New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GACGGCTGGGCCAGCATCAGCTCGACGGCCTTGGCCTGGTCGAGGTCTGCCTTGCTGGCGTCGTCCAGCTTGCGGAAGGTGGTGCCGGCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGTCGCTGTGCATCTCGACCTTCTTCGTCATGTAGCCTGGCCGCCAGGGA > AE015451/1737756‑1738211 | aCGGCTGGGCCAGCATCAGCCCGACGGCCTTGGCCTGGTCGAGGTCTGCCTTGCTGGCGTCGTCCAGCTTGCGGAAGGTGGTGCCGGCACGGTTGAGGATGACTTCCCAGCCGTGTTCGTCGCACCAGCGGTTCAGGCTGTCACGGTCGATGCCTTGGGTTTTGTAATCATGGAATTCGTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCt < 1:592937/236‑1 (MQ=255) ggatctcgagtttgttcgggttgagaatttttcagatcaagatcacggacggatcttggtcggcagaacgcctgggaaggatatcgttgcgtaaatcttccccaaaatgcatccgtaaacacctgattctattggggtcgaaacgaacaaaaaaggcgcaattccgatgcgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCt > 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ttgtttcggtttgagaatttttcagatcaagatcacggacggatcttggtcggcagaacgcctgggaaggatatcgttgcgtaaatcttccccaaaatgcatccgtaaacacctgattctattggggtcgaaacgaacaaaaaaggcgcaattccgatgcgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCttt > 1:288410‑M1/220‑227 (MQ=255) ttgtttcggtttgagaatttttcagatcaagatcacggacggatcttggtcggcagaacgcctgggaaggatatcgttgcgtaaatcttccccaaaatgcatccgtaaacacctgattctattggggtcgaaacgaacaaaaaaggcgcaattccgatgcgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCTTTGATGCCGt > 1:749820‑M1/220‑235 (MQ=255) tgtttcggtttgagaatttttcagatcaagatcacggacggatcttggtcggcagaacgcctgggaaggatatcgttgcgtaaatcttccccaaaatgcatccgtaaacacctgattctattggggtcgaaacgaacaaaaaaggcgcaattccgatgcgccatatttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCTTTGATGCCGt > 2:1019252‑M1/219‑234 (MQ=255) 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(MQ=255) tatgtgcttgaaggcattgatttaactgggcttgagtcggtttaacttggcgtccCAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAAc > 1:31560‑M1/56‑219 (MQ=255) atttgctttaaggcattgatttaactgggctttagtcggtttaacttggcgtccCAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAATATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCAc > 2:768751‑M1/55‑191 (MQ=255) gTAGGCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTATGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGTTTACTCCCCAAACCGTCCCCAATATCTCCCa > 2:636387/1‑135 (MQ=255) gCGATGGCTTTGTCTTCGAGCCAGGTACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGaa > 1:558438/1‑211 (MQ=255) 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1:1059055/1‑236 (MQ=255) tACGCGCCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGTCGCtg > 2:875089/1‑206 (MQ=255) agtcggtttaacttggcgtccCAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGTCGCTGTGCATCTCGAc > 1:240475‑M1/22‑215 (MQ=255) gcCTTTTTCATGGTGTCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCACGGCTGTCACGGTATAGATCGGTCATCTTGGCCGAACGGTGACCCAGCAGTCGCTGTGCATCTCGACCTTCTTCGTCATGTAGCCt < 1:650184/231‑1 (MQ=255) cgttttCATGGGGGCACAGGCTTTGATGCCGTAAAGAGTGTAAGTCATTGAATTTAAAGGGGCTGGGATTACTCCCCAAAACCTCCCCAATATCTCCCAAAAATTAGTCGCAGGATTATGCGACATCGATCCACTCAGCGCCAc < 2:5381/142‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |