New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 3981024 | 32 (0.800) | 4 (0.110) | 4/320 | NT | 11.0% | coding (678/1068 nt) | cobW | Protein CobW |
? | AE015451 | = 3981044 | 34 (0.890) | coding (658/1068 nt) | cobW | Protein CobW |
CGGCTTGCCCGGGATGGCGGCGAAGCCTTTGGCGCGCAGGATACCGAACTCCACCACCAACTGGGTCAATGCATCGAGCAGCAGGCTTTCGTCGGCTTCAGGCAGGTCGATGGAGATGGAGTCGAAAGCGTCGTGGTCATGATCGTCATGATCGTCGCCATCGTGGTGCGAATCGTGGTGGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCG > AE015451/3980793‑3981258 | cGGCTTGCCCGGGATGGCGGCGAAGCCTTTGGCGCGCAGGATACCGAACTCCACCACCAACTGGGTCAATGCATCGAGCAGCAGGCTTTCGTCGGCTTCAGGCAGGTCGATGGAGATGGAGTCGAAAGCGTCGTGGTCATGATCGTCATGATCGTCGCCATCGTGGTGCGAATCGTGGTGGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGAACCt > 1:634484/1‑236 (MQ=255) accaccaACTGGGTCAATGCATCGAGCAGCAGGCTTTCGTCGGCTTCAGGCAGGTCGATGGAGATGGAGTCGAAAGCGTCGTGGTCATGATCGTCATGATCGTCGCCATCGTGGTGCGAATCGTGGTGGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCa > 1:102378/1‑235 (MQ=255) cTGGGTCAATGCATCGAGCAGCAGGCTTTCGTCGGCTTCAGGCAGGTCGATGGAGATGGAGTCGAAAGCGTCGTGGTCATGATCGTCATGATCGTCGCCATCGTGGTGCGAATCGTGGTGGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCAcc < 1:514397/217‑1 (MQ=255) gcagcaGGCTTTCGTCGGATTCAGGCAGGTCGATGGAGATGGAGTCGAAAGCGTCGTGGTCATGATCGTCATGATCGTCGCCATCGTGGTGCGAATCGTGGTGGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGcc < 1:253096/185‑1 (MQ=255) cagcagGCTTTCGTCGGCTTCAGGCAGGTCGATGGAGATGGAGTCGAAAGCGTCGTGGTCATGATCGTCATGATCGTCGCCATCGTGGTGCGAATCGTGGTGGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGgcacgcac > 2:276389/1‑234 (MQ=255) cagGCTTTCGTCGGCTTCAGGCAGGTCGATGGAGATGGAGTCGAAAGCGTCGTGGTCATGATCGTCATGATCGTCGCCATCGTGGTGCGAATCGTGGTGGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCggcaag < 2:527063‑M1/157‑7 (MQ=255) gatggagatggaGTCGAAAGCGTCGTGGTCATGATCGTCATGATCGTCGCCATCGTGGTGCGAATCGTGGTGGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCg < 1:510471/235‑1 (MQ=255) ggagatggagTCGAAAGCGTCGTGGTCATGATCGTCATGATCGTCGCCATCGTGGTGCGAATCGTGGTGGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGcc < 1:274219/235‑1 (MQ=255) gagTCGAAAGCGTCGTGGTCATGATCGTCATGATCGTCGCCATCGTGGTGCGAATCGTGGTGGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGcc > 1:115047/1‑201 (MQ=255) agTCGAAAGCGTCGTGGTCATGATCGTCATGATCGTCGCCATCGTGGTGCGAATCGTGGTGGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCg < 2:572975/224‑1 (MQ=255) gtcgtGGTCATGATCGTCATGATCGTCGCCATCGTGGTGCGAATCGTGGTGGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCg < 2:739464/175‑1 (MQ=255) tcgtGGTCATGATCGTCATGATCGTCGCCATCGTGGTGCGAATCGTGGTGGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGt < 1:276390/235‑1 (MQ=255) ggTCATGATCGTCATGATCGTCGCCATCGTGGTGCGAATCGTGGTGGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCgctgctgggcgtgggtgccgagtccgaggcgc < 2:723181‑M2/150‑33 (MQ=255) gatcgtcGCCATCGTGGTGCGAATCGTGGTGGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCa > 1:617679/1‑236 (MQ=255) gcgtcgCCATCGTGGTGCGAATCGTGGTGGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCCCCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGgc < 2:115047/154‑1 (MQ=255) aaTCGTGGTGGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGc < 2:303623/217‑1 (MQ=255) tCGTGGTGGGTCCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAAc < 1:472684/219‑1 (MQ=255) cGTGGTGGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCggcaagctgccactggaggtgctgctgggcgtgggtgccgagtcagaggcgcatatcgatggccgccgaacccaccac > 1:723182‑M1/1‑59 (MQ=255) gtggtgGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCTGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCgctgctgggcgtgggtgccgagtccgaggcgcatatcgatggccgccgaacccaccacg > 1:723182‑M2/1‑78 (MQ=255) gtggtgGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGAt > 1:594415/1‑235 (MQ=255) ggcCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCa < 1:663604/231‑1 (MQ=255) ggcCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCa > 2:663603/1‑231 (MQ=255) catatGCGCCTCGGCCTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGt < 2:560106/154‑1 (MQ=255) gcgcCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCggcaagctgccactggaggtgctgctgggcgtgggtgccgagtccgaggcgcatatcgatggccgccgaacccaccacgattcgcaccacgatggcgacgatcatgacgatcatgacc < 2:723181‑M1/150‑119 (MQ=255) cGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCggcaagctgccactggaggtgctgctggg > 1:555552‑M1/1‑26 (MQ=255) cGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGGCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAg < 1:42957/196‑1 (MQ=255) ggACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAAc > 1:4455/1‑184 (MQ=255) ggACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACCGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTg > 1:355104/1‑234 (MQ=255) aCTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCg > 1:229907/1‑119 (MQ=255) aCTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGGGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGt > 1:182824/1‑213 (MQ=255) cTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTg > 2:444770/1‑171 (MQ=255) aCCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCt < 1:444771/236‑1 (MQ=255) cccACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCCGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGCTTCATGGTCCAgga > 1:193974/1‑204 (MQ=255) cccAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCgctgctgggcgtgggtgccgagtccg > 1:555552‑M2/1‑29 (MQ=255) cccAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCCGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGt > 2:32857/1‑160 (MQ=255) cccAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCgc > 2:591914/1‑235 (MQ=255) ccAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCCGGCCTTCGGCGTCGGTCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGgcg > 2:203279/1‑146 (MQ=255) ccAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTCGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCgg > 1:123062/1‑235 (MQ=255) ccAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTc > 1:191114/1‑205 (MQ=255) agcagcACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCg > 2:269274/1‑204 (MQ=255) caCCTCCAGTGGCGGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGAt < 1:48640/178‑1 (MQ=255) caCCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAggcg > 1:68545/1‑235 (MQ=255) | CGGCTTGCCCGGGATGGCGGCGAAGCCTTTGGCGCGCAGGATACCGAACTCCACCACCAACTGGGTCAATGCATCGAGCAGCAGGCTTTCGTCGGCTTCAGGCAGGTCGATGGAGATGGAGTCGAAAGCGTCGTGGTCATGATCGTCATGATCGTCGCCATCGTGGTGCGAATCGTGGTGGGTTCGGCGGCCATCGATATGCGCCTCGGACTCGGCACCCACGCCCAGCAGCACCTCCAGTGGCAGCTTGCCGCTGCTGGCCTCGATCACTTTCACCGCCGGCGGCAGTTCTTCGGCCACCTCGGCACGCACCTTGGCCAGGCCTTCGGCGTCGATCAGGTCGGCCTTGTTCAACACCACCAGGTCGGCGCTGGCCAGCTGGTCAGCGAACAGCTCGTGCAGGGGCGATTCATGGTCCAGGTTAGGGTCGAGCTTGCGCTGGGCATCGACCTGGTCCGGGTAGGCG > AE015451/3980793‑3981258 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |