| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | 4972749 = | 71 (1.150) | 3 (0.050) | 3/330 | NT | 4.6% | coding (799/1566 nt) | flgL | Flagellar hook‑associated protein FlgL |
| ? | AE015451 | 4972820 = | 56 (0.940) | coding (728/1566 nt) | flgL | Flagellar hook‑associated protein FlgL | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGAAAATGCTGTAGCCGGTGTCGTTGGTCGCCAGGCGCAAGGTGTCGGACACCTGCA > AE015451/4972590‑4973054 | ccTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATccc < 1:474032/234‑1 (MQ=255) cTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTc < 1:343532/235‑1 (MQ=255) cgcCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATcc > 2:875791/1‑229 (MQ=255) gTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCt < 2:1114468/233‑1 (MQ=255) gTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCAc < 2:487777/222‑1 (MQ=255) cgcgCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACt > 2:960199/1‑234 (MQ=255) cgcgTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTg < 1:990261/228‑1 (MQ=255) cgTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTg < 1:984314/235‑1 (MQ=255) gTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTgg > 2:532494/1‑226 (MQ=255) tGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATa < 1:1050987/235‑1 (MQ=255) aGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTgg < 2:31306/211‑1 (MQ=255) tATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGa < 1:426976/236‑1 (MQ=255) tCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCt > 2:577865/1‑188 (MQ=255) ggcttggcttCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCAt > 1:790463/1‑181 (MQ=255) cttCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCCTTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCa > 1:341010/1‑180 (MQ=255) ttCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGc > 2:889886/1‑228 (MQ=255) tCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTc < 1:659074/177‑1 (MQ=255) gggTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGt > 1:38667/1‑202 (MQ=255) gggTGAAAACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCt < 1:822287/178‑1 (MQ=255) gAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAgg < 2:426540/197‑1 (MQ=255) gacacATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTc < 2:811193/167‑1 (MQ=255) gcaTGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCGTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATCGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTa < 2:142663/172‑1 (MQ=255) acaTGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCAc < 1:571971/167‑1 (MQ=255) ggCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGgtggtg < 1:532495/236‑1 (MQ=255) gCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAggtgg < 1:878579/233‑1 (MQ=255) acgacgGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTg > 2:437580/1‑168 (MQ=255) acgacgGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAgg > 1:66806/1‑181 (MQ=255) gacgGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGt < 2:856447/234‑1 (MQ=255) 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cACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACt > 1:976746/1‑154 (MQ=255) cACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGc > 1:644630/1‑236 (MQ=255) ccTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCa > 1:1046873/1‑235 (MQ=255) gtCCGCCAGGGTCAGGTGGAGCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGt < 2:195632/212‑1 (MQ=255) ttGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCgg < 1:960200/236‑1 (MQ=255) ttGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCgg < 1:685851/236‑1 (MQ=255) aTCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACCTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGa < 1:109682/236‑1 (MQ=255) tctcGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGAc > 1:1072211/1‑236 (MQ=255) tcGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGGGGCACTGGGGAAGGTGACAGAATACGGGTGACCAGCGGCGAACTGATTGCCGTAGgtggtg > 1:108915/1‑183 (MQ=255) aaGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCg < 1:466936/226‑1 (MQ=255) acacCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTGGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCt < 2:4457/142‑1 (MQ=255) 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CTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTtggtg > 1:657178‑M1/1‑236 (MQ=255) tCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGcc > 2:504696/1‑134 (MQ=255) tCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGAc < 2:896359/195‑1 (MQ=255) tCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGc < 1:889887/236‑1 (MQ=255) tGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCt < 2:1078688/194‑1 (MQ=255) caatgaaaccgccggcaagggcaagttcgacgtcaataccgaaggcggcaTCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCACCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTc < 1:249133‑M2/147‑1 (MQ=255) aatgaaaccgccggcaagggcaagttcgacgtcaataccgaaggcggcaTCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCgg > 1:528742‑M2/50‑208 (MQ=255) aatgaaaccgccggcaagggcaagttcgacgtcaataccgaaggcggcaTCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCgg < 2:528741‑M2/159‑1 (MQ=255) cttgccctggccGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCt < 2:499648/192‑1 (MQ=255) cttgccGGCGGGTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTc < 2:211356/46‑1 (MQ=255) cggcggTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTg < 1:924816/56‑1 (MQ=255) tttCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGAAAATGCTGTAGCCGGTGTCGTTGGTc > 1:932163/1‑236 (MQ=255) tGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCgg < 2:301872/151‑1 (MQ=255) gTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGAAAATGCTGTAGCCGGTGTCGTTGGTCGCCAGgc < 1:650742/235‑1 (MQ=255) gTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAAc < 2:359884/79‑1 (MQ=255) ttGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACGCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGAAAATGCTGTAGCCGGTGTCGTTGGTCGCCAGGCGCAAGGTGTc < 1:448666/236‑1 (MQ=255) caTCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGAAAATGCTGTAGCCGGTGTCGTTGGTCGCCAGgc < 1:824288‑M2/214‑1 (MQ=255) caTCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGAAAATGCTGTAGCCGGTGTCGTTGGTCGCCAGGCGCAAGGTGTCGGACACCTg > 1:477212‑M2/3‑235 (MQ=255) tCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGAAAATGCTGTAGCCGGTGTCGTTGGTCGCCAGGCGCAAGGTGTCGGACACCTGCa < 1:768381/235‑1 (MQ=255) | CCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGCGAGATCATCTTGCCGCCTTCGGTATTGACGTCGAACTTGCCCTTGCCGGCGGTTTCATTGGTGATGTCATTGCCGGCGGCATCCCTCACGCTGTACTCGGTGGCACTGGTGAAGGTGACAGAATACGGCTGACCAGCGGCAAACTGATTGCCGTAGGTGGTGGCCGAGGTCAACAGGCCGCCAGACAGCAATACCTTGCCGTCATCCGGCGACGGTGCTACCAGGCTCGACTGGGTGCGGCTGTTGTTGGTGGCCTGGTCGAAAATGCTGTAGCCGGTGTCGTTGGTCGCCAGGCGCAAGGTGTCGGACACCTGCA > AE015451/4972590‑4973054 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |