New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 4562960 = | 46 (1.150) | 3 (0.080) | 3/322 | NT | 6.4% | coding (901/2316 nt) | vgrG‑III | type 6 secretion system protein |
? | AE015451 | 4563127 = | 44 (1.150) | coding (734/2316 nt) | vgrG‑III | type 6 secretion system protein |
ACGCATCGTTCACGTAGCGGGTGCCTTGTTCAGCGCCAGCCGCTTCTTCCTGCAGGCTGGTGAGCTGGGTACCTTCGTGACACAGGCTGATCACGCGCCAGTGAACATTGAGGTCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGC > AE015451/4562756‑4563193 | aCGCATCGTTCACGTAGCGGGTGCCTTGTTCAGCGCCAGCCGCTTCTTCCTGCAGGCTGGTGAGCTGGGTACCTTCGTGACACAGGCTGATCACGCGCCAGTGAACATTGAGGTCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGgcgc < 1:671942/206‑1 (MQ=255) cGCATCGTTCACGTAGCGGGTGCCTTGTTCAGCGCCAGCCGCTTCTTCCTGCAGGCTGGTGAGCTGGGTACCTTCGTGACACAGGCTGATCACGCGCCAGTGAACATTGAGGTCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCt > 1:487810/1‑236 (MQ=255) tGCCTTGTTCAGCGCCAGCCGCTTCTTCCTGCAGGCTGGTGAGCTGGGTACCTTCGTGACACAGGCTGATCACGCGCCAGTGAACATTGAGGTCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGGGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCgtgg > 2:242034/1‑201 (MQ=255) cgcgcCAGCCGCTTCTTCCTGCAGGCTGGTGAGCTGGGTACCTTCGTGACACAGGCTGATCACGCGCCAGTGAACATTGAGGTCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCg < 2:714457/214‑1 (MQ=255) cAGCCGCTTCTTCCTGCAGGCTGGTGAGCTGGGTACCTTCGTGACACAGGCTGATCACGCGCCAGTGAACATTGAGGTCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAg < 2:476289/192‑1 (MQ=255) cAGCCGCTTCTTCCTGCAGGCTGGTGAGCTGGGTACCTTCGTGACACAGGCTGATCACGCGCCAGTGAACATTGAGGTCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTa > 1:303259/1‑235 (MQ=255) aatcCTGCAGGCTGGTGAGCTGGGTACCTTCGTGACACAGGCTGATCACGCGCCAGTGAACATTGAGGTCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAgcgc < 2:628148/234‑1 (MQ=255) ggTGAGCTGGGTACCTTCGTGACACAGGCTGATCACGCGCCAGTGAACATTGAGGTCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCCCCGc > 2:164946/1‑189 (MQ=255) tGACACAGGCTGATCACGCGCCAGTGAACATTGAGGTCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCAt > 1:426642/1‑172 (MQ=255) tGACACAGGCTGATCACGCGCCAGTGAACATTGAGGTCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACt > 1:159696/1‑236 (MQ=255) cacaGGCTGATCACGCGCCAGTGAACATTGAGGTCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTg > 2:608994/1‑221 (MQ=255) cacaGGCTGATCACGCGCCAGTGAACATTGAGGTCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTg < 1:608995/221‑1 (MQ=255) gATCACGCGCCAGTGAACATTGAGGTCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGcc > 2:454145/1‑235 (MQ=255) cgcgCCAGTGAACATTGAGGTCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGc > 2:693625/1‑216 (MQ=255) gcgcCAGTGAACATTGAGGTCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCgt < 2:377147/127‑1 (MQ=255) gcgcCAGTGAACATTGAGGTCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACg < 2:693807/214‑1 (MQ=255) gAACATTGAGGTCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCg < 1:538727/201‑1 (MQ=255) tGAGGTCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACAGCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGt < 1:97047/185‑1 (MQ=255) tCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCtt > 2:134549/1‑212 (MQ=255) cccGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCa < 2:335208/158‑1 (MQ=255) cgcgGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGaa > 1:751576/1‑236 (MQ=255) ggCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGGGAAGGGCtt > 2:121812/1‑112 (MQ=255) ccGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAAt > 2:608613/1‑145 (MQ=255) ccGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTg < 2:598122/173‑1 (MQ=255) gacgaGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGCCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGCAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCACGTa > 2:161270/1‑156 (MQ=255) gaGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCg < 1:299596/170‑1 (MQ=255) gcgaccaggcccgcgcatgcctgcggcgcttgcgctattgcgagcaggtacgtactgcgcggcaagtGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAg < 1:601690‑M1/29‑1 (MQ=255) gcgaccaggcccgcgcatgcctgcggcgcttgcgctattgcgagcaggtacgtactgcgcggcaagtGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAg > 2:601689‑M1/68‑96 (MQ=255) gTGAAGCTCAGGCCTGTCGGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCAc < 1:201781/236‑1 (MQ=255) gAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACt > 1:144895/1‑235 (MQ=255) cTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGcc < 1:134549/235‑1 (MQ=255) cTCAGGCCTGTCGGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGcc < 1:670082/235‑1 (MQ=255) cAGGCCTGTCTGCAGGCGCCCATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCtt < 2:159696/180‑1 (MQ=255) gCCTGTCTGCAGGCGCACCTCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGc < 2:112721/174‑1 (MQ=255) gCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTGCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGc < 1:71254/174‑1 (MQ=255) tCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGt < 2:751575/210‑1 (MQ=255) atgcctgcggcgcttgcgctattgcgagcaggtacgtactgcgcggcaagtGCAGCGCCGTCCGCCGTGTTTCAGGGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTctggggc < 1:478707‑M1/119‑3 (MQ=255) gCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACg < 1:43567/152‑1 (MQ=255) gCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACg > 2:43567/1‑152 (MQ=255) gCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACCGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTCGGCCgggct > 2:251435/1‑191 (MQ=255) cAGGCGCCCATCGTCGCCTTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCCCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACg < 2:561242/151‑1 (MQ=255) cgcACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCgg > 2:188578/1‑185 (MQ=255) aTCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTcg > 1:445525/1‑199 (MQ=255) aTCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAgtacgta > 2:659373/1‑224 (MQ=255) cgtcgCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATa > 1:384675/1‑235 (MQ=255) aCTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGtg > 2:408706/1‑169 (MQ=255) ttCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCcg > 2:499732/1‑198 (MQ=255) ttCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCa > 1:184363/1‑236 (MQ=255) aTGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGcc < 2:144895/186‑1 (MQ=255) cgtGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGcgcg < 1:454179/229‑1 (MQ=255) gtGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGcc < 2:593500/179‑1 (MQ=255) gtGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCggcaagtg < 1:454146/235‑7 (MQ=255) gcgcAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGc < 1:499733/236‑1 (MQ=255) cgcAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATg > 1:499258/1‑220 (MQ=255) | ACGCATCGTTCACGTAGCGGGTGCCTTGTTCAGCGCCAGCCGCTTCTTCCTGCAGGCTGGTGAGCTGGGTACCTTCGTGACACAGGCTGATCACGCGCCAGTGAACATTGAGGTCTTCCCGCGGGTGGCCGACGAGGGTGAAGCTCAGGCCTGTCTGCAGGCGCACATCGTCGCCCTGCACTTCAGCCAGGCATGCGTCGTGGCGCAGCGCCGTCAGCCGTGTTTCAGTGAAGGGCTTGCCCACCGCATCGCGCTTGTAGCGCCCCGGGTAATCAAAGCGCTCGTAGTCCAGTGACTGGTGCGTGACGCCACTGGTCTGGGCCTTGTGCTCCTGCCGGTAGGCCGGGTTGGTGAAGGTGTAGTCGCGCTGCACTTGCCGCGCAGTACGTACCTGCTCGCAATAGCGCAAGCGCCGCAGGCATGCGCGGGCCTGGTCGC > AE015451/4562756‑4563193 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |