Missing coverage evidence...
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*	*	÷	AE015451	3287123	3287280	158	10 [9]	[9] 10	[PP_2889]	[PP_2889]

GTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATCCCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAGGTCGATGCGCAGGCCGCGCTTGGGCTCGTCCTCGAAGCCGCGGCTTCGGTAGTCGAACCAGCTGAAACGGTCGGTCACGTCCGGGTACAGGTGGCGG  >  AE015451/3287241‑3287513                                         |                                                                                                                                                                                                                                         gTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGC‑TTTCCATCCCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAGGTCGa                                                                                              >  1:390695/1‑180 (MQ=255)      ggTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATCCCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGctgctg                                                                                                                  >  2:16974/1‑156 (MQ=255)             gTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATCCCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAGGTCGATGCGCAGGCCGCGCTTGGGCTCGTCCTCGAAGCCGCGGCTTCGGTAGTCGAACCAGCTGAAAcggtc                           >  1:520850/1‑236 (MQ=255)                         ggCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATCCCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAGGTCGATgcgc                                                                                         <  1:137148/162‑1 (MQ=255)                         ggCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATCCCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAGGTCGATgcgc                                                                                         >  2:137148/1‑162 (MQ=255)                          gCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATCCCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAGGTCGATGCGCAGGCCGCGCTTGGGCTCGTCCTCGAAGCCGCGGCTTCGGTAGTCGAACCAGCTGAAACGGTCGGTCa                      >  1:323137/1‑228 (MQ=255)                          gCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATCCCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAGGTCGATGCGCAGGCCGCGCTTGGGCTCGTCCTCGAAGCCGCGGCTTCGGTAGTCGAACCAGCTGAAACGGTCGGTCa                      <  2:323136/228‑1 (MQ=255)                           cccAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATCCCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAGGTCGATGCGCAGGCCGCGCTTGGGCTCGTCCt                                                                   >  2:566895/1‑182 (MQ=255)                            ccAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATCCCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAGGTCGATGCGCAGGCCGCGCTTGGGCTCGTcc                                                                    >  1:288857/1‑180 (MQ=255)                                         cTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATCCCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAGGTCGATGCGCAGGCCGCGCTTGGGCTCGTCCTCGAAGCCGCGGCTTCGGTAGTCGAACCAGCTGAAACGGTCGGTCACGTCCGGGTACAGGTGGCgg  >  2:446128/1‑233 (MQ=255)                                         |                                                                                                                                                                                                                                         GTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATCCCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAGGTCGATGCGCAGGCCGCGCTTGGGCTCGTCCTCGAAGCCGCGGCTTCGGTAGTCGAACCAGCTGAAACGGTCGGTCACGTCCGGGTACAGGTGGCGG  >  AE015451/3287241‑3287513

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑