| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | AE015451 | 1,349,365 | C→A | 5.6% | D20Y (GAC→TAC) | PP_1174 ← | conserved protein of unknown function |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AE015451 | 1,349,365 | 0 | C | A | 5.6% | 293.4 / 2.6 | 85 | D20Y (GAC→TAC) | PP_1174 | conserved protein of unknown function |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (44/36); new base A (2/3); total (46/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
CTCTTCCTTTTCCGCAACGCTTCCCGGCTAAGATCGAGCGCTCCCTGGCGCCACGGCCGCCAGCTATCTTGGCAACTCTCCCGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCAGAGGGTGTGGAGAGGACATGGTTTACAAATTCAATCCAATCGCCTGTAGACCCGGCCGCAACCCTGCGCTATTTTCAGTTCTGGCCTCGCCCTC > AE015451/1349137‑1349591 | ctctTCCTTTTCCGCAACGCTTCCCGGCTAAGATCGAGCGCTCCCTGGCGCCACGGCCGCCAGCTATCTTGGCAACTCTCCCGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGc > 1:651987/1‑234 (MQ=255) ccGCAACGCTTCCCGGCTAAGATCGAGCGCTCCCTGGCGCCACGGCCGCCAGCTATCTTGGCAACTCTCCCGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCgcag < 2:383862/233‑1 (MQ=255) gCAACGCTTCCCGGCTAAGATCGAGCGCTCCCTGGCGCCACGGCCGCCAGCTATCTTGGCAACTCTCCCGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGtt < 2:560808/236‑1 (MQ=255) gCAACGCTTCCCGGCTAAGATCGAGCGCTCCCTGGCGCCACGGCCGCCAGCTATCTTGGCAACTCTCCCGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGtt < 1:440326/236‑1 (MQ=255) gCAACGCTTCCCGGCTAAGATCGAGCGCTCCCTGGCGCCACGGCCGCCAGCTATCTTGGCAACTCTCCCGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGtt > 1:164645/1‑236 (MQ=255) gCAACGCTTCCCGGCTAAGATCGAGCGCTCCCTGGCGCCACGGCCGCCAGCTATCTTGGCAACTCTCCCGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGtt < 1:889304/236‑1 (MQ=255) cAACGCTTCCCGGCTAAGATCGAGCGCTCCCTGGCGCCACGGCCGCCAGCTATCTTGGCAACTTTCCCGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTg > 1:225130/1‑236 (MQ=255) gCTTCCCGGCTAAGATCGAGCGCTCCCTGGCGCCACGGCCGCCAGCTATCTTGGCAACTCTCCCGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCAcc < 1:641819/236‑1 (MQ=255) 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2:962087/218‑1 (MQ=255) gtCGAGCGCTCCCTGGCGCCTCGGCCGCCAGCTATCTTGGCAACTCTCCCGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCgcag < 2:164643/211‑1 (MQ=255) aTCGAGCGCTCCCTGGCGCCACGGCCGCCAGCTATCTTGGCAACTCTCCCGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGtt < 1:781907/217‑1 (MQ=255) ggCGCCACGGCCGCCAGCTATCTTGGCAACTCTCCCGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTc < 2:651984/234‑1 (MQ=255) ccACGGCCGCCAGCTAGCTTGGCAACTCTCCCGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGc < 2:155552/184‑1 (MQ=255) cgccAGCTATCTTGGCAACTCTCCCGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTg < 1:815347/208‑1 (MQ=255) gCTATCTTGGCAACTCTCCCGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACATTCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACt < 1:648826/202‑1 (MQ=255) ttGGCAACTCTCCCGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCAt > 2:422028/1‑218 (MQ=255) tGGCCACTCTCCCGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAg < 2:175488/170‑1 (MQ=255) gCAACTCTCCCGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATg > 1:664532/1‑236 (MQ=255) ctccCCCGTGCTACGCGCTGCCCTGAATGGCCTGGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGtt < 2:155290/174‑1 (MQ=255) ccccGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGtt < 2:224487/170‑1 (MQ=255) ccGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATcc < 2:731778/189‑1 (MQ=255) cGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAgc < 1:992684/236‑1 (MQ=255) cGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCACGCAGTGTtcgtc > 1:292892/1‑217 (MQ=255) tACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGtt < 2:241683/163‑1 (MQ=255) gcTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGt > 1:731282/1‑235 (MQ=255) 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tgtgCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTACTTGCCATAGCGCAGTAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTc > 1:771059/1‑172 (MQ=255) gtgCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCgaagaa > 2:715169/1‑195 (MQ=255) cgcgAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCgaa > 2:430929/1‑188 (MQ=255) cgcgAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAAc > 1:851297/1‑228 (MQ=255) cgcgAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCt > 2:591520/1‑234 (MQ=255) cgcgAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTg > 1:764388/1‑236 (MQ=255) cgcgAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCACCAGCGGCACCGTGCGGTa > 2:204435/1‑149 (MQ=255) gggCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCGGTGCAGATCCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTATTTGCCATAGCGCACTAGCGGCACAGTGCGGTACTGATCCGCGTCGa < 2:771056/156‑1 (MQ=18) ccccGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAg > 1:225891/1‑191 (MQ=255) ccccGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTATTTGCCATAg < 1:481306/105‑1 (MQ=255) ccccGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTATTTGCCATAg > 2:481303/1‑105 (MQ=255) cGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGa > 1:514652/1‑220 (MQ=255) ggCAAACAATCCATCAGTGCAGAGCCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCagag < 1:265773/226‑1 (MQ=255) ccATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAgccggccg > 2:895772/1‑175 (MQ=255) catcatTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCg > 2:364405/1‑162 (MQ=255) catcatTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCg < 1:364408/162‑1 (MQ=255) atcatTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCg > 2:181661/1‑131 (MQ=255) atcatTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGCGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGcc > 1:1032050/1‑210 (MQ=255) 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ccAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAAc > 2:349393/1‑176 (MQ=255) aGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATCCGAg > 2:179112/1‑190 (MQ=255) gTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCAGAGGGTGTGGAGAGGACATGGTTTACAAATTCAATCCAATCGCCTGTa < 1:1070177/235‑1 (MQ=255) tGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCa > 2:397391/1‑162 (MQ=255) tGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCa < 1:397394/162‑1 (MQ=255) gCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCAGAGGGTGTGGAGAGGACATGGTTTACAAATTCAATCCAATCGCCTGTAGa < 1:81782/235‑1 (MQ=255) aCAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCAGAGGGTGTGGAGAGGACATGGt > 2:499959/1‑200 (MQ=255) gTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCAGAGGGTGTGGAGAGGACATGGTTTACAAATTCAATCCAATCGCCTGTAGACCCGGCCGCAAcc > 1:745075/1‑236 (MQ=255) gtaGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAg < 2:117465/147‑1 (MQ=255) ctaGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCAGAGGGTGTGGagag < 2:815599/184‑1 (MQ=255) ataGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCAGAGGGTGTGGAGAGGACATGGtt > 2:81780/1‑194 (MQ=255) ccccGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCTTTGCCATAg > 1:897885/1‑44 (MQ=255) ccccGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCAGAGGGTGTGGAGAGGACATGGTTTACAAATTCAATCCAATCGCCTGTAGACCCGGc > 1:1074227/1‑222 (MQ=255) ccccGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCAGAGGGTGTGGAGAGGACATGGTTTACAAATTCAATCCAATCGCCTGTAGACCCGGCCGCAACCCTgcg > 2:938134/1‑234 (MQ=255) gACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCAGAGGGTGTGGAGAGGACATGGTTTACAAAtt > 1:440227/1‑192 (MQ=255) aCTCGCTGTCCATGGCGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCAGAGGGTGTGGAGAGGACATGGTTTACAAATTcaatcca < 2:880751/198‑1 (MQ=255) aCTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCTGGGt > 1:555006/1‑72 (MQ=255) cTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGtt > 2:772283/1‑125 (MQ=255) cTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCAGAGGGTGTGGAGAGGACATGGTTTACAAATTCAATCCAATCGCCTGTAGACCCGGCCGCAACCCTg > 2:964191/1‑225 (MQ=255) cTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCAGAGGGTGTGGAGAGGACATGGTTTACAAATTCAATCCAATCGCCTGTAGACCCGGCCGCAACCCTGCGCTATTTTCa > 1:665526/1‑236 (MQ=255) cTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCAGAGGGTGTGGAGAGGACATGGCTTACAAATTCAATCCAATCGCCTGt > 1:102848/1‑206 (MQ=255) cTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGATGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGATATGAc > 2:1086456/1‑107 (MQ=255) cTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCACCAGCTGCACCGTGCGGTa > 2:55992/1‑60 (MQ=17) cGCTGGCCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCGCCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCAGAGGGTGTGGAGAGGACATGGTTTACAAATTCAATCCAATCGCCTGTAGACCCgg < 1:127897/212‑1 (MQ=255) tGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCAGAgg > 2:806931/1‑158 (MQ=255) tGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCAGAGGgtgt < 1:981304/162‑1 (MQ=255) gACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGCTCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCAGCGGGCGTGGAGAGGACATg > 2:59687/1‑173 (MQ=255) tctcCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCAGAGGGTGTGGAGAGGACATGGTTTACAAATTCAATCCAATCGCCTGTAGACCCGGCCGCAACCCTGCGCTATTTTCAGTTCTGGCCTCGCCCTc > 1:571395/1‑236 (MQ=255) ctcCTGTTACTTGCCATAGCGCAGCAGTTGAAACGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGTTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCag < 1:51212/142‑1 (MQ=17) tCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGGGCCAGATAGTGTGGAggggcggttg > 2:794158/1‑149 (MQ=14) tCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGCGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGGGCCAGATAGTGTGGAggggcggttg < 1:794161/155‑7 (MQ=11) | CTCTTCCTTTTCCGCAACGCTTCCCGGCTAAGATCGAGCGCTCCCTGGCGCCACGGCCGCCAGCTATCTTGGCAACTCTCCCGTGCTACGCGCTTCCCTGAATGGCCTTGTGCCGCGAAAGGGCCGCACAGCCGCCCCGGCAAACAATCCATCATTGCAGAACCCCCAAGATCAGTGCTTTGTACAAGGTATAGGCCCCGGACTCGCTGACCATGGTGGTCTCCTGGTCCTTGCCATAGCGCAGCAGTTGCACCGTGCGGTACTGATCCGGGTCGAGCTCGGGCATGCAGTGTTCGTCGAAGAAATGACCGCTCAGCCGGCCGAGTTCGTGGGCGCAGAACCAGGCTTGGGATTCGAGCCAGAGGGTGTGGAGAGGACATGGTTTACAAATTCAATCCAATCGCCTGTAGACCCGGCCGCAACCCTGCGCTATTTTCAGTTCTGGCCTCGCCCTC > AE015451/1349137‑1349591 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |