| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AE015451 | = 6130112 | 70 (1.130) | 4 (0.070) | 4/326 | NT | 5.6% | coding (321/783 nt) | PP_5378 | putative metal‑binding protein |
| ? | AE015451 | = 6130113 | 68 (1.160) | coding (320/783 nt) | PP_5378 | putative metal‑binding protein | |||||
TCATGGTTGTGCATCTCACTTTCCCCACCACCGTGCTGGTGGCCGCCACTGGTTGTTACCAGGGCCTTGTACTGCTCTGCGTTCATCTGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCGAGGAAAGCATGCACAGCCGGGAAATGAGGGTCATCGGCA > AE015451/6129882‑6130340 | tCATGGTTGTGCATCTCACTTTCCCCACCACCGTGCTGGTGGCCGCCACTGGTTGTTACCAGGGCCTTGTACTGCTCTGCGTTCATCTGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTACTGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGcaa < 1:264982‑M2/235‑4 (MQ=255) aTCTCACTTTCCCCACCACCGTGCTGGTGGCCGCCACTGGTTGTTACCAGGGCCTTGTACTGCTCTGCGTTCATCTGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGt > 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tggtggCCGCCACTGGTTGTTACCAGGGCCTTGTACTGCTCTGCGTTCATCTGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTc > 1:1013223/1‑236 (MQ=255) tggtggCCGCCACTGGTTGTTACCAGGGCCTTGTACTGCTCTGCGTTCATCTGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTc > 1:205897/1‑236 (MQ=255) ggtggCCGCCACTGGTTGTTACCAGGGCCTTGTACTGCTCTGCGTTCATCTGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCg < 1:604814/236‑1 (MQ=255) 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ggTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGAGTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGt < 2:309860/162‑1 (MQ=255) aGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCg < 1:151875/227‑1 (MQ=255) aaCGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCcgcg > 1:570861/1‑217 (MQ=255) aaCGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCGAGGAAAGCa > 2:626710/1‑234 (MQ=255) aaCGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCGAGGAAAGCAta > 2:1045992/1‑235 (MQ=255) aaCGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCGAGGAAAGCAt < 1:38982/235‑1 (MQ=255) aCGCTGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGcaagattggtttaagcgatgaccccgcagctgcgttctggaccattaa > 1:911349‑M2/1‑36 (MQ=255) aGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCGAGGAAAGCATGcaca > 1:245449/1‑235 (MQ=255) tGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTgc < 1:201872/183‑1 (MQ=255) tGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCGAGGAAAGCATGCACAGCCg > 1:761569/1‑236 (MQ=255) tGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGATTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGcgcgca > 2:217812/1‑186 (MQ=255) tGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGAGAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATccag > 1:200702/1‑205 (MQ=255) cTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTAGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGca > 2:522556/1‑95 (MQ=255) cAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCGAGGAAAGCATGCACAGCCGGGAAATGAGGGTCATCGGCa > 1:172054/1‑236 (MQ=255) ttGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCGAGGAAAGCATGCACAGCCGGGAAATg > 2:882681/1‑218 (MQ=255) ttGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGAGAAAGCGCTGGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCGAGGAAAGCAt < 1:11965/202‑1 (MQ=255) tGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTgc > 1:664206/1‑157 (MQ=255) tGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTgc < 2:664205/157‑1 (MQ=255) ggCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTGTCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCg < 2:302284/190‑1 (MQ=255) | TCATGGTTGTGCATCTCACTTTCCCCACCACCGTGCTGGTGGCCGCCACTGGTTGTTACCAGGGCCTTGTACTGCTCTGCGTTCATCTGCGGCATTTGCTCAAGGAAAGCGACAATACCCCAGATGTACTGATCACCCATGCTCTTGCCCCAAGCGGGCATACCGGTAGCCTTGATACCGTGTTTAATGGTCCAGAACGCAGCTGCGGGGTCATCGCTTAAACCAATCTTGGCAAGATTGGGCGGTGCCGGATAAAGCGCTTGGCTGAGCTCGGTTTTATCCACCCCTGGGGCGAGGTGGCAGCCAATGCACATAGCATTGTAGTTACCGGCACCGGCACGGATAAGGGTTTCATCCTTTAGGTTCGGAACCTCGATGTCCCGTGCGCGAACTTCAATAGAGCGATCCCGCGCCATGGCGAGGAAAGCATGCACAGCCGGGAAATGAGGGTCATCGGCA > AE015451/6129882‑6130340 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |