Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | AE015451 | 1544220 | 1544494 | 275 | 18 [17] | [13] 18 | [mdfA] | [mdfA] |
TGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCATCAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCAGTGTGGTGGCCGGCATGTCGCTGTACGCGCTGGGGTTGGGCGTGGCCAATGCAGTGCTGTACCGCATGACGCTGTTCTCCAGCGAACAGAGCAAGGGGCTGGTTTCGGCCATGCTGGGGATGATCACGATTGCCTTGCTGGGGTTTGGCGGAGCGCTGCTGGCGATGATTGGCGCCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTG > AE015451/1543987‑1544393 | tgtgGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCATCAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCAGTGTGGTGGCCGGCATGTCGCTGTACGCGCTGGGGTTGGGCGTGGCCAATGCAGTGCTGTACCGCATg < 2:1044278/233‑1 (MQ=255) ggTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCATCAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCAGTGTGGTGGCCGGCATGTCGCTGTACGCGCTGGGGTTGGGCGTGGCCAATGCAGTGCTGTACCGCATGACGCTGTTCTCCAGc > 1:808049/1‑235 (MQ=255) gATCCTCGGTAACCTGATCATCAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCAGTGTGGTGGCCGGCATGTCGCTGTACGCGCTGGGGTTGGGCGTGGCCAATGCAGTGCTGTACCGCATGACGCTGTTCTCCAGCGAACAGAGCAAggg > 2:734990/1‑234 (MQ=255) ccGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCAGTGTGGTGGCCGGCATGTCGCTGTACGCGCTGGGGTTGAGCGTGGCCAATGCAGTGCTGTACCGCATGACGCTGTTCTCCAGCGAACAGAGCAAGGGGCTGGTTTCGGCCATGCTGGGGATGATCACGATTGCCTTGCTggg < 1:137618/236‑1 (MQ=255) ccAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCAGTGTGGTGGCCGGCATGTCGCTGTACGCGCTGGGGTTGGGCGTGGCCAATGCAGTGCTGTACCGCATGACGCTGTTCTCCAGCGAACAGAGCAAGGGGCTGGttt < 2:709668/193‑1 (MQ=255) cgcgcTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCAGTGTGGTGGCCGGCATGTCGCTGTACGCGCTGGGGTTGGGCGTGGCCAATGCAGTGCTGTACCGCATGACGCTGTTCTCCAGCGAACAGAGCAAGGGGCTGGttt < 2:808046/176‑1 (MQ=255) ggCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCAGTGTGGTGGCCGGCATGTCGCTGTACGCGCTGGGGTTGGGCGTGGCCAATGCAGTGCTGTACCGCATGACGCTGTTCTCCAGCGAACAGAGCAAGGGGCTGGTTTc < 2:22727/169‑1 (MQ=255) tACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCAGTGTGGTGGCCGGCATGTCGCTGTACGCGCTGGGGTTGGGCGTGGCCAATGCAGTGCTGTACCGCATGACGTTGTTCTCCAGCGAACAGAGCAAGGGGCTGGTTTCGGCCAt < 1:734993/170‑1 (MQ=255) aCCGGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACGGGCCGAGCGTGACCAGTGTGGTGGCCGGCATGTCGCTGTACGCGCTGGGGTTGGGCGTGGCCAATGCAGTGCTGTACCGCATGACGCTGTTCTCCAGc < 2:302345/140‑1 (MQ=255) tGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCAGTGTGGTGGCCGGCATGTCGCTGTACGCGCTGGGGTTGGGCGTGGCCAATGCAGTGCTGTACCGCATGACGCTGTTCTCCAGCGAACAGAGCAAGGGGCTGGTTTCGGCCATGCTGGGGATGATCACGATTGCCTTGCTGGGGTTTGGCGGAGCGCTGCTGGCGATGATTGGCGCCGGTGCCAGCTTGCTGCAtttt > 1:315787/1‑236 (MQ=255) tGAGGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCAGTGTGGTGGCCGGCATGTCGCTGTACGCGCTGGGGTTGGGCGTGGCCAATGCAGTGCTGTACCGCATGACGCTGTTCTCCAGCGAACAGAGCAAGGGGCTGGTTTCGGCCAt < 2:11730/151‑1 (MQ=255) cATGTCGCTGTACGCGCTGGGGTTGGGCGTGGCCAATGCAGTGCTGTACCGCATGACGCTGTTCTCCAGCGAACAGAGCAAGGGGCTGGTTTCGGCCATGCTGGGGATGATCACGATTGCCTTGCTGGGGTTTGGCg < 2:684633/137‑1 (MQ=255) aTGTCGCTGTACGCGCTGGGGTTGGGCGTGGCCAATGCAGTGCTGTACCGCATGACGCTGTTCTCCAGCGAACAGAGCAAGGGGCTGGTTTCGGCCATGCTGGGGATGATCACGATTGCCTTGCTGGGGTTTGGCGGAGCGCTGCTGGCGATGATTGGCGCCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTgg > 1:875114/1‑190 (MQ=255) aTGTCGCTGTACGCGCTGGGGTTGGGCGTGGCCAATGCAGTGCTGTACCGCATGACGCTGTTCTCCAGCGAACAGAGCAAGGGGCTGGTTTCGGCCATGCTGGGGATGATCACGATTGCCTTGCTGGGGTTTGGCGGAGCGCTGCTGGCGATGATTGGCGCCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTgg < 2:875111/190‑1 (MQ=255) gTACCGCATGACGCTGTTCTCCAGCGAACAGAGCAAGGGGCTGGTTTCGGCCATGCTGGGGATGATCACGATTGCCTTGCTGGGGTTTGGCGGAGCGCTGCTGGCGATGATTGGCGCCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCtg < 1:1001249/184‑1 (MQ=255) gTACCGCATGACGCTGTTCTCCAGCGAACAGAGCAAGGGGCTGGTTTCGGCCATGCTGGGGATGATCACGATTGCCTTGCTGGGGTTTGGCGGAGCGCTGCTGGCGATGATTGGCGCCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCtg > 2:1001246/1‑184 (MQ=255) gACGCTGTTCTCCAGCGAACAGAGCAAGGGGCTGGTTTCGGCCATGCTgggg < 2:588478/52‑1 (MQ=255) gACGCTGTTCTCCAGCGAACAGAGCAAGGGGCTGGTTTCGGCCATGCTgggg > 1:588481/1‑52 (MQ=255) | TGTGGCAGTTGCCGGTTTTTTGCGGGCTGATCCTCGGTAACCTGATCATCAACCGTATTGCCGATCGCTACCCGCTGCCAGCCCTGGTGCGTGGCGCGCTCTGGCCATACCTGGCTGGCCTGTGCCTGATGGTGCTGGCGACCTGGTACTGGCCGAGCGTGACCAGTGTGGTGGCCGGCATGTCGCTGTACGCGCTGGGGTTGGGCGTGGCCAATGCAGTGCTGTACCGCATGACGCTGTTCTCCAGCGAACAGAGCAAGGGGCTGGTTTCGGCCATGCTGGGGATGATCACGATTGCCTTGCTGGGGTTTGGCGGAGCGCTGCTGGCGATGATTGGCGCCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTG > AE015451/1543987‑1544393 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |