New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 874528 = | 66 (1.650) | 4 (0.110) | 4/316 | NT | 6.4% | coding (107/840 nt) | PP_0759 | conserved exported protein of unknown function |
? | AE015451 | 874551 = | 54 (1.440) | coding (130/840 nt) | PP_0759 | conserved exported protein of unknown function |
GAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGGCGACGAAAATCTTCCCTGCGGCTATGGCAGCCACTGGCGACTCGGCCTAGGATACGGCGCATGTGGATAGGGAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATCAGCAGACCCTGGGTGAAGCATCGAGCAAGGGTGTGCTCGACAAGTCCAGCGCCGATGCCAAGCGTGTGCAGGCCATTGCCAACCGCCTGATCGCCCAGGCGCCCAAATTCCGCCCGGATGCCGCGCAGTGGGACTGGCAAGTCAACGTGATC > AE015451/874329‑874760 | gAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGGCGACGAAAATCTTCCCTGCGGCTATGGCAGCCACTGGCGACTCGGCCTAGGATACGGCGCATGTGGATAGGGAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCAt > 1:426050/1‑236 (MQ=255) gAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGGCGACGAAAATCTTCCCTGCGGCTATGGCAGCCACTGGCGACTCGGCCTAGGATACGGCGCATGTGGATAGGGAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCAt < 1:291402/236‑1 (MQ=255) gCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGGCGACGAAAATCTTCCCTGCGGCTATGGCAGCCACTGGCGACTCGGCCTAGGATACGGCGCATGTGGATAGGGAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGc > 2:366371/1‑228 (MQ=255) gCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGGCGACGAAAATCTTCCCTGCGGCTATGGCAGCCACTGGCGACTCGGCCTAGGATACGGCGCATGTGGATAGGGAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGctct > 1:336641/1‑235 (MQ=255) gCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGGCGACGAAAATCTTCCCTGCGGCTATGGCAGCCACTGGCGACTCGGCCTAGGATACGGCGCATGTGGATAGGGAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACAt < 1:725738/217‑1 (MQ=255) cccGCGAAGAGGCCGGTTCAGGCGACGAAAATCTTCCCTGCGGCTATGGCAGCCACTGGCGACTCGGCCTAGGATACGGCGCATGTGGATAGGGAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGAcc < 2:358139/235‑1 (MQ=255) cgcgAAGAGGCCGGTTCAGGCGACGAAAATCTTCCCTGCGGCTATGGCAGCCACTGGCGACTCGGCCTAGGATACGGCGCATGTGGATAGGGAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGAc < 1:76996/232‑1 (MQ=255) ttCAGGCGACGAAAATCTTCCCTGCGGCTATGGCAGCCACTGGCGACTCGGCCTAGGATACGGCGCATGTGGATAGGGAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGtt > 1:615828/1‑203 (MQ=255) aGGCGACGAAAATCTTCCCTGCGGCTATGGCAGCCACTGGCGACTCGGCCTAGGATACGGCGCATGTGGATAGGGAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGt < 1:133064/235‑1 (MQ=255) aaTCTTCCCTGCGGCTATGGCAGCCACTGGCGACTCGGCCTAGGATACGGCGCATGTGGATAGGGAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGACTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTActt > 1:400246/1‑185 (MQ=255) cTGCGGCTATGGCAGCCACTGGCGACTCGGCCTAGGATACGGCGCATGTGGATAGGGAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATg < 2:426049/202‑1 (MQ=255) gCTATGGCAGCCACTGGCGACTCGGCCTAGGATACGGCGCATGTGGATAGGGAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATca < 2:534507/228‑1 (MQ=255) aGCCACTGGCGACTCGGCCTAGGATACGGCGCATGTGGATAGGGAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATCAGCAGACCCTGGGTGaa < 1:284746/236‑1 (MQ=255) gcaatggcctgcacacgcttggcatcggcgctggacttgtcgagcacacccttgctcgatgcttcacccagggtctgctgatacgactgcgcgtacatctggttgacctcatcggtcgagagcatgctgaacatgtactgttggcgttcgacgccaacagTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATg < 1:449045‑M2/28‑1 (MQ=255) gCCTAGGATACGGCGCATGTGGATAGGGAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGGATCAGCCGACCCTgg > 2:186920/1‑215 (MQ=255) tAGGATACGGCGCATGTGGATAGGGAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATCAGCAGACCCTGGGTGAAGCATCGAGCAAGGGtgtg > 1:644790/1‑235 (MQ=255) ggATACGGCGCATGTGGATAGGGAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATCAGCAGACCCTGGGTGAAGCATCGAGCAAGGGTGTGCTc < 1:186920/236‑1 (MQ=255) ggATACGGCGAATGTGGATAGGGAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATCAGCAGAc < 1:752507/205‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gggAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATCAGCAGACCCTGGGTGAAGCATCGAGCAAGGGTGTGCTCGACAAGTCCAGCGCCGa < 2:649255/233‑1 (MQ=255) ggAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATCAGCAGACCCTGGGTGaa > 1:668015/1‑194 (MQ=255) ggAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATCAGCAGACCCTGGGTGaa < 2:668014/194‑1 (MQ=255) tgtgTTCATGCGTAAGTCTTTTATCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGGCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGct < 2:111822/132‑1 (MQ=255) 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gcggTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATCAGCAGACCCTGGGTGAAGCATCGAGCAAGGGTGTGCTCGACAAGTCCAGCGCCGATGCCAAGCGTGTGCAGGCCATTGCCAACCGCCTGATCGCCCAGGCGCCCAAATTCCGCCCGGATGCCGCGCAGTGGGACTGGCAAGTc < 1:391955/230‑1 (MQ=255) gcggTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACC‑ATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATCAGCAGACCCTGGGTGAAGCATCGAGCAAGGGTGTGCTCGACAAGTCCAGCGCCGATGCCAAGCGTGTGCAGGCCATTGCCAACCGCCTGATCGCCCAGGCGCCCAAATTCCGCCCGGATGCCgcgc > 1:13134/1‑212 (MQ=255) gTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATCAGCAGACCCTGGGTGAAGCATCGAGCAAGGGTGTGCTCGACAAGTCCAGCGCCGATGCCAAGCGTGTGCAGGCCATTGCCAACCGCCTGATCGCCCAGGCGCCCAAATTCCGCCCGGATGCCGCGCAGTGGGACTGGCAAGTCAACGTGATc > 1:500650/1‑236 (MQ=255) CTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATCAGCAGACCCTGGGTGAAGCATCGAGCAAGGGTGTGCTCGACAAGTCCAGCGCCGATGCCAAGCGTGTGCAGGCCATTGCCAACCGCCTGATCGCCCAGGCGCCCAAATTCCGCCCgg < 1:310605‑M1/198‑1 (MQ=255) GGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATCAGCAGACCCTGGGTGAAGCATCGAGCAAGGGTGTGCTCGACAAGTCCAGCGCCGATGCCAAGCGTGTGCAGGCCATTGCCAACCGCCTGATCGCCCAGGCGCCCAAATTCCGCCCGGATGCCGCGCAGTGGGa > 2:718323‑M1/1‑209 (MQ=255) GGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATCAGCAGACCCTGGGTGAAGCATCGAGCAAGGGTGTGCTCGACAAGTCCAGCGCCGATGCCAAGCGTGTGCAGGCCATTGCCAACCGCCTGATCGCCCAGGCGCCCAAATTCCGCCCGGATGCCGCGCAGTGGGa < 1:718324‑M1/209‑1 (MQ=255) GTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTAc < 1:298751‑M1/60‑1 (MQ=255) gAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATCAGCAGACCCTGGGTGAAGCATCGAGCAAGGGTGTGCTCGACAAGTCCAGCGCCGATGCCAAGCGTGTGCAGGCCATTGCCAACCGCCTGATCGCCCAGGCGCCCAAAt > 2:674873/1‑178 (MQ=255) acgccaacagTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATCAGCAGACCCTGGGTGAAGCATCGAGCAAGGGTGTGCTCGACAAGTCCa < 2:289280‑M2/106‑1 (MQ=255) acgccaacagTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATCAGCAGACCCTGGGTGAAGCATCGAGCAAGGGTGTGCTCGACAAGTCCa > 1:289281‑M2/11‑116 (MQ=255) cgccaacagTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATCAGCAGACCCTGGGTGAAGCATCGAGCAAGGGTGTGCTCGACAAGTCCAGCGCCGATGCCAAGCGTGTGCAGGCCATTGCCAACCGCCTGATCGCCCAGGCGCCCAAATTCCGCCCGGATGcc > 2:685858‑M2/10‑189 (MQ=255) aaacagTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATCAGCAGACCCTGGGTGAAGCATCGAGCAAGGGTGTGCTCGACAAGTCCAGCGCCGATGCCAAGCGTGTGCAGGCCATTGCCAACCGCCTGATCGCCCAGGCGCCCAAATTCCGCCCGGATGCCGCGCAGTGGGACTGGCAAg < 2:539622‑M2/199‑1 (MQ=255) acagTACAGGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTAGCAGCAGACCCTGGGTGAAGCATCGAGCAAGGGTGTGCTc < 2:57666‑M2/96‑1 (MQ=255) | GAGCGGGCTTGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGGCGACGAAAATCTTCCCTGCGGCTATGGCAGCCACTGGCGACTCGGCCTAGGATACGGCGCATGTGGATAGGGAGTGTTTTCATGCGTAAGTCTTTTGTCATCAGCCTGCTGAGTGCTGGCATCCTGCTGGCCGGCTGCCAGGCGGTGAATACCACCAGCGGCGGTGCTGTTGGCGTCGAACGCCAACAGTACATGTTCAGCATGCTCTCGACCGATGAGGTCAACCAGATGTACGCGCAGTCGTATCAGCAGACCCTGGGTGAAGCATCGAGCAAGGGTGTGCTCGACAAGTCCAGCGCCGATGCCAAGCGTGTGCAGGCCATTGCCAACCGCCTGATCGCCCAGGCGCCCAAATTCCGCCCGGATGCCGCGCAGTGGGACTGGCAAGTCAACGTGATC > AE015451/874329‑874760 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |