| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 4743577 = | 75 (1.300) | 8 (0.150) | 7/326 | NT | 10.1% | coding (415/1593 nt) | PP_4197 | Transcriptional regulator, GntR family |
| ? | AE015451 | 4743666 = | 71 (1.290) | coding (326/1593 nt) | PP_4197 | Transcriptional regulator, GntR family | |||||
GTCACCTTGGCGATTTGCTGATGCAGGGCGCGCACTGGCAGGTAGTCGACATGCGGCACAGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGGCGATACGCTGGTACAGCAGCAGGTTGGTCATGTCGACATGCTCGTTGTTCTTGTACGGGTCACTGACGGTAGAGGATACCGTAACAGTT > AE015451/4743438‑4743899 | gTCACCTTGGCGATTTGCTGATGCAGGGCGCGCACTGGCAGGTAGTCGACATGCGGCACAGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGCTAAGc > 2:578278/1‑234 (MQ=255)gTCACCTTGGCGATTTGCTGATGCAGGGCGCGCACTGGCAGGTAGTCGACATGCGGCACAGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGcc > 1:433145/1‑235 (MQ=255) cTGATGCAGGGCGCGCACTGGCAGGTAGTCGACATGCGGCACAGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTgg < 1:703024/236‑1 (MQ=255) tGATGCAGGGCGCGCACTGGCAGGTAGTCGACATGCGGCACAGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGc > 1:470587/1‑236 (MQ=255) gATGCAGGGCGCGCACTGGCAGGTAGTCGACATGCGGCACAGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTgg < 1:541367/234‑1 (MQ=255) ggggCGCGCACTGGCAGGTAGTCGACATGCGGCACAGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGc < 1:184615/235‑1 (MQ=255) aGGTAGTCGACATGCGGCACAGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGAACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAacctgtctct > 1:592623/1‑228 (MQ=255) gTAGTCGACATGCGGCACAGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCa > 1:1014536/1‑214 (MQ=255) gTAGTCGACATGCGGCACAGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCa < 2:1014533/214‑1 (MQ=255) tAGTCGACATGCGGCACAGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATg < 1:697221/236‑1 (MQ=255) aGTCGACATGCGGCACAGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCAt < 2:980317/234‑1 (MQ=255) cgtgcgcaagatgagcgcccagctcaatgtcagccatgccacggtgttgcaggcctatgccaatctcgaggaccaagggcttatccgggcgcggccgcagtctggctattacgtgcaccagacccctgccttgaccgcgcaaacccccgacatcgctcgggtggagcgcccggATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGt < 1:604704‑M2/44‑1 (MQ=255) cacaGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACCCCGTGGCAt > 2:1056975/1‑221 (MQ=255) cacaGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCt < 1:916581/236‑1 (MQ=255) acaGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCAt < 1:471632/220‑1 (MQ=255) gcaCCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTgg < 2:592620/190‑1 (MQ=255) gggAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGc > 2:216529/1‑192 (MQ=255) acacCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGa > 1:172316/1‑236 (MQ=255) cATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCga < 2:72231/165‑1 (MQ=255) aTCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGc < 1:320025/151‑1 (MQ=255) aTCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTa > 1:780932/1‑236 (MQ=255) aTCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTa > 1:773421/1‑236 (MQ=255) gcggcgCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATc < 1:227064/217‑1 (MQ=255) cgcCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCga > 2:886772/1‑155 (MQ=255) gcCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTgg > 1:1061307/1‑181 (MQ=255) gcCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGc > 1:74208/1‑235 (MQ=255) ccTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGcc < 1:170265/235‑1 (MQ=255) acggtgttgcaggcctatgccaatctcgaggaccaagggcttatCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACg < 1:604704‑M1/173‑1 (MQ=255) ggtgttgcaggcctatgccaatctcgaggaccaagggcttatccgggcgcggccgcagtctggctattacgtgcaccagacccctgccttgaccgcgcaaacccccgacatcgctcgggtggagcgcccggATAAGCCCTTGGTCCTCga < 1:872006‑M2/19‑1 (MQ=255) gtgGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTg < 2:19109/141‑1 (MQ=255) ggATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTg > 2:401717/1‑140 (MQ=255) ggATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTg < 1:401720/140‑1 (MQ=255) ggATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGgc > 1:544683/1‑184 (MQ=255) ggATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGAGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTgg > 2:820489/1‑141 (MQ=255) gatgatGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTg < 2:10934/126‑1 (MQ=255) atgCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCCCGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGaca > 1:29401/1‑225 (MQ=255) tcgaggaccaagggcttatCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACAcc < 1:872006‑M1/131‑1 (MQ=255) tGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGCTTGGCATCGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGCGCTggg > 2:167881/1‑174 (MQ=255) tGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGtc > 1:352836/1‑151 (MQ=255) 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cGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGCTGCTGGGCGATACGc > 1:186213/1‑218 (MQ=255) cagcccccggcctgacccgcgcaaacccccgacatcgctggggtggggcgcccgtATACGCCCTGGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCa < 2:373986‑M2/82‑1 (MQ=255) gcgGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGGCGATACGCTGGTACAGCAGCAGGTTGGTCATGTCGa > 1:259732/1‑235 (MQ=255) gacccctgccttgaccgcgcaaacccccgacatcgctcgggtggagcgcccggATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGt < 2:676474‑M2/44‑1 (MQ=255) ccctgccttgaccgcgcaaacccccgacatcgctcgggtggagcgcccggATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCt > 2:795258‑M2/51‑84 (MQ=255) ccctgccttgaccgcgcaaacccccgacatcgctcgggtggagcgcccggATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCt < 1:795261‑M2/34‑1 (MQ=255) ggCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGGCGATACGCTGGTAcagcagc < 1:254497/211‑1 (MQ=255) gCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGGCGATACGCTGGTACAGCAGCAGGTTGGTCAt < 1:589421/221‑1 (MQ=255) cTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGGCGATACGCt > 2:290447/1‑191 (MQ=255) cTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGGCGATACGCTGGTACAGCAGCAGGTTGGTCATGTCGACATGCTCGTTGTTCTTg > 1:55698/1‑235 (MQ=255) tGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAg > 1:222240/1‑120 (MQ=255) tGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGGCGATACGCTGGTACAGCAGCAGGTTGGTCATGTCGACATGCTCGTTGTTCTTGTAc > 2:427924/1‑234 (MQ=255) aaacccccgacatcgctcgggtggagcgcccggATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCGGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGCCGATACGATGGTACAGCAGCAGGTTGGTCATGTCGACATGCTCGTTGTTGTTGTACgg > 1:662844‑M2/34‑236 (MQ=255) gCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGCCATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGGCGATACGCTGGTACAGCAGCAGGTTGGTCATGTCGACATGCTCGTTGTTCTTg < 1:422885/230‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTgg < 1:721636/40‑1 (MQ=255) tGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTgg > 2:721633/1‑40 (MQ=255) tGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGGCGATACGCTGGTACAGCAGCAGGTTGGt > 1:560191/1‑188 (MQ=255) tGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGGCGATACGCTGGTACAGCAGCAGGTTGGTCATGTCGACATGCTCGTTGTTCTTGTACGGGTCACTGACGGTAGAgg > 1:425788/1‑235 (MQ=255) tGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGGCGATACGCTGGTACAGCAGCAGGTTGGTCATGTCGACATGCTCGTTGTTCTTGTACGGGTCACTGACGGTAGAgg > 1:180628/1‑235 (MQ=255) 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ccggATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGGCGATACGCTGGTACAGCAGCAGGTTGGTCATGTCg < 2:780929‑M2/180‑1 (MQ=255) ccggATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCAACGGCCAGTTg > 2:798724‑M2/5‑144 (MQ=255) cggATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGGCGATACGCTGGTACAGCAGCAGGTTGGTCATGTCGACATGCTCGTTGTTCTTGTACGGGTCACTGACGGTAGAGGATACCGTAACAGt < 1:427927‑M2/233‑1 (MQ=255) ggATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGGCGATACGCTGGTACAGCAGCAGGTTGGTCATGTCGACATGCTCGTTGTTCTTGTACGGGTCACTGACGGTAGAGGATACCGTAACAGtt < 1:216531‑M2/234‑1 (MQ=255) gATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTTGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGGCGATACGCTGGTACAGCAGCAGGTTGGTCATGTCGACATGCTCGTTGTTCTTGTACGGGTCAc < 1:73401‑M2/208‑1 (MQ=255) | GTCACCTTGGCGATTTGCTGATGCAGGGCGCGCACTGGCAGGTAGTCGACATGCGGCACAGCAGCACCAAACGGGAACACACCATCGCGGCGCGCCTCAGTCAGCACCTGCTGGATGATGCTGGCGCGCGTGACCAGGCCCGGGCGCTCCACCCGAGCGATGTCGGGGGTTTGCGCGGTCAAGGCAGGGGTCTGGTGCACGTAATAGCCAGACTGCGGCCGCGCCCGGATAAGCCCTTGGTCCTCGAGATTGGCATAGGCCTGCAACACCGTGGCATGGCTGACATTGAGCTGGGCGCTCATCTTGCGCACGGAGGGTACCCGCTCGCCTGGCTGGTAGACACCGCGACGGATATCATCGGCCAGTTGCTGGGCGATACGCTGGTACAGCAGCAGGTTGGTCATGTCGACATGCTCGTTGTTCTTGTACGGGTCACTGACGGTAGAGGATACCGTAACAGTT > AE015451/4743438‑4743899 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |