New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 2325662 | 15 (0.380) | 3 (0.080) | 3/320 | NT | 16.1% | coding (1642/1962 nt) | PP_2045 | Metallo‑beta‑lactamase family protein |
? | AE015451 | = 2325678 | 17 (0.450) | coding (1626/1962 nt) | PP_2045 | Metallo‑beta‑lactamase family protein |
TCCTTGAGAAAGCCTGTCTGCTTCAAGGCAATGCTGTCCAGTGTCTGTTTGCGCATGATGACCTCTACATCGGCCTTGGCGTGGCGCGCCAGGTCGCGGTGGGTGAGGACGCCGTTGCGCAGGGTGAGGGCGTAGTCTTCGTCCAGGTCGGAAAACCGCCAGTTGATGGTCAGGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGGTAGTCGAAAAACAGGCTGGGTGTCAGGGCCCGCACCATGTCATCGGCGTTGCCGCCGCTACCCGCACCGGCGGCAACGCCTGAGCGCAATTCCTGCGCGCCACTGAGGTAGGCATTGCGCCAGGTGGCGTTCTCACTCTGGTAACCCAGTTGCTCCAGCGCGTCGGCCTGCAGTTCGCGGGCCTCGGTGTTGTCTGGCTCGGCGAATACCAGGTGGTTGGCCAATTGCGC > AE015451/2325448‑2325893 | tCCTTGAGAAAGCCTGTCTGCTTCAAGGCAATGCTGTCCAGTGTCTGTTTGCGCATGATGACCTCTACATCGGCCTTGGCGTGGCGCGCCAGGTCGCGGTGGGTGAGGACGCCGTTGCGCAGGGTGAGGGCGTAGTCTTCGTCCAGGTCGGAAAACCGCCAGTTGATGGTCAGGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGGTAGTCGAAAAACAGGctgg < 1:650785‑M2/235‑5 (MQ=255) tCCTTGAGAAAGCCTGTCTGCTTCAAGGCAATGCTGTCCAGTGTCTGTTTGCGCATGATGACCTCTACATCGGCCTTGGCGTGGCGCGCCAGGTCGCGGTGGGTGAGGACGCCGTTGCGCAGGGTGAGGGCGTAGTCTTCGTCCAGGTCGGAAAACCGCCAGTTGATGGTCAGGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGGGAGTCGAAAAACAGGctgg < 1:206499‑M2/235‑5 (MQ=255) tGCGCATGATGACCTCTACATCGGCCTTGGCGTGGCGCGCCAGGTCGCGGTGGGTGAGGACGCCGTTGCGCAGGGTGAGGGCGTAGTCTTCGTCCAGGTCGGAAAACCGCCAGTTGATGGTCAGGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGGTAGTCGAAAAACAGGCTGGGTGTCAgg > 1:473484/1‑194 (MQ=255) tGCGCATGATGACCTCTACATCGGCCTTGGCGTGGCGCGCCAGGTCGCGGTGGGTGAGGACGCCGTTGCGCAGGGTGAGGGCGTAGTCTTCGTCCAGGTCGGAAAACCGCCAGTTGATGGTCAGGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGGTAGTCGAAAAACAGGCTGGGTGTCAGGGCCCGCACCATGTCATc > 1:192625/1‑211 (MQ=255) cGGCCTTGGCGTGGCGCGCCAGGTCGCGGTGGGTGAGGACGCCGTTGCGCAGGGTGAGGGCGTAGTCTTCGTCCAGGTCGGAAAACCGCCAGTTGATGGTCAGGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGGTAGTCGAAAAACAg < 2:317484/160‑1 (MQ=255) ttGGCGTGGCGCGCCAGGTCGCGGTGGGTGAGGACGCCGTTGCGCAGGGTGAGGGCGTAGTCTTCGTCCAGGTCGGAAAACCGCCAGTTGATGGTCAGGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGGGAGTCGAAAAACAGGCTGGGTGTCAGGGCCCGCAcc > 1:169672/1‑177 (MQ=255) cgcCGGGTCGCGGTGGGTGAGGACGCCGTTGCGCAGGGTGAGGGCGTAGTCTTCGTCCAGGTCGGAAAACCGCCAGTTGATGGTCAGGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGGTAGTCGAAAAAc < 2:246814/142‑1 (MQ=255) cgcCAGGTCGCGGTGGGTGAGGACGCCGTTGCGCAGGGTGAGGGCGTAGTCTTCGTCCAGGTCGGAAAACCGCCAGTTGATGGTCAGGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGcctgtttttcgactacctgggtgttcgggtgaatgcctacaa > 1:149761‑M1/1‑129 (MQ=255) cgcCAGGTCGCGGTGGGTGAGGACGCCGTTGCGCAGGGTGAGGGCGTAGTCTTCGTCCAGGTCGGAAAACCGCCAGTTGATGGTCAGGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGGTAGTCGAAAAACAGGCTGGGTGTCAGGGCCCGCACCATGTCATCGGCGTTGCCGCCGCTACCCGCACCGGCGGCAACGCCTGGGCGCAATTCCTGCGCGCCACTGa > 1:224683/1‑236 (MQ=255) gtgAGGACGCCGTTGCGCAGGGTGAGGGCGTAGTCTTCGTCCAGGTCGGAAAACCGCCAGTTGATGGTCAGGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGGTAGTCGAAAAACAGGCTGGGTGTCAGGGCCCGCACCATGTCATCGGCGTTGCCGCCGCTACCCGCACCGGCGGCAACGCCTGAGCGCAATTCCTGCGCGCCACTGAGGTAGGCATTGCGcc > 1:505128/1‑235 (MQ=255) aGGACGCCGTTGCGCAGGGTGAGGGCGTAGTCTTCGTCCAGGTCGGAAAACCGCGAGTTTAGGGTCAGGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGGTAGTCGAAAAACAGGctgggt > 2:56272‑M2/1‑126 (MQ=255) ttGCGCAGGGTGAGGGCGTAGTCTTCGTCCAGGTCGGAAAACCGCCAGTTGATGGTCAGGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGGTAGTCGAAAAACAGGCTGGGTGTCAGGGCCCGCACCATGTCATCGGCGTTGCCGCCGCTACCCGCACCGGCGGCaa > 1:41958/1‑178 (MQ=255) tCTTCGTCCAGGTCGGAAAACCGCCAGTTGATGGTCAGGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGcctgtttttcgactacctgggtgttcggg < 2:149761‑M1/109‑30 (MQ=255) tCTTCGTCCAGGTCGGAAAACCGCCAGTTGATGGTCAGGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGGTAGTCGAAAAACAGGCTGGGTGTCAGGGCCCGCACCATGTCATCGGCGTTGCCGCCGCTACCCGCACCGGCGGCAACGCCTGAGCGCAATTCCTGCGCGCCACTGAGGTAGGCAt > 1:227340/1‑196 (MQ=255) cTTCGTCCCGGTCGGAAAACCGCCAGTTGATGGTCAGGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGGTAGTCGAAAAACAGGCTGGGTGTCAGGGCCCGCACCATGTCATCGGCGTTGCCACCGCTACCCGCACCGGCGGCaa > 1:646516/1‑156 (MQ=255) tCCAGGTCGGAAAACCGCCAGTTGATGGTCAGGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGGTAGTCGAAAAACAGGCTGGGGGTCAGGGCCCGCACCATGTCATCGGCGTTGCCGCCGCTACCCGCACCGGCGGCAACGCCTGAGCGCACTTCCTGCGCGCCACTGa > 1:166288/1‑181 (MQ=255) gCCAGTGGCTGCTCCAGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGcctgttttt < 2:715618‑M1/67‑10 (MQ=255) gTTGATGGTCAGGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCAGTCACCCGAACACCCAGGTAGTCGAAAAACAGGCTGGGTGTCAGGGCCCGCACCATGTCATCGGCGTTGCCGCCGCTACCCGCACCGGCGGCAACGCCTGAGCGCAATTCCTGCGCGCCACTGAGGTAGGCATTGCGCCAgg < 2:425653/179‑1 (MQ=255) cAGGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGGTAGTCGAAAAACAGGCTGGGTGTCAGGGCCCGCACCATGTCATCGGCGTTGCCGCCGCTACCCGCACCGGCGGCAACGCCTGAGCGCAATTCCTCCGCGCCACTAAGGTAGGCATTgcgc > 1:33132/1‑166 (MQ=255) ttGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGGTAGTCGAAAAACAGGctgggtgttcgggtgaatgcctacaacgctgccgatagcaacctgaccatcaactggcggttttccgacctggacgaagactacgccctcaccctgcgcaacggcgtcctcacccaccgcgacctggcg > 1:149761‑M2/1‑42 (MQ=255) gTAGGCATTCACCCGAACACCCAGGTAGTCGAAAAACAGGCTGGGTGTCAGGGCCCGCACCATGTCATCGGCGTTGCCGCCGCTACCCGCACCGGCGGCAACGCCTGAGCGCAATTCCTGCGCGCCACTGAGGTAGGCAtt < 2:360753/141‑1 (MQ=255) aCCCGAACACCCAGGTAGTCGAAAAACAGGCTGGGTGTCAGGGCCCGCACCATGTCATCGGCGTTGCCGCCGCTACCCGCACCGGCGGCAACGCCTGAGCGCAATTCCTGCGCGCCACTGAGGTAGGCATTGCGCCAGGTGGCGtt < 2:206499/146‑1 (MQ=255) cccGAACACCCAGGTAGTCGAAAAACAGGctgggtgttcgggtgaatgcctacaacgctgccgatagcaacctgaccatcaactggcggttttccgacctggacgaaga < 2:149761‑M2/109‑81 (MQ=255) gcccAGGTAGTCGAAAAACAGGCTGGGTGGCAGGGCCCGCACCATGTCATCGGCGTTGCCGCCGCTACCCGCACCGGCGGCAACGCCTGAGCGCAATTCCTGCGCGCCACTGAGGTAGGCATTGCGCCAGGTGGCGTTCTCACTCTGGTaa < 2:211908/150‑1 (MQ=255) acCCAGcctgtttttcgactacctgggtgttcgggtgaatgcctacaacgctgccgatagcaacctgaccctaaactcgcggttttccgacctggacgaagactacgccctcaccctgcgcaacggcgtcct > 2:56272‑M1/1‑6 (MQ=255) ccAGcctgtttttcgactccctgggtgttcgggtgaatgcctacaacgctgccgatagcaacctgaccatcaactggcggttttccgacctggacgaagactacgccctcaccctgcgcaacggcgtcctcacccaccgcgacctggcgcgccacgccaaggccgatgtagaggtcatcatgcgcaaacagacactggacagcattgccttgaagcagacaggctttctcaagga < 1:206499‑M1/235‑232 (MQ=255) ccAGcctgtttttcgactacctgggtgttcgggtgaatgcctacaacgctgccgatagcaacctgaccatcaactggcggttttccgacctggacgaagactacgccctcaccctgcgcaacggcgtcctcacccaccgcgacctggcgcgccacgccaaggccgatgtagaggtcatcatgcgcaaacagacactggacagcattgccttgaagcagacaggctttctcaagga < 1:650785‑M1/235‑232 (MQ=255) | TCCTTGAGAAAGCCTGTCTGCTTCAAGGCAATGCTGTCCAGTGTCTGTTTGCGCATGATGACCTCTACATCGGCCTTGGCGTGGCGCGCCAGGTCGCGGTGGGTGAGGACGCCGTTGCGCAGGGTGAGGGCGTAGTCTTCGTCCAGGTCGGAAAACCGCCAGTTGATGGTCAGGTTGCTATCGGCAGCGTTGTAGGCATTCACCCGAACACCCAGGTAGTCGAAAAACAGGCTGGGTGTCAGGGCCCGCACCATGTCATCGGCGTTGCCGCCGCTACCCGCACCGGCGGCAACGCCTGAGCGCAATTCCTGCGCGCCACTGAGGTAGGCATTGCGCCAGGTGGCGTTCTCACTCTGGTAACCCAGTTGCTCCAGCGCGTCGGCCTGCAGTTCGCGGGCCTCGGTGTTGTCTGGCTCGGCGAATACCAGGTGGTTGGCCAATTGCGC > AE015451/2325448‑2325893 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |