New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | = 5170114 | 52 (0.840) | 4 (0.070) | 4/326 | NT | 6.3% | coding (343/1308 nt) | PP_4548 | putative Oxidoreductase |
? | AE015451 | = 5170444 | 70 (1.190) | coding (673/1308 nt) | PP_4548 | putative Oxidoreductase |
CGTGCGTTCGAGGCCGAAGCGCGGCGCCGTGGCATGGGCGATCAGGTGCAATTGCTCGATCGCGCTGCAGTGGCCGAGCATCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAGATCAACCCGCAGGACCTGGCGGTGTACGACTGCCGCTTCGTCCTCGACTACTACCGCCTGACGGC > AE015451/5170216‑5170676 | cgtgcgtTCGAGGCCGAAGCGCGGCGCCGTGGCATGGGCGATCAGGTGCAATTGCTCGATCGCGCTGCAGTGGCCGAGCATCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGgcccgc > 1:481536‑M2/1‑229 (MQ=255) gcgtTCGAGGCCGAAGCGCGGCGCCGTGGCATGGGCGATCAGGTGCAATTGCTCGATCGCGCTGCAGTGGCCGAGCATCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGgcccgcgc < 2:953707‑M2/234‑9 (MQ=255) tCGAGGCCGAAGCGCGGCGCCGTGGCATGGGCGATCAGGTGCAATTGCTCGATCGCGCTGCAGTGGCCGAGCATCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCcggc‑‑‑g > 1:70323/1‑236 (MQ=255) aGGCCGAAGCGCGGCGCCGTGGCATGGGCGATCAGGTGCAATTGCTCGATCGCGCTGCAGTGGCCGAGCATCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGgcccgcgc > 1:934066‑M2/1‑219 (MQ=255) ccGTGGCATGGGCGATCAGGTGCAATTGCTCGATCGCGCTGCAGTGGCCGAGCATCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGcc > 1:1017209/1‑236 (MQ=255) cATGGGCGATCAGGTGCAATTGCTCGATCGCGCTGCAGTGGCCGAGCATCTGCAAAGCCCGCTTGATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTgg < 1:240546/236‑1 (MQ=255) ggTGCAATTGCTCGATCGCGCTGCAGTGGCCGAGCATCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCg > 1:718872/1‑219 (MQ=255) ggTGCAATTGCTCGATCGCGCTGCAGTGGCCGAGCATCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCAGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGAGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCAt > 2:1059767/1‑214 (MQ=255) aaTTGCGCGATCGCGCTGCAGTGGCCGAGCATCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCCCCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACcgc < 2:39650/205‑1 (MQ=255) cTCGATCGCGCTGCAGTGGCCGAGCATCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCACACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACg > 2:613440/1‑221 (MQ=255) gATCGCGCTGCAGTGGCCGAGCATCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCg < 1:650223/235‑1 (MQ=255) aTCGCGCTGCAGTGGCCGAGCATCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGc > 2:235276/1‑214 (MQ=255) aTCGCGCTGCAGTGGCCGAGCATCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGc > 1:1091270/1‑236 (MQ=255) tCGCGCTGCAGTGGCCGAGCATCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGCGGTGGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCg > 1:874988/1‑236 (MQ=255) tCGCGCTGCAGTGGCCGAGCATCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGc > 1:686586/1‑235 (MQ=255) cAGTGGCCGAGCATCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGgcc < 1:1084774‑M2/165‑4 (MQ=255) cAGTGGCCGAGCATCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTa < 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cATCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCCCATGGCCGGGTGGAGGCACGc > 2:851478/1‑198 (MQ=255) tCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCCCATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAGAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAggcg > 2:174135/1‑200 (MQ=255) tCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGtt > 1:527409/1‑207 (MQ=255) aaaGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGt > 2:761893/1‑201 (MQ=255) ccGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGc < 1:398046/235‑1 (MQ=255) gCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTAcc < 2:920853/160‑1 (MQ=255) gCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTc > 1:609390/1‑235 (MQ=255) tttATCTGGTTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCaa < 1:311244/235‑1 (MQ=255) ttATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGACAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGGGGTTACCGCGCATGGCCgg > 2:165187/1‑169 (MQ=255) tATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAggg < 1:87373/236‑1 (MQ=255) aTCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGc < 1:953708/236‑1 (MQ=255) cGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCg > 1:990845/1‑207 (MQ=255) 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tGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAGATCAACCCGCAGGACCTGGCGGTGTACGa > 1:424418/1‑235 (MQ=255) gATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAGATCAAccc < 2:1093750/213‑1 (MQ=255) atatTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGCTGGGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCCGCTCAAGGGCAAGATCGTCCCGGCCCTGGGCGGGATCgg > 2:121250/1‑169 (MQ=255) atatTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAGATCAACCCGCAGGAcc < 1:376598/220‑1 (MQ=255) atTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGc > 2:859188/1‑139 (MQ=255) atTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAGATCAACCCGCAGGACCTGGCGGTGTACGACTGcc < 1:443146/236‑1 (MQ=255) ttCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACCTCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAGATCAACCCGCAGGAcc < 1:164464/217‑1 (MQ=255) ttCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAGATCAACCCGCAGGACCTGGCGGTGTACGACTGcc < 1:602642/235‑1 (MQ=255) tCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAGATCAACCCGCAGGACCTGGCGGTGTACGACTGc > 2:995872/1‑233 (MQ=255) tCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAGATCAACCCGCAGGACCTGGCGGTGTACGACTGCCg > 1:1024640/1‑235 (MQ=255) tCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGGGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGGGAGCTGCCCGAGCAGATCAAcc > 1:244914/1‑207 (MQ=255) tCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGCGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGCGCTTCCCgg > 2:306321/1‑150 (MQ=255) gcGAAAATTGCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATc < 2:89307/107‑1 (MQ=255) cGAAACTTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATc < 2:798407/107‑1 (MQ=255) gAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAGATCAAccc < 1:184082/206‑1 (MQ=255) aaaTTCCGACGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAGATCAACCCGCAGGACCTGGCGGTGTACGACTGCCGCTTCg < 1:138748/236‑1 (MQ=255) aaaTTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAGATCAACCCGCAGGACCTGGCGGTGTACGACTGCCGCTTc > 1:323519/1‑235 (MQ=255) ttCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCGGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCg < 2:193143/89‑1 (MQ=255) ccGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAGATCAACCCGCAGGACCTGGCGGTGTACGACTGCCGCTTCGTCCTc > 1:210606/1‑236 (MQ=255) tGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACcgcg < 2:745307/161‑1 (MQ=255) gTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAGATCAAccc < 2:1084773/182‑1 (MQ=255) ccATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGc > 2:893509/1‑165 (MQ=255) ccATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAg > 1:53007/1‑172 (MQ=255) ccATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAGATCAACCCGCAGGACCTGGCGgtgt > 2:505639/1‑197 (MQ=255) ccATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAGATCAACCCGCAGGACCTGGCGGTGTACGACTGCCGCTTc < 2:1043054/211‑1 (MQ=255) ccATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAGATCAACCCGCAGGACCTGGCGGTGTACGACTGCCGCTTc > 1:1043055/1‑211 (MQ=255) ccATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAGATCAACCCGCAGGACCTGGCGGTGTACGACTGCCGCTTCGTCCTCGACTACTACCGCCTGACg > 1:32323/1‑235 (MQ=255) ccATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGCATCGTCACCACCccgccg > 1:174648/1‑151 (MQ=255) ccATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGCGATGTTGGCCGGCGAtgt > 2:338170/1‑75 (MQ=255) cATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAGATCAACCCGCAGGACCTGGCGGTGTACGACTGCCGCTTCGTCCTCGACTACTACCGCCTGACGGc < 1:235277/236‑1 (MQ=255) | CGTGCGTTCGAGGCCGAAGCGCGGCGCCGTGGCATGGGCGATCAGGTGCAATTGCTCGATCGCGCTGCAGTGGCCGAGCATCTGCAAAGCCCGCTTTATCTGGGTGCGTTGAAGAACCTGCGCAACCTGCACCTGCACCCACTCAACCTGTGCCTGGGCGAAGCCCGTGCCGCACATGGCCTGGGTGCACTGATATTCGAAAATTCCGAAGTGCTGGACATCGTCCATGGCCCGCGCCCGGC‑‑‑GGTGGTTACCGCGCATGGCCGGGTGGAGGCACGCCAGGTGATGTTGGCCGGCGATGTGTATCACAAGCTCGAAAAGCGCCAGCTCAAGGGCAAGATCTTCCCGGCCATGGGCGGTATCGTCACCACCGCGCCGCTGGGTGAGCTGGCCGAGCAGATCAACCCGCAGGACCTGGCGGTGTACGACTGCCGCTTCGTCCTCGACTACTACCGCCTGACGGC > AE015451/5170216‑5170676 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |