| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | AE015451 | 1,530,160 | C→T | 100% | R395C (CGT→TGT) noncoding (49/244 nt) |
ftsZ → PP_mr19 → |
Cell division protein FtsZ Xoo8 ncRNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AE015451 | 1,530,160 | 0 | C | T | 96.3% | 195.0 / ‑1.2 | 54 | R395C (CGT→TGT) noncoding (49/244 nt) | ftsZ PP_mr19 | Cell division protein FtsZ Xoo8 ncRNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base T (18/34); total (19/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.77e-01 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
GCACGCATCGAGAAGCCTGTGAAGGTGGTCGACAATACCCTGCAGACTGCCCAGCAGGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCACTCCGGGGAGAAGGTTTACCTGACCCTCAAGCCTGCACCTGTTG > AE015451/1529929‑1530386 | gcacgcaTCGAGAAGCCTGTGAAGGTGGTCGACAATACCCTGCAGACTGCCCAGCAGGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCgttgtc < 1:387421/235‑1 (MQ=255) aaGGTGGTCGACAATACCCTGCAGACTGCCCAGCAGGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTAt < 1:265370/235‑1 (MQ=255) ggtggtCGACAATACCCTGCAGACTGCCCAGCAGGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGCTTACTGGAATTTATCAg > 1:678804/1‑236 (MQ=255) tggtCGACAATACCCTGCAGACTGCCCAGCAGGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTAt < 2:676578/231‑1 (MQ=255) gtCGACAATACCCTGCAGACTGCCCAGCAGGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGt < 1:544639/236‑1 (MQ=255) tACCCTGCAGACTGCCCAGCAGGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGt < 1:403250/236‑1 (MQ=255) ccAGCAGGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGt > 2:483606/1‑213 (MQ=255) cagcagGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATaaa > 1:292770/1‑217 (MQ=255) cagcagGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTAtt < 2:414986/230‑1 (MQ=255) agcagGCGTGCGAAGCGGCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTa < 2:157145/203‑1 (MQ=255) agcagGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCaaa < 1:426557/236‑1 (MQ=255) acGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTg < 2:443006/235‑1 (MQ=255) cGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTgg < 1:92139/236‑1 (MQ=255) aGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGt < 1:2864/235‑1 (MQ=255) gCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGt < 1:338638/234‑1 (MQ=255) ccAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTatca > 1:676476/1‑235 (MQ=255) aaTCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATtcat < 2:594149/212‑1 (MQ=255) cTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTg < 2:311875/200‑1 (MQ=255) cTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAg < 1:329239/236‑1 (MQ=255) cgcCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAgggg > 2:740489/1‑175 (MQ=255) cgcCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGa > 1:306499/1‑235 (MQ=255) agccagcGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGc < 1:483793/236‑1 (MQ=255) agccagcGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGATGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGAtt > 2:327492/1‑178 (MQ=255) aacGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCACCCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTg < 2:251069/190‑1 (MQ=255) tCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGGCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGta > 2:309086/1‑158 (MQ=255) tACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCaaa < 2:608509/177‑1 (MQ=255) cGTGACCTGGCGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTg < 2:95020/162‑1 (MQ=255) ccTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGt < 2:533970/181‑1 (MQ=255) ccTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAAt > 1:492624/1‑236 (MQ=255) ccTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAAt > 1:377678/1‑236 (MQ=255) cgcCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGCTCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTAt < 2:230309/130‑1 (MQ=255) gcccgcccGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGAt < 1:88165/236‑1 (MQ=255) gcCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCGCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTAACAgg > 2:573285/1‑133 (MQ=255) cccGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGTCCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCCGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGcc < 2:408034/186‑1 (MQ=255) gACCGGCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTGCCTCGATATCGCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCa < 2:83274/127‑1 (MQ=255) ccGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATcccc < 1:677002/177‑1 (MQ=255) ccGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATcccc > 2:677001/1‑177 (MQ=255) cGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAaaca < 1:49417/235‑1 (MQ=255) aaCCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCAccc < 2:676475/233‑1 (MQ=255) aaCCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCt < 1:284634/234‑1 (MQ=255) aGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATg < 2:264502/203‑1 (MQ=255) ctgcCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGt < 1:581638/137‑1 (MQ=255) ctgcCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTCATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGt > 2:581637/1‑137 (MQ=255) tgcCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAaaca < 1:609470/205‑1 (MQ=255) ccGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAg < 1:348838/140‑1 (MQ=255) gCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCaa < 2:742626/180‑1 (MQ=255) aaaCTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCACGATATCCCGGCATTCCTGCTTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGAt < 2:478262/186‑1 (MQ=255) aTGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAaacaa > 1:210170/1‑177 (MQ=255) tCGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCACTCCGGGGAGAAGGTTTACCTGACCCt > 2:669591/1‑233 (MQ=255) cGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTc > 1:436950/1‑197 (MQ=255) cGATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCACTACGGGGAGAAGGTTTAcagcaccc > 1:209312/1‑224 (MQ=255) gATATCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCACTCCGGGGAGAAGGTTTACCTGACCCTCAAGc < 1:483607/236‑1 (MQ=255) tCCCGGCATTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCACTCCGGGGAGAAGGTTTACCTGACCCTCAAGCCTg > 1:669295/1‑235 (MQ=255) aTTCCTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCACTGCCATGATTAaacaac > 2:376095/1‑150 (MQ=255) ccTGCGTTGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCACTCCGGGGAGAAGGTTTACCTGACCCTCAAGCCTGCACCTGTTg < 1:669592/234‑1 (MQ=255) | GCACGCATCGAGAAGCCTGTGAAGGTGGTCGACAATACCCTGCAGACTGCCCAGCAGGCGTACGAAGCGTCCAATCCTGCGCCGGTGCGCCAGGAGCAGCCAGCGGTCAACTACCGTGACCTGGAGCGCCCGACCGTCATGCGCAACCAGGCGCATGCAGGTGCTGCCGCAGCCGCTAAACTGAACCCTCAGGATGACCTGGACTACCTCGATATCCCGGCATTCCTGCGTCGTCAGGCTGATTAATGGAATTTATCAGGGGTATAAAGGTGATTGGTATTCATCAAAGGTTGGGTCTGTTATCATCCCCAGCCTTTGTTGATACCTGTTCGCAATTTGCGCTGAAGCGGCCAATGCCATGATTAAACAACGCACCCTGAAGAATACCATCCGTGCCACAGGTGTCGGTCTGCACTCCGGGGAGAAGGTTTACCTGACCCTCAAGCCTGCACCTGTTG > AE015451/1529929‑1530386 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |