQ=255) ggCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGcc > 1:745066/1‑198 (MQ=255) gTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGtgtg < 2:471968/236‑1 (MQ=255) gCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCcaca > 1:946633/1‑236 (MQ=255) tCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACt < 2:1030704/189‑1 (MQ=255) tcgtcACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCCCGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCAt > 1:995111/1‑191 (MQ=255) gtcACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTa > 2:490900/1‑234 (MQ=255) cACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAg > 2:695675/1‑233 (MQ=255) cACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGc < 1:695678/235‑1 (MQ=255) cACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCa > 1:756093/1‑236 (MQ=255) cACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGGGCCCACATGac > 1:72600/1‑222 (MQ=255) ccGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACagcagc < 1:24101/195‑1 (MQ=255) gAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAAc > 2:1016686/1‑235 (MQ=255) aaaCCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGc < 1:231/222‑1 (MQ=255) ccccTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGc < 1:185208/215‑1 (MQ=255) aCCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACagcagc < 1:894002/178‑1 (MQ=255) cccTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAAc < 2:398014/171‑1 (MQ=255) ccTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACt < 1:969872/156‑1 (MQ=255) tGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCa < 1:907757/236‑1 (MQ=255) tGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCg > 1:765819/1‑233 (MQ=255) aTCCTGCGCGTGCAACGCCGGCGCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACt < 2:1783/143‑1 (MQ=255) gtggaaccacgacgccgaactggactggtacctgctgcagtatcccgagcaccagggcgtgcagcgcctggtgCTCGGGATACTGCAGCAGGTAcc < 1:548686‑M2/23‑1 (MQ=255) gtggaaccacgacgccgaactggactggtacctgctgcagtatcccgagcaccagggcgtgcagcgcctggtgCTCGGGATACTGCAGCAGGTAcc > 2:548683‑M2/74‑96 (MQ=255) tGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCg > 1:78317/1‑135 (MQ=255) tGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCg < 2:78315/135‑1 (MQ=255) cGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGc > 2:529609/1‑190 (MQ=255) ggtacctgctgcagtatcccgagCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCAc < 1:548686‑M1/73‑1 (MQ=255) ggtacctgctgcagtatcccgagCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCAc > 2:548683‑M1/24‑96 (MQ=255) gTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCGAATGCTTGCCGt < 1:648505/236‑1 (MQ=255) cGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAAGCACGCCGGTTGGCGAACTTCTGCCa > 2:79479/1‑188 (MQ=255) ggTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGt > 1:505175/1‑165 (MQ=255) ggTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCGAATGCTTGCCGTGCACCACCtcat > 2:926412/1‑234 (MQ=255) ggTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCGAATGCTTGCCGTGCACCACCtca > 2:360712/1‑233 (MQ=255) CCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTGGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTc > 1:380996‑M1/1‑178 (MQ=255) CCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACGGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCTTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCg > 1:136675‑M1/1‑120 (MQ=255) cgtgcagcgcctggtgCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCAGCTTGTCGATCAGCGAATGCTTGCCGtgcaccacat > 1:8642‑M2/17‑214 (MQ=255) cTGCAGGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGccc < 2:224178/91‑1 (MQ=255) gCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCGAATGCTTGCCGTGCacaacccc > 2:681776/1‑212 (MQ=255) cACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCcac < 1:325771/121‑1 (MQ=255) cACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGGCGATCAGCGAATGCtt > 1:217748/1‑198 (MQ=255) ctggtgCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCGAATGCTTGCCGTGCACCACCTCATCATGGGAAATGGGCAGGATGAAGTg < 2:680842‑M2/228‑1 (MQ=255) ctggggCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGGCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCGAATGCTTGCCGTGCACCACCTCATCATGGGAAATGGGCAGGATGAAGTg < 2:832522‑M2/228‑1 (MQ=255) cTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCGAATGCTTGCCGTGCACCACCTCATCATGGGAAATGGGCAGGATGAAGTGCTCg < 2:926292/232‑1 (MQ=255) | GCTCGCCGAACGGCACGCCAATGCGGTAACCCTCACGGGGTACCGGGGTGAAGTTGGCCACCACCAGCACCGGCTCGCCGCTGCTGCTCCAGCGCAGCCAGGCGTACACGCTGTTCTGCGCGTCGTCACCGATCAACCACTGGAAACCCTGCGGCTGGCAATCCTGCTCGTGCAACGCCGGCTCTTCGCGGTACAGGCGGTTGAGGTCGCCCACCAGGCGCTGCACGCCCTGGTGCTCGGGATACTGCAGCAGGTACCAGTCCAGTTCGGCGTCGTGGTTCCACTCACGCCACTGGCCGAACTCGCAGCCCATGAACAGCAGCTTCTTGCCCGGGTGTGCCCACATGAAGGTGAGGTAGGCACGCAGGTTGGCGAACTTCTGCCAGCGGTCGCCGGGCATCTTGTCGATCAGCGAATGCTTGCCGTGCACCACCTCATCATGGGAAATGGGCAGGATGAAGTGCTCG > AE015451/4578061‑4578527 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |