| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | AE015451 | 204,224 | T→C | 7.5% | L3244L (TTG→CTG) | PP_0168 → | putative surface adhesion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AE015451 | 204,224 | 0 | T | C | 7.5% | 192.1 / 3.0 | 64 | L3244L (TTG→CTG) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (27/31); new base C (2/3); total (29/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 | |||||||||||
GAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATCAATAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGCACTGCAACC > AE015451/204001‑204448 | gaACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGcc < 1:695312/235‑1 (MQ=35) aCGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCcgcg < 2:695601/236‑1 (MQ=37) tctgcccGTCAACCAGCCGCTGGCGCACGGCCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGtt < 2:244395/198‑1 (MQ=16) aCGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGAcaccac > 1:631012/1‑235 (MQ=255) aCGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGGGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGGGCCGCGAAGGCGGATgg > 1:240294/1‑222 (MQ=255) gTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGa < 2:482353/227‑1 (MQ=255) cTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACcgc < 1:702992/236‑1 (MQ=40) cTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTTTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCg > 2:642068/1‑234 (MQ=16) caacaaTGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGAcc > 1:488960/1‑235 (MQ=255) aaTGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCGGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAg < 1:7582/235‑1 (MQ=255) tGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCg < 1:318745/236‑1 (MQ=255) aGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTgag > 1:428531/1‑236 (MQ=255) ccATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAc < 1:552426/235‑1 (MQ=255) cAAGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTTTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTTGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTaca < 1:401240/236‑1 (MQ=255) aaGGCTGGCGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCGCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTaca < 1:642069/235‑1 (MQ=255) ccGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGGGAGATCACTTACACCAtt > 1:188224/1‑236 (MQ=255) ccGCTGAAACCAGCGCTCCGTCCACCCACGCTGCTCAGGGTGATGCCGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACcg < 2:209619/168‑1 (MQ=255) acCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAc < 2:254060/203‑1 (MQ=255) acCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTCGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTg < 1:686674/196‑1 (MQ=255) ctgctCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAGCTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAc < 1:178791/196‑1 (MQ=255) ctgcgCAGGGTGATGACGTTTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCACCTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTGGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCg > 2:277931/1‑233 (MQ=11) tgctCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGa > 2:649438/1‑222 (MQ=255) aGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTgg > 2:686673/1‑170 (MQ=40) agagacagcGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATCAATAAcc < 1:76083/227‑1 (MQ=255) cGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTa > 2:344777/1‑183 (MQ=255) cGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATCAATAACcacaat > 2:451264/1‑230 (MQ=255) cGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATCAATAACCACAGTGCAt > 1:448542/1‑236 (MQ=255) ttACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGCATCACCTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATCAATAACCACAGTGc < 1:678378/230‑1 (MQ=255) tACACCGACGCTGGCCAGCTCAGCCTGGGTATCGACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATCAATAACCACAGTGCATTg < 2:188224/234‑1 (MQ=255) aCAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGACGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCg > 2:504317/1‑159 (MQ=255) aaCGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATCAATAACCACAGTGCATTGACCt > 1:708543/1‑235 (MQ=255) ccgacgCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCACCTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATCAATAAc < 1:130071/217‑1 (MQ=255) acgCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGTACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGGCGGCTTGCCGATCAATAACCACAGTGCATTGAc < 2:531440/229‑1 (MQ=255) cTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACcgct > 2:76083/1‑108 (MQ=25) cTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATCAATAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCt > 1:270320/1‑235 (MQ=255) tGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGGGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGGgaggt > 1:157264/1‑160 (MQ=255) gATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATCAATAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACg < 1:66974/236‑1 (MQ=255) tCAGCCTGGGCATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATCAATAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGc < 1:526029/236‑1 (MQ=255) cAGCCTGGGGATGAACTGGGCGGTGGCCGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCGCGAGTTGGGCGGGGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACACCTTCGGTGACCGAAGGCGGt < 2:237899/148‑1 (MQ=11) cTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGCGCCGCGAAGGt > 1:254319/1‑63 (MQ=25) tCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATCAATAACcac > 1:603997/1‑189 (MQ=255) cggTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCTAAGGTGGATGTGACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCAtt < 1:729041/146‑1 (MQ=255) cggTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAc < 1:649561/136‑1 (MQ=255) cggTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAc > 2:649560/1‑136 (MQ=255) cggTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCAtt > 2:729040/1‑146 (MQ=255) cggTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGa > 2:544654/1‑163 (MQ=255) cggTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATCAATAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGAc > 1:574671/1‑212 (MQ=255) cGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCtt < 2:182329/162‑1 (MQ=255) gCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATCAATAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAAc > 1:361372/1‑234 (MQ=255) taCTGCTGCGACCTCCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGc < 2:583009/160‑1 (MQ=255) cTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCGTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATc < 2:486450/164‑1 (MQ=255) tgctGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAc < 2:527638/120‑1 (MQ=255) gctGCGACCTTCGAGAACCTCGAGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGc < 2:574891/155‑1 (MQ=255) gTGCGACCGTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTTGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATCAATAACCACAGTGc < 2:17996/175‑1 (MQ=255) cGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATCAATAACCACAGTGc < 1:667994/172‑1 (MQ=255) ttCGAGAACCTGGCGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTg > 2:490545/1‑106 (MQ=255) ttCGAGAACCTGGCGCTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTg < 1:490546/106‑1 (MQ=255) ttCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTgg < 2:132420/37‑1 (MQ=40) ttCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGc < 2:485071/148‑1 (MQ=255) ttCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGc > 1:485072/1‑148 (MQ=255) ttCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATCAATAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGCACTg > 2:455692/1‑235 (MQ=255) acccTCGAGGTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATCAATAAcc < 2:126672/152‑1 (MQ=255) cGAGTTGGGCGGTGCGGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAc < 2:583391/102‑1 (MQ=255) cGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCAc > 1:583392/1‑102 (MQ=255) cGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATCAATAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGCGCCGGCCAACGGCACCGTGGGCACTGCAAcc > 2:245171/1‑229 (MQ=255) | GAACGTCAAACCGACCTTCACTGTTCACGTCAACCAGCCGCTGGCTCACGACCTGGTCGTGACCCTGAGCAACAATGCCCAGGTCACCATCAAGGCCGGTGAAACCAGCGCGCCGTACACCCACGCTGCTCAGGGTGATGACGTCTACAACGACGCTGGCCAGATCAGCCTGGGTATCAACTCGGCGGTGGACGCCACTGGTGCGACCTTCGAGAACCTCGAGTTGGGCGGTGCCGCGAAGGTGGATGTCACCGACACCACCGACGAAGTGGTGGCCAAGTTGACCGCGACCCCTTCGGTGACCGAAGGCGGTGAGATCACTTACACCATTACCCTGACCAACAAAGACGGCTTGCCGATCAATAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCCAACGGCACCGTGGGCACTGCAACC > AE015451/204001‑204448 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |