| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | AE015451 | = 5590527 | 60 (0.970) | 4 (0.070) | 4/326 | NT | 6.5% | coding (197/801 nt) | pde | 3',5'‑cyclic‑nucleotide phosphodiesterase |
| ? | AE015451 | = 5590530 | 59 (1.010) | coding (194/801 nt) | pde | 3',5'‑cyclic‑nucleotide phosphodiesterase | |||||
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gTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCAgcgtggcatcctatgaagcgtttcgggagctgaccgcaccgtttgccgtacccactcgctggctgccgggcaaccatgacgaggctcaggtgatggcgcaggtggc < 1:70424‑M1/158‑107 (MQ=255) gggTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCt < 2:1039717/119‑1 (MQ=255) aCGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGGGGCGCAGGCTGGCTCgggg > 2:267017/1‑145 (MQ=255) cGGCAAACGGTGCGGCCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTGGGCATCGGTCAGTTGCACCACATGCACGGGGCGGGATTGGTCTggcggc < 1:456183/236‑1 (MQ=255) aCGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCAgcgtggcatcctatgaagcgtttcgggagctgaccgcaccggttgccgtacccactcgctggctgccgggcaaccatgccggg > 2:70424‑M1/1‑39 (MQ=255) cGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCg < 1:857919/164‑1 (MQ=255) gTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTGGGCATCGGt > 2:845617/1‑187 (MQ=255) gTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATACTGGGACAGGTCGCCCGTGCTCAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTGGGCATCGGTCAGTTGCACCACATGCACGGGGCGGGAtt > 2:1088830/1‑211 (MQ=255) cTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGTCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGccc < 2:575163/136‑1 (MQ=255) cccGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTGGGCATCGGTCAGTTGCACCACATGCACGGGGCGGGATTGGTCTGGCGGCGACAACGGCCATctcctc > 1:512215/1‑233 (MQ=255) tgtcccaGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCGCGGGTCTTGAGGCCCAGCCTGCTGCCAGCCGGCGCGGCGAACAg > 2:325852/7‑154 (MQ=255) ttCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTGGGCATCGGTCAGTTGCACCACATGCACg < 2:465680/184‑1 (MQ=255) cATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTGGGCATCGGTCAGTTGCACCACATGCACg > 2:1075580/1‑182 (MQ=255) tAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTGGGCATCGGTCAGTTGCACCACATGCACGGGGCGGGATTGGTCTGGCGGCGACAACg > 2:831044/1‑208 (MQ=255) gCCAgcgtggcatcctatgaagcgtttcgggagctgaccgcaccgtttgccgtacccactcgctggctgccgggcaaccatgacgaggctcaggtgatggcgcaggtggcgcctgaactggtgcaggcggtgactgatatcggcgcgtggcgggtggtcatgctcaacaccgccgtgcagggtgctacccacgggtttctgcaagatgaccagctggccgtactggaagccgcctt > 1:1030527‑M1/1‑4 (MQ=255) ccACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTGGGCATCGGTCAGTTGCACCACATGCACGGGGCGGGATTGGTCTGGCGGCGACAACGGCCac > 1:369758/1‑205 (MQ=255) cACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTGGGCATCGGTCAGTTGCACCACATGCACGGGGCGGGATTGGTCTGGCGGCGACAACGGCCATCTCCTCGAATGGATTCAGCGGGAATTATgg > 1:737573/1‑235 (MQ=255) aCGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTGGGCATCGGTCAGTTGCACCACATGCACGGGGCGGGATTGGTCTGGCGGCGACAACGGCCATCTCCTCGAATGGATTCAGCGGGa > 1:527301/1‑227 (MQ=255) aCGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGGCGGCGAACAGGTGGGCATCGGTCAGGTGCACCACATGCACGGGGCGGGag > 2:137206/1‑179 (MQ=255) aCGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGGCTTGAGGCCCAGCATACTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTGGGCATCGGGCAGTTGCACcaca > 2:1110425/1‑165 (MQ=255) aCGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCCGGTCTTGAGGCCCAACATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTGGGCATCGGTCAGTTGCACCACATGCACGGGGCGGGATTGGTCTGGCGGCGACAACGGCCATCTCCTCGAATGGATTCAGCGGGAATTATg > 2:616872/1‑233 (MQ=255) | TTTCAAGGCGGCTTCCAGTACGGCCAGCTGGTCATCTTGCAGAAACCCGTGGGTAGCACCCTGCACGGCGGTGTTGAGCATGACCACCCGCCACGCGCCGATATCAGTCACCGCCTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTGGGCATCGGTCAGTTGCACCACATGCACGGGGCGGGATTGGTCTGGCGGCGACAACGGCCATCTCCTCGAATGGATTCAGCGGGAATTATGG > AE015451/5590295‑5590760 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |