New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 3855028 = | 36 (0.900) | 4 (0.110) | 4/320 | NT | 10.1% | coding (175/888 nt) | PP_3403 | putative Quercetin 2,3‑dioxygenase |
? | AE015451 | 3855078 = | 37 (0.970) | coding (125/888 nt) | PP_3403 | putative Quercetin 2,3‑dioxygenase |
CACGCTTGTCCCGCGCCGGCAGGTTCACCCACAGCTGGACCATTTCCAGCGTGCCGCCACTGCGTGCAAAGTCGGGGGAATGAAACTCCTCATGAATGATGCCGTTGGCCGCCGTCATCCACTGCACGTCACCTGGACCGATCAACCCGCCAGCACCGGTGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACAGGCTGCGCACCGGGAAACCATCACCCACCCAATGGGCGTGGGGGCTGCGGTGAATACCCAGAATCGTTTTCATGAGAAGGCTCCTCACTTGGTT > AE015451/3854797‑3855223 | gcagggttgactgttctgcaggtgggacgatgcatgccatttcagccgtctaccgcttgattggcatcattgataaggttacctcaaccaagtgaggagccttctcatgaaaacgattctgggtattcaccgcagcccccacgcccattgggtgggtgatggtttcccggtgcgcagcctgttcacctacgacaacctggccagccagatcagcccgttcctgctgctggaCTAcg > 1:3041‑M1/232‑236 (MQ=255) cgcgCCGGCAGGTTCACCCACAGCTGGACCATTTCCAGCGTGCCGCCACTGCGTGCAAAGTCGGGGGAATGAAACTCCTCATGAATGATGCCGCTGGCCGCCGTCATCCACTGCACGTCACCTGGACCGATCAACCCGCCAGCACCGGTGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGcgtcgt > 2:584914/1‑234 (MQ=255) gCAGGTTCACCCACAGCTGGACCATTTCCAGCGTGCCGCCACTGCGTGCAAAGTCGGGGGAATGAAACTCCTCATGAATGATGCCGTTGGCCGCCGTCATCCACTGCACGTCACCTGGACCGATCAACCCGCCAGCACCGGTGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCtcgggt > 1:438016/1‑235 (MQ=255) cATTTCCAGCGTGCCGCCACTGCGTGCAAAGTCGGGGGAATGAAACTCCTCATGAATGATGCCGTTGGCCGCCGTCATCCACTGCACGTCACCTGGACCGATCAACCCGCCAGCACCGGTGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCg < 1:745717/235‑1 (MQ=255) tGCAAAGTCGGGGGAATGAAACTCCTCATGAATGATGCCGTTGGCCGCCGTCATCCACTGCACGTCACCTGGACCGATCAACCCGCCAGCACCGGTGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACggg > 1:48220/1‑235 (MQ=255) aGTCGGGGGAATGAACCTCCTCATGAATGATGCCGTTGGCCGCCGTCATCCACTGCACGTCACCTGGACCGATCAACCCGCCAGCACCGGTGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATc < 1:54571/236‑1 (MQ=255) aTGAAACTCCTCATGAATGATGCCGTTGGCCGCCGTCATCCACTGCACGTCACCTGGACCGATCAACCCGCCAGCACCGGTGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGcc < 1:345883/235‑1 (MQ=255) gccgccGTCATCCACTGCACGTCACCTGGACCGATCAACCCGCCAGCACCGGTGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTc < 2:438015/215‑1 (MQ=255) aCGTCACCTGGACCGATCAACCCGCCAGCACCGGTGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAAc > 1:396879/1‑207 (MQ=255) gTCACCTGGACCGATCAACCCGCCAGCACCGGTGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATctggct < 2:269478/183‑1 (MQ=255) aCCTGGACCGAGCAACCCGCCAGCACCGGTGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGCTCACGGTCTCGAAGCCGCGATTCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCcagcagca < 1:408419/161‑1 (MQ=255) cAACCCGCCAGCACCGGTGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGCTGCGGATTCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGaaa > 2:59492/1‑121 (MQ=255) agcccGCCAGCACCGGTGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCGCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATc < 2:238096/120‑1 (MQ=255) aaCCCGCCAGCACCGGTGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACa > 1:434889/1‑190 (MQ=255) aaCCCGCCAGCACCGGTGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACAGGCTGCGCACCGGGAAACCATCACCCACCCAATGGGCGTgggg > 2:261248/1‑233 (MQ=255) ccGCCAGCACCGGTGGAGTCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACAGGCTGCGCACCg < 1:494763/199‑1 (MQ=255) cGCCAGCGCCGGGGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATc < 2:118155/118‑1 (MQ=255) tgggtgggtgatggtttcccggtgcgcagcctgttcacctacgacaacctggccagccagatcagcccgttcctgctgctggaCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAACGCATGCGGACCGGAGTAGTCCAGCAGCAGAAACGGGCTGAt < 1:45601‑M1/73‑1 (MQ=255) cAGCACCGGTGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACAGGCTGCGCACCGGGAAACCATCACCCACCCAATGGGCGTGGGGGCTGCGGTg < 1:596696/235‑1 (MQ=255) cGGTGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATctggct > 1:565070/1‑154 (MQ=255) cGGTGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATctggct < 2:565069/154‑1 (MQ=255) gTGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCTGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACAGGCTg > 1:713926/1‑180 (MQ=255) tggtttcccggtgcgcagcctgttcacctacgacaacctggccagccagatcagcccgtgcctgctgctggaCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGACATCATGCGgacgg < 2:549145‑M1/44‑3 (MQ=255) gTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATctggctg > 2:567966/1‑142 (MQ=255) gTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATctggctg < 1:567967/142‑1 (MQ=255) cAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACAGGCTGCGCACCGGGAAACCATc > 2:712482/1‑180 (MQ=255) cAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACAGGCTGCGCACCGGGAAACCATc < 1:712483/180‑1 (MQ=255) ccgcTTGGTAGACGATGGTCACGGTCCCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACAGGCTgc < 2:211850/156‑1 (MQ=255) cACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACAGGCTGCGCACCGGGAAACCATCACCCACCCAATGGGCGTGGGGGCTGCGGTGAATACCCAGAATCGTTTTCATGAGAAgg > 2:572750/1‑233 (MQ=255) aCCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACAGGCTGCGCACCGGGAAACCATCACCCACCCAATGGGCGTGGGGGCTGCGGTGAATACCCAGAATCGTTTTCATGAGAAGGctc > 1:195427/1‑235 (MQ=255) cctacgacaacctggccagccagatcagcccgttcctgctgctggaCTACGCAGCCTCGTGCTCGGGACGGGGCGAAATCATGCGGACCGACGTTGTCCAGCCACAGCAACGGGGTGa < 2:361876‑M1/72‑1 (MQ=255) aCGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACAGGCTGCGCACCGGGAAACCATCACCCACCCAATGGGCGTGGGGGCTGCGGTGAATACCCAGAATCGTTTTCATGAGAAGGCTCCTCACTTGGtt < 1:19922/236‑1 (MQ=255) accctggccagccagatcagcccgttcctgctgctggcCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAAc > 2:131549‑M1/39‑103 (MQ=255) aTGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACAGGCTGCGCACCGGGAAACCATCACCCACCCAATGGGCGTGGGGGCTGCGGTGAATAcc > 2:539829/1‑197 (MQ=255) cACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACAg > 1:112694/1‑135 (MQ=255) aCGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGcgtc > 2:745969/1‑43 (MQ=255) ggTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACAGGCTGCGCACCGGGAAACCATCACCCACCCAATGGGCGTGGGGGCTGCGGTGAATACCCAGAATCGTTTTCATGAGAAGGctcctc < 1:20991/217‑1 (MQ=255) aaGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTc < 2:112694/113‑1 (MQ=255) aGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACAGGCTGCGCACCGGGAAACCATCACCCACCCAATGGGCGTGGGGGCTGCGGTGAATACCCAGAATCGtt > 2:424825/1‑191 (MQ=255) ccGTGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCGTGCGGACGGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACAGGCTGCGCACCGGGAAACCATcac < 2:20735/145‑1 (MQ=255) cgATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACAGGCTGCGCACCGGGAAACCATCACCCACCCAATGGGCGTGGGGGCTGCGGTGAATAc < 2:386242/175‑1 (MQ=255) CTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACAGGCt < 2:162929‑M1/106‑1 (MQ=255) CTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACAGGCt > 1:162929‑M1/1‑106 (MQ=255) | CACGCTTGTCCCGCGCCGGCAGGTTCACCCACAGCTGGACCATTTCCAGCGTGCCGCCACTGCGTGCAAAGTCGGGGGAATGAAACTCCTCATGAATGATGCCGTTGGCCGCCGTCATCCACTGCACGTCACCTGGACCGATCAACCCGCCAGCACCGGTGGAATCACGGTGCTCCAGTTCACCTTGGTAGACGATGGTCACGGTCTCGAAGCCGCGATGCGGATGCTGGCCTACGCCGCGTCGTGCTCGGGTCGGGGTGAAATCATGCGGACCGGCGTAGTCCAGCAGCAGGAACGGGCTGATCTGGCTGGCCAGGTTGTCGTAGGTGAACAGGCTGCGCACCGGGAAACCATCACCCACCCAATGGGCGTGGGGGCTGCGGTGAATACCCAGAATCGTTTTCATGAGAAGGCTCCTCACTTGGTT > AE015451/3854797‑3855223 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |