| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 4694645 = | 73 (1.180) | 4 (0.070) | 4/328 | NT | 5.7% | coding (2520/2931 nt) | PP_4154 | putative class 3 aminotransferase |
| ? | AE015451 | 4694673 = | 62 (1.050) | coding (2548/2931 nt) | PP_4154 | putative class 3 aminotransferase | |||||
AGCCTATGCCAAGGTCCGCGCCCGCGGCGGGGTGTGCATCGCCGACGAAGTGCAGGTAGGCTATGGCCGCCTGGGCGAGTACTTCTGGGGCTTCGAGGAACAGGGCGTGGTGCCGGACATCATTACCATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTGGGTCTGGAACTGGTGCGCGACCGCACCACCCTGGAGCCGGCCACCGAAGAAACCATG > AE015451/4694444‑4694900 | aGCCTATGCCAAGGTCCGCGCCCGCGGCGGGGTGTGCATCGCCGACGAAGTGCAGGTAGGCTATGGCCGCCTGGGCGAGTACTTCTGGGGCTTCGAGGAACAGGGCGTGGTGCCGGACATCATTACCATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCg > 2:429084/1‑230 (MQ=255) gtgcggtcgcgcaccagttccagacccaggtagaagcccgagccatgtgccgcgccggccagcgggtgcttgtcgaccagcgcctgcaggcgtgccttgaagtagcgcccggtgtcacgggcgttgtcccacaggccttcctcctgcatgacatccagcactgccatgccgatgcggcaactgaccgggctgccaccggccgaggagaagaagtagccctcggccGGTGGCAGccc < 1:1040592‑M2/11‑1 (MQ=255) ccGCGCCCGCGGCGGGGTGTGCATCGCCGACGAAGTGCAGGTAGGCTATGGCCGCCTGGGCGAGTACTTCTGGGGCTTCGAGGAACAGGGCGTGGTGCCGGACATCATTACCATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGt > 1:948138/1‑228 (MQ=255) gcCCGCGGCGGGGTGTGCATCGCCGACGAAGTGCAGGTAGGCTATGGCCGCCTGGGCGAGTACTTCTGGGGCTTCGAGGAACAGGGCGTGGTGCCGGACATCATTACCATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCa > 2:580406/1‑226 (MQ=255) gcCCGCGGCGGGGTGTGCATCGCCGACGAAGTGCAGGTAGGCTATGGCCGCCTGGGCGAGTACTTCTGGGGCTTCGAGGAACAGGGCGTGGTGCCGGACATCATTACCATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCa < 1:580407/226‑1 (MQ=255) gggTGTGCATCGCCGACGAAGTGCAGGTAGGCTATGGCCGCCTGGGCGAGTACTTCTGGGGCTTCGAGGAACAGGGCGTGGTGCCGGACATCATTACCATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATg < 2:597064/233‑1 (MQ=255) gtgtGCATCGCCGACGAAGTGCAGGTAGGCTATGGCCGCCTGGGCGAGTACTTCTGGGGCTGCGAGGAACAGGGCGTGGTGCCGGACATCATTACCATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGt < 1:922284/236‑1 (MQ=255) gCCGACGAAGTGCAGGTAGGCTATGGCCGCCTGGGCGAGTACTTCTGGGGCTTCGAGGAACAGGGCGTGGTGCCGGACATCATTACCATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGc < 1:866834/210‑1 (MQ=255) gCCGACGAAGTGCAGGTAGGCTATGGCCGCCTGGGCGAGTACTTCTGGGGCTTCGAGGAACAGGGCGTGGTGCCGGACATCATTACCATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGAt > 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cGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACtt > 2:114035/1‑172 (MQ=255) gCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCTAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGGGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAgg < 1:332893/188‑1 (MQ=255) tccagcactgccatgccgatgcggcaactgaccgggctgccaccGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCggg > 1:496070‑M1/45‑162 (MQ=255) gCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGc > 2:864636/1‑204 (MQ=255) tgccgatgcggcaactgaccgggcggccaccGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCCTCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGgccc < 2:496069‑M1/93‑2 (MQ=255) ccGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGCCGACGCCCGTGa > 2:656197/1‑138 (MQ=255) cgAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGCGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCAt > 2:73564/1‑81 (MQ=255) cgAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTGGGTCTGGAACTGGTg > 1:503870/1‑235 (MQ=255) gAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTGGGTCTGGAACTGGTgcg < 1:203213/236‑1 (MQ=255) cGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCGACTTCTTCTCCACGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGCAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTGGGTCTGGAACTGGTGCGCGAcc < 2:1072748/233‑1 (MQ=255) gggctgccaccGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTGGGTCTGGAACTGGTGCGCGACCGcac < 1:1040592‑M1/225‑1 (MQ=255) ggAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTGGGTCTGGAACTGGTGCGCGACCGcacc < 1:429085/229‑1 (MQ=255) GGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTGGGTCTGGAACTGGTGCGCGACCGCACCACCCTg < 1:299509‑M1/226‑1 (MQ=255) GGCTCCTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTGGGTCTGGAACTGGTGCGCGACCGCACCACCCTGGAGCCGGCCAc > 1:299745‑M1/1‑236 (MQ=255) cgcctcggccGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTGGGTCTGGAACTGGTGCGCGACCGCACCACCCTGGAGCCGGccagc < 1:147911‑M2/216‑3 (MQ=255) gcctcggccGGTGGCAGCCCGGGCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTgg < 2:1026070‑M2/172‑1 (MQ=255) gccgcggccGGTGGCAGCTCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTgg < 1:689336‑M2/172‑1 (MQ=255) cctcggccGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTGGGTCTGGAACTGGTGCGCGAcc < 2:573708‑M2/193‑1 (MQ=255) cctcggccGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTGGGTCTGGAACTGGTGCGCGAcc > 1:573709‑M2/9‑201 (MQ=255) ctcggccGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACa > 1:854942‑M2/8‑134 (MQ=255) ctcggccGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTGGGTCTg > 2:548627‑M2/8‑184 (MQ=255) ctcggccGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTGGGTCTGGAACTGGTGCGCGACCGCACCACCCTGGAGCCGGCCACCGAAGAAACCatg > 1:790983‑M2/8‑235 (MQ=255) ctcggccGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGACATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTGGGTCTGGAACTGGTGCGCGACCGCACCACCCTGGAGCCGGCCACCGAAGaaa < 1:707509‑M2/223‑1 (MQ=255) gccGGTGGCAGGGCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCa < 2:100981‑M2/49‑1 (MQ=255) ccGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCCCTGGCCGgc > 1:187085‑M2/3‑146 (MQ=255) ggTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTGGGTCTGGAACTgg > 2:926675/1‑184 (MQ=255) | AGCCTATGCCAAGGTCCGCGCCCGCGGCGGGGTGTGCATCGCCGACGAAGTGCAGGTAGGCTATGGCCGCCTGGGCGAGTACTTCTGGGGCTTCGAGGAACAGGGCGTGGTGCCGGACATCATTACCATGGCCAAGGGCATGGGTAACGGCCAGCCGCTGGGCGTGGTCATCACCCGTCGCGAAATCGCCGAGGCGCTGGAGGCCGAGGGCTACTTCTTCTCCTCGGCCGGTGGCAGCCCGGTCAGTTGCCGCATCGGCATGGCAGTGCTGGATGTCATGCAGGAGGAAGGCCTGTGGGACAACGCCCGTGACACCGGGCGCTACTTCAAGGCACGCCTGCAGGCGCTGGTCGACAAGCACCCGCTGGCCGGCGCGGCACATGGCTCGGGCTTCTACCTGGGTCTGGAACTGGTGCGCGACCGCACCACCCTGGAGCCGGCCACCGAAGAAACCATG > AE015451/4694444‑4694900 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |